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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G458140
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 116727679-116734683 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2406 bp · TkA02G458140|TK1151|cDNA

ATAGGCTATGTTTTAAAAACCAACTATATTTATAATATTAAAAAAAATTACATACAAACTCGGTGCCATGTTACTTTTTTGACCACAAGATCCGGGTTTCCCCTCGATCTCTTCTTTTCTTTTCATCTTTTTCAGAATTACCTCCAGCTTACGGCGGTGACGGTGGATGATGTCTCTCTTGATGGCGTTTCTTGTGTTCTTTCTAATTAAACCAGGAGAATCACAGACAAACATTAGCGACAACAATATTAACACACCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1998 bp · TkA02G458140|TK1151|CDS

ATGATGTCTCTCTTGATGGCGTTTCTTGTGTTCTTTCTAATTAAACCAGGAGAATCACAGACAAACATTAGCGACAACAATATTAACACACCAATCAGATCATTCTGTGGTCGTAACCCTCCTATAATTCTATCAAACTTTATCCAAAACCGTAATTCTACACTGGGTGAGATCAGAAGACAACTATCGAGCAACGGTGTATTTTATGCCACAGCACAGAGTTTGGCGGAAGGAGACTCGGTTTTTGGAGCTGCCCTTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

665 aa · TkA02G458140|TK1151|PROTEIN

MMSLLMAFLVFFLIKPGESQTNISDNNINTPIRSFCGRNPPIILSNFIQNRNSTLGEIRRQLSSNGVFYATAQSLAEGDSVFGAALCRNYLTIAQCVACFDVGVSQLISCVTGNGAYVFLDNCFLRYENYNNFYTDPNVVEDVGIAPLQLCGNQSASESTSFTQAVDGLLSDIKDATPKTSNFYVASTTQITNGNGTVYAIAQCVENTTQTICRNCINAAYRDLSNCLPSTEGRSIYMGCFARYSETPFFSDNQTIDITN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G458140
TK1151 IDTkA02G458140
OH-1004 IDLXL04_013986
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G458140
位置Chr02:116727679-116734683 (+)
描述Similar to CRK2: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g70520 富半胱氨酸受体样蛋白激酶2。 暂无已核实直接文献
At5g40380 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 42。 暂无已核实直接文献
At4g23230 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶15。 暂无已核实直接文献
At1g19090 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶1。 暂无已核实直接文献
At4g11490 假定的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 33。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013986 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0052545 callose localization 生物过程
GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19090
ath:AT1G70520
ath:AT1G70530
ath:AT4G23230
ath:AT5G40380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.879
排名 1 · TkA02G458140 · TK1151
内质网0.073
排名 2 · TkA02G458140 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA02G458140 · TK1151
细胞核0.038
排名 4 · TkA02G458140 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA02G458140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01034Syndecan4-13 aa
PF01657Stress-antifung45-130 aa
PF15330SIT58-78 aa
PF02207zf-UBR76-102 aa
PF01657Stress-antifung151-246 aa
PF02207zf-UBR193-219 aa
PF04478Mid2258-318 aa
PF01034Syndecan272-298 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G458140PF01034Syndecan4131.010.1
TkA02G458140PF01657Stress-antifung451301e-2694.2
TkA02G458140PF15330SIT58780.1213.6
TkA02G458140PF02207zf-UBR761026.07.7
TkA02G458140PF01657Stress-antifung1512461e-2694.2
TkA02G458140PF02207zf-UBR1932196.07.7
TkA02G458140PF04478Mid22583180.08113.4
TkA02G458140PF01034Syndecan2722981.010.1
TkA02G458140PF15330SIT2753080.1213.6
TkA02G458140PF00069Pkinase3275941.8e-47162.7
TkA02G458140PF12330Haspin_kinase3283690.05213.3
TkA02G458140PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3295961.6e-47162.7
TkA02G458140PF03109ABC13313700.0214.7
TkA02G458140PF14894Lsm_C3443550.004617.4
TkA02G458140PF01034Syndecan3543681.010.1
TkA02G458140PF12330Haspin_kinase4214760.05213.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAL3拟南芥sp|Q9CAL3|CRK2_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 237.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FNE1拟南芥sp|Q9FNE1|CRK42_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4235.500%Swiss-Prot中等置信
Q8W4G6拟南芥sp|Q8W4G6|CRK15_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1532.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LMB9拟南芥sp|Q9LMB9|CRK1_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 136.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LDN1拟南芥sp|Q9LDN1|CRK33_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 3333.500%Swiss-Prot中等置信

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