TkA02G392060 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G392060

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 99640431-99641631 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

852 bp · TkA02G392060|TK1151|cDNA

ATGAAGACAGAAGGAGAAGATGCTCCTGTCCCCTCTTCATGTAATTATTTTACCAGAAATTTTATTCCGCACCGCAAAGCATACCGTCCATATTTTGTCAGACTCGCGATTCTATCTCAAGTCAACCACAAGAATCTTGTTCAACTTTTGGGTTGTTGTATTGAAGCTGAACAGCCATTGATGATCTACGAGTTCATTTCAAGGGGTACCCTTTATCATCACTTACATAACGAGCCCTCCAACTTTTTAAATTGGCAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

852 bp · TkA02G392060|TK1151|CDS

ATGAAGACAGAAGGAGAAGATGCTCCTGTCCCCTCTTCATGTAATTATTTTACCAGAAATTTTATTCCGCACCGCAAAGCATACCGTCCATATTTTGTCAGACTCGCGATTCTATCTCAAGTCAACCACAAGAATCTTGTTCAACTTTTGGGTTGTTGTATTGAAGCTGAACAGCCATTGATGATCTACGAGTTCATTTCAAGGGGTACCCTTTATCATCACTTACATAACGAGCCCTCCAACTTTTTAAATTGGCAATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

283 aa · TkA02G392060|TK1151|PROTEIN

MKTEGEDAPVPSSCNYFTRNFIPHRKAYRPYFVRLAILSQVNHKNLVQLLGCCIEAEQPLMIYEFISRGTLYHHLHNEPSNFLNWQLRVKICLQTAEALAYLHNSAHTPIYHRDIKSTNILLDDEFNAKVSDFGLSRLARPGLSHVSTCAQGTLGYLDPEYYRNYQLTDKSDVYSFGVVLLEVLTTKKAIDFERGEEDVNLAVYVAQRATSVMEVVDRRLVGEDPPDQMVVSVIMFCKLALTCLRAKKGERPNMKEVVQE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G392060`
TK1151 ID	TkA02G392060
OH-1004 ID	LXL04_014850
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 87.986 / OH-1004 39.904 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G392060

位置 Chr02:99640431-99641631 (+)

描述 Similar to WAKL20: Wall-associated receptor kinase-like 20

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g02070`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。	暂无已核实直接文献
`At3g53840`	推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能作为细胞外基质组分的信号受体。	暂无已核实直接文献
`At1g69730`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。	暂无已核实直接文献
`At5g66790`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。	暂无已核实直接文献
`At2g23450`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014850 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程

GO:0009603 detection of symbiotic fungus 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0034052 positive regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0048527 lateral root development 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009897 external side of plasma membrane 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G21210

ath:AT1G69730

ath:AT3G53840

ath:AT5G02070

zma:103645992

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.471

排名 1 · TkA02G392060 · TK1151

细胞质0.393

排名 2 · TkA02G392060 · TK1151

细胞核0.198

排名 3 · TkA02G392060 · TK1151

高尔基体0.066

排名 4 · TkA02G392060 · TK1151

内质网0.064

排名 5 · TkA02G392060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr35-261 aa

PF00069Pkinase35-259 aa

PF12330Haspin_kinase57-139 aa

PF03617IBV_3A66-75 aa

PF14531Kinase-like86-183 aa

PF25793WHD_2nd_NFRKB207-278 aa

PF03617IBV_3A227-270 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G392060	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	35	261	3e-39	135.6
TkA02G392060	`PF00069`	Pkinase	35	259	4.8e-34	118.7
TkA02G392060	`PF12330`	Haspin_kinase	57	139	0.022	14.5
TkA02G392060	`PF03617`	IBV_3A	66	75	0.41	11.4
TkA02G392060	`PF14531`	Kinase-like	86	183	0.0042	17.1
TkA02G392060	`PF25793`	WHD_2nd_NFRKB	207	278	0.23	12.2
TkA02G392060	`PF03617`	IBV_3A	227	270	0.41	11.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LZM4`	拟南芥	sp\|Q9LZM4\|WAKLQ_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 20	54.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9M342`	拟南芥	sp\|Q9M342\|WAKLP_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 15	52.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C9L5`	拟南芥	sp\|Q9C9L5\|WAKLH_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 9	47.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8GYF5`	拟南芥	sp\|Q8GYF5\|WAKLR_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 21	50.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q8RY67`	拟南芥	sp\|Q8RY67\|WAKLO_ARATH Wall-associated receptor kinase-like 14	48.700%	Swiss-Prot	中等置信

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