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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G379060
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 96348526-96351346 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2249 bp · TkA02G379060|TK1151|cDNA

ATCGTAGGATGTGTGTTGAACTTCACATCACTACCCTACCAACCAAACGGAGACTGCATAGACAGTGAACAGAAGCTCAAAATCAAAGCATGGGGAATTCTCCCAACAACCCTCTGTTGCCAATCCCCTCTAATCCTAATCTCCAAATCCCTCGCTCGATTATCCTCCAATTCATCAACCCCCTCAATCTTTCCCCCTTCCAATCAATGGTCACACTGTAACGACCCTTCAATCTTCAAATCCCAACATGATTCCGTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1740 bp · TkA02G379060|TK1151|CDS

ATCGTAGGATGTGTGTTGAACTTCACATCACTACCCTACCAACCAAACGGAGACTGCATAGACAGTGAACAGAAGCTCAAAATCAAAGCATGGGGAATTCTCCCAACAACCCTCTGTTGCCAATCCCCTCTAATCCTAATCTCCAAATCCCTCGCTCGATTATCCTCCAATTCATCAACCCCCTCAATCTTTCCCCCTTCCAATCAATGGTCACACTGTAACGACCCTTCAATCTTCAAATCCCAACATGATTCCGTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

579 aa · TkA02G379060|TK1151|PROTEIN

IVGCVLNFTSLPYQPNGDCIDSEQKLKIKAWGILPTTLCCQSPLILISKSLARLSSNSSTPSIFPPSNQWSHCNDPSIFKSQHDSVNFDDCNFKNFFKEAMLCSGLSVADLKKDQTFNDASATCGQFEQSNAPFDDICRNCSRAVLKARDSVAKGLGVSGNQTEVEICGIAVVTGLASLKWNDSSLAAVDDVYGCLRILDVHDPGYIKLKHSIFQTLLGVVLASMGLMLVIMLVKYVTRKKQQENKSSQFHTKEIPTAWS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G379060
TK1151 IDTkA02G379060
OH-1004 IDLXL04_024114
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)36.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 76.684 / OH-1004 76.736
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G379060
位置Chr02:96348526-96351346 (+)
描述Similar to NORK: Nodulation receptor kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49770 可能的富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At5g49770。 暂无已核实直接文献
At1g68690 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g49760 富含亮氨酸的重复受体蛋白激酶，充当细胞外过氧化氢的传感器。
Hydrogen peroxide sensor HPCA1 is an LRR receptor kinase in Arabidopsis.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2032-3
At2g42960 可能的受体样蛋白激酶 At2g42960。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024114 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42960
ath:AT5G18500
mtr:11407326
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · TkA02G379060 · TK1151
细胞质0.085
排名 2 · TkA02G379060 · TK1151
内质网0.078
排名 3 · TkA02G379060 · TK1151
细胞核0.056
排名 4 · TkA02G379060 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA02G379060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00899ThiF34-254 aa
PF12330Haspin_kinase80-112 aa
PF22870YibX83-99 aa
PF22870YibX126-152 aa
PF02790COX2_TM208-259 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr209-242 aa
PF00069Pkinase224-254 aa
PF26599MntS227-247 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G379060PF00899ThiF342540.08912.7
TkA02G379060PF12330Haspin_kinase801120.1611.6
TkA02G379060PF22870YibX83990.4711.5
TkA02G379060PF22870YibX1261520.4711.5
TkA02G379060PF02790COX2_TM2082590.1213.3
TkA02G379060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2092425.6e-43147.8
TkA02G379060PF00069Pkinase2242544.3e-45154.9
TkA02G379060PF26599MntS2272470.02514.8
TkA02G379060PF00069Pkinase2795354.3e-45154.9
TkA02G379060PF03109ABC12793071.8e-0524.7
TkA02G379060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2804715.6e-43147.8
TkA02G379060PF22870YibX3313550.4711.5
TkA02G379060PF03109ABC13424331.8e-0524.7
TkA02G379060PF17667Pkinase_fungal3744603e-0523.7
TkA02G379060PF12330Haspin_kinase3954330.1611.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LT96拟南芥sp|Q9LT96|Y5977_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4977038.500%Swiss-Prot低置信
Q9SX31拟南芥sp|Q9SX31|PERK9_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK939.000%Swiss-Prot低置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR239.200%Swiss-Prot低置信
Q8GZ99拟南芥sp|Q8GZ99|HPCA1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA135.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SJG2拟南芥sp|Q9SJG2|Y2296_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g4296038.200%Swiss-Prot低置信

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