基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_014175
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 43230184-43232940
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1488 bp · LXL04_014175|LXL04_014175|OH1004|cDNA
ATGGGTCAAGATGCTTCGGATGCTCTTGCAGTGAGGCAGAAAGTTCAACAATTTCTGAATGCCGCTGTCGAGGGAAATCTAGACTTTTTGAAGAGTGTAGCCGCACAGTTAGATGATGGCAAAGGACTATCGCACACAGTGGCAAATATCAAGGATGCAAATAAACGAGGAGCTCTTCATTTTGCTGCAAGACAAGGTCAGACTGAAGTCTGCAAGTACTTGTTGGAGGAATTGAAGCTTGATGTGAATGCTAAAGACGA...
CDS
下载 CDS FASTA1488 bp · LXL04_014175|LXL04_014175|OH1004|CDS
ATGGGTCAAGATGCTTCGGATGCTCTTGCAGTGAGGCAGAAAGTTCAACAATTTCTGAATGCCGCTGTCGAGGGAAATCTAGACTTTTTGAAGAGTGTAGCCGCACAGTTAGATGATGGCAAAGGACTATCGCACACAGTGGCAAATATCAAGGATGCAAATAAACGAGGAGCTCTTCATTTTGCTGCAAGACAAGGTCAGACTGAAGTCTGCAAGTACTTGTTGGAGGAATTGAAGCTTGATGTGAATGCTAAAGACGA...
495 aa · LXL04_014175|LXL04_014175|OH1004|PROTEIN
MGQDASDALAVRQKVQQFLNAAVEGNLDFLKSVAAQLDDGKGLSHTVANIKDANKRGALHFAARQGQTEVCKYLLEELKLDVNAKDEDGNFFCYLNTSKVLQHMIYDLVSDSLNCCIVSGETPLIHAARQSHTSTAKYLIEHGANPALASELGATALHHVAGTGDFELMEALLSTGVEVDSQSDAGTPLVWASGHGQQDALKLLLKHKADPNIETDDGITPLLSAVAAGSLPCLELLIQAGGKVNITAGGATPLHVAADI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_014175 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_014175 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:43230184-43232940 (+) |
| 描述 | Similar to Ank3: Ankyrin-3 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程 GO:0007009 plasma membrane organization 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程 GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程 GO:0010650 positive regulation of cell communication by electrical coupling 生物过程 GO:0010765 positive regulation of sodium ion transport 生物过程 GO:0010960 magnesium ion homeostasis 生物过程 GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程 GO:0032507 maintenance of protein location in cell 生物过程 GO:0034112 positive regulation of homotypic cell-cell adhesion 生物过程 GO:0043001 Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | mmu:11735 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.575
细胞核0.372
线粒体0.100
细胞膜0.068
过氧化物酶体0.058
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12796.14Ank_221-86 aaPF13637.13Ank_421-75 aaPF00023.37Ank58-86 aaPF12796.14Ank_2100-182 aaPF00023.37Ank120-147 aaPF13637.13Ank_4125-173 aaPF24521.3Ank_KRIT1150-240 aaPF12796.14Ank_2164-247 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_014175 | PF12796.14 | Ank_2 | 21 | 86 | 4.3e-42 | 143.3 |
| LXL04_014175 | PF13637.13 | Ank_4 | 21 | 75 | 1.8e-35 | 120.9 |
| LXL04_014175 | PF00023.37 | Ank | 58 | 86 | 1e-40 | 136.1 |
| LXL04_014175 | PF12796.14 | Ank_2 | 100 | 182 | 4.3e-42 | 143.3 |
| LXL04_014175 | PF00023.37 | Ank | 120 | 147 | 1e-40 | 136.1 |
| LXL04_014175 | PF13637.13 | Ank_4 | 125 | 173 | 1.8e-35 | 120.9 |
| LXL04_014175 | PF24521.3 | Ank_KRIT1 | 150 | 240 | 8.8e-10 | 39.2 |
| LXL04_014175 | PF12796.14 | Ank_2 | 164 | 247 | 4.3e-42 | 143.3 |
| LXL04_014175 | PF00023.37 | Ank | 187 | 215 | 1e-40 | 136.1 |
| LXL04_014175 | PF13637.13 | Ank_4 | 189 | 238 | 1.8e-35 | 120.9 |
| LXL04_014175 | PF13857.13 | Ank_5 | 237 | 290 | 3.4e-25 | 88.5 |
| LXL04_014175 | PF12796.14 | Ank_2 | 249 | 304 | 4.3e-42 | 143.3 |
| LXL04_014175 | PF00023.37 | Ank | 250 | 280 | 1e-40 | 136.1 |
| LXL04_014175 | PF13606.13 | Ank_3 | 250 | 278 | 1.1e-32 | 108.7 |
| LXL04_014175 | PF13637.13 | Ank_4 | 254 | 303 | 1.8e-35 | 120.9 |
| LXL04_014175 | PF25575.1 | TPR_BSK1_C | 359 | 437 | 1.8e-13 | 51.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
没有找到该查询的结果。