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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G476670
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 121647581-121648564 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

984 bp · TkA02G476670|TK1151|cDNA

ATGTCAACCAAATCTCGACTCCAAAACCACACCCCCATGGTTGAGGAGATCACCGGTTTGATCCGGGTTCACAAAGACGGCTATGTTGAAAGACCACCGGTTGTACCTCATGCTTCTTGCATGGTACCATCGGAGCTCAGGGTTGTAGCCACCGATGTCACCATAGATAAATATACTAACTTATGGGCACGTGTCTATACCCCTAGCAACCGACACTATTTTTCATCAAAAGTATTGCCGGTGGTAGTTTACTTTCATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

984 bp · TkA02G476670|TK1151|CDS

ATGTCAACCAAATCTCGACTCCAAAACCACACCCCCATGGTTGAGGAGATCACCGGTTTGATCCGGGTTCACAAAGACGGCTATGTTGAAAGACCACCGGTTGTACCTCATGCTTCTTGCATGGTACCATCGGAGCTCAGGGTTGTAGCCACCGATGTCACCATAGATAAATATACTAACTTATGGGCACGTGTCTATACCCCTAGCAACCGACACTATTTTTCATCAAAAGTATTGCCGGTGGTAGTTTACTTTCATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

327 aa · TkA02G476670|TK1151|PROTEIN

MSTKSRLQNHTPMVEEITGLIRVHKDGYVERPPVVPHASCMVPSELRVVATDVTIDKYTNLWARVYTPSNRHYFSSKVLPVVVYFHGGGFCVGSASWVCYHDFLANLARVACCVIVSVNYRLAPENRLPAAYDDGVNAVFWLKQECLNGTVKELKWCDLSRLYIAGDSAGANIAHHVAKRLVSNPVLSPKGVVLIQPFFGAESRTVSEKQSVQTTSSGLTLSASDTYWRLALPVGATRDHPWCNLFAKDAPRLSDSRLFK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G476670
TK1151 IDTkA02G476670
OH-1004 IDLXL04_013713
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.612
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G476670
位置Chr02:121647581-121648564 (+)
描述Similar to CXE17: Probable carboxylesterase 17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g16080 对不同脂肪酸链长度的酯类发挥作用的羧基酯酶。 暂无已核实直接文献
At1g68620 对不同脂肪酸链长度的酯类发挥作用的羧基酯酶。 暂无已核实直接文献
At5g06570 可能结合独脚金内酯并催化其水解。
Catabolism of strigolactones by a carboxylesterase.2021 · DOI: 10.1038/s41477-021-01011-y
Structural insights into strigolactone catabolism by carboxylesterases reveal a conserved conformational regulation.2024 · DOI: 10.1038/s41467-024-50928-3
At5g27320 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013713 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程
GO:0048530 fruit morphogenesis 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0010331 gibberellin binding 分子功能
GO:0016787 hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68620
ath:AT5G16080
ath:AT5G23530
ath:AT5G27320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.744
排名 1 · TkA02G476670 · TK1151
细胞核0.369
排名 2 · TkA02G476670 · TK1151
细胞膜0.051
排名 3 · TkA02G476670 · TK1151
过氧化物酶体0.050
排名 4 · TkA02G476670 · TK1151
线粒体0.050
排名 5 · TkA02G476670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10340Say1_Mug18062-215 aa
PF00135COesterase63-123 aa
PF20434BD-FAE76-176 aa
PF07224Chlorophyllase79-207 aa
PF07859Abhydrolase_382-302 aa
PF00326Peptidase_S9152-175 aa
PF00135COesterase161-176 aa
PF00975Thioesterase162-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G476670PF10340Say1_Mug180622155.8e-0729.4
TkA02G476670PF00135COesterase631231.6e-1041.3
TkA02G476670PF20434BD-FAE761768.5e-1142.5
TkA02G476670PF07224Chlorophyllase792070.001518.2
TkA02G476670PF07859Abhydrolase_3823027.7e-60203.0
TkA02G476670PF00326Peptidase_S91521750.1212.6
TkA02G476670PF00135COesterase1611761.6e-1041.3
TkA02G476670PF00975Thioesterase1621960.1812.7
TkA02G476670PF01738DLH1892070.1412.5
TkA02G476670PF18059Csd3_N2553030.3412.1
TkA02G476670PF01738DLH2723070.1412.5
TkA02G476670PF00326Peptidase_S92743070.1212.6
TkA02G476670PF00975Thioesterase2773020.1812.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFR7拟南芥sp|Q9LFR7|CXE17_ARATH Probable carboxylesterase 1754.600%Swiss-Prot高置信
Q9SX25拟南芥sp|Q9SX25|CXE6_ARATH Probable carboxylesterase 648.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FG13拟南芥sp|Q9FG13|CXE15_ARATH Strigolactones hydrolase CXE1537.200%Swiss-Prot中等置信
Q940G6拟南芥sp|Q940G6|GID1C_ARATH Gibberellin receptor GID1C35.200%Swiss-Prot中等置信

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