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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G448890
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 114182022-114185176 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1160 bp · TkA02G448890|TK1151|cDNA

CTCAATCATATTTTTAAATCATTATCTAAGTCATTATCCCTTTAAATCAACATGTTTTGATTATTCAAAGTTCAAACACCACTAAACCCTCAGGTTCTCGAAAGCCCTCTTTCGTTATTAGGGTTTAAGGGAAACAAAAAGAACACTTATCCTTCTCTGTAACTCGCCATGGGTCAAGATGCTTCGGATGCTCTTGCAGTGAGGCAGAAAGTTCAACAATTTCTGAATGCCGCTGTCGAGGGAAATCTAGACTTTTTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1386 bp · TkA02G448890|TK1151|CDS

ATGGGTCAAGATGCTTCGGATGCTCTTGCAGTGAGGCAGAAAGTTCAACAATTTCTGAATGCCGCTGTCGAGGGAAATCTAGACTTTTTGAAGAGTGTAGCCGCACAGTTAGATGATGGCAAAGGACTATCGCACACAGTGGCAAATATCAAGGATGCAAATAAACGAGGAGCTCTTCATTTTGCTGCAAGACAAGGTCAGACTGAAGTCTGCAAGTACTTATTGGAGGAATTGAAGCTTGATGTGAATGCTAAAGACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

461 aa · TkA02G448890|TK1151|PROTEIN

MGQDASDALAVRQKVQQFLNAAVEGNLDFLKSVAAQLDDGKGLSHTVANIKDANKRGALHFAARQGQTEVCKYLLEELKLDVNAKDEDGETPLIHAARQSHTSTAKYLIEHGANPALASELGATALHHVAGTGDIELMEALLSTGVEVDSQSDAGTPLVWASGHGQQDALKLLLKHKADPNIETDDGITPLLSAVAAGSLPCLELLIQAGGKVNITAGGATPLHVAADIGNSELITCLLKSGADPNAIDEEGWKPVQVAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G448890
TK1151 IDTkA02G448890
OH-1004 IDLXL04_014175
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G448890
位置Chr02:114182022-114185176 (-)
描述Similar to Ank3: Ankyrin-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014175 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0007009 plasma membrane organization 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010650 positive regulation of cell communication by electrical coupling 生物过程
GO:0010765 positive regulation of sodium ion transport 生物过程
GO:0010960 magnesium ion homeostasis 生物过程
GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
GO:0032507 maintenance of protein location in cell 生物过程
GO:0034112 positive regulation of homotypic cell-cell adhesion 生物过程
GO:0043001 Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
mmu:11735
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.636
排名 1 · TkA02G448890 · TK1151
细胞核0.387
排名 2 · TkA02G448890 · TK1151
线粒体0.075
排名 3 · TkA02G448890 · TK1151
细胞膜0.066
排名 4 · TkA02G448890 · TK1151
高尔基体0.055
排名 5 · TkA02G448890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_221-115 aa
PF13637Ank_421-75 aa
PF24521Ank_KRIT139-111 aa
PF23745ANK_LRRK250-84 aa
PF13606Ank_356-84 aa
PF13857Ank_556-96 aa
PF00023Ank58-86 aa
PF13637Ank_459-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G448890PF12796Ank_2211153.8e-44149.9
TkA02G448890PF13637Ank_421755.1e-40135.3
TkA02G448890PF24521Ank_KRIT1391111.9e-1144.6
TkA02G448890PF23745ANK_LRRK250840.000520.7
TkA02G448890PF13606Ank_356843.4e-33110.2
TkA02G448890PF13857Ank_556968.8e-2690.4
TkA02G448890PF00023Ank58862.3e-41138.1
TkA02G448890PF13637Ank_4591095.1e-40135.3
TkA02G448890PF24407HTH_upst_double_PIN871060.1113.5
TkA02G448890PF00023Ank881162.3e-41138.1
TkA02G448890PF13606Ank_3881153.4e-33110.2
TkA02G448890PF13637Ank_4941425.1e-40135.3
TkA02G448890PF13857Ank_51081428.8e-2690.4
TkA02G448890PF23745ANK_LRRK21161560.000520.7
TkA02G448890PF24521Ank_KRIT11192091.9e-1144.6
TkA02G448890PF12796Ank_21211833.8e-44149.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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