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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G342630
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 87010597-87013053 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1931 bp · TkA02G342630|TK1151|cDNA

CACGTCACCGCCTCTCTCTTAAAGCATACACGGTCATCCAAGTCGCCATTTACGGCCATGGACTTCATCAGATGACTGCTGCAATCTGATTTCTTCTCCCTTTTGATTTCGTTCTCCACAATCTCTAGCTAGGGTTTAAGCTTTCTCTCTCTTAGGGTTTACCCACAGTAATGTCTACTCACGGCAGCAGCTACAGCTGCAACAATGCCTTCAGAAAAGGTGACGCGGTCGAGGTCCTTAGAAATGCCGACGACGGTGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1455 bp · TkA02G342630|TK1151|CDS

ATGTCTACTCACGGCAGCAGCTACAGCTGCAACAATGCCTTCAGAAAAGGTGACGCGGTCGAGGTCCTTAGAAATGCCGACGACGGTGACGTTCCGGTCTGGTTTCCAGCAACTGTAATGGACTCTCCATCTTCTGAAGGGACTTTACATGTCAAGTTCACCACCTTATACATGGAAAGGTACGATAAGGATGGAAGGAAGAAGAGAAAGAAAATCAGGGATTACGTCCACATAACCGACAAAGTTAGGAGGCCGGATCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

484 aa · TkA02G342630|TK1151|PROTEIN

MSTHGSSYSCNNAFRKGDAVEVLRNADDGDVPVWFPATVMDSPSSEGTLHVKFTTLYMERYDKDGRKKRKKIRDYVHITDKVRRPDLQAEPHRCFVVGEEVETFHENEWRRGKVKQVLENSMYKVVIGGAVEVAVEKSRVRVYPDGSSFPVAPQQEESSRQVLPSQKRAKLRIICKSRTSTTDPFPYGTPVEVRSYEEGYQGSWYTAIVVKSLDETKIMVQYETLKTDDEMQPLVETADVSNTRPLPPKLHQMDRYKMLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G342630
TK1151 IDTkA02G342630
OH-1004 IDLXL04_015364
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.554 / OH-1004 93.164
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G342630
位置Chr02:87010597-87013053 (+)
描述Similar to AGDP1: Protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g09320 异染色质结合蛋白，优先结合长转座子并特异识别组蛋白H3的'赖氨酸-9'甲基化(H3K9me)标记，对二甲基化H3K9(H3K9me2)有更强亲和力。
Arabidopsis AGDP1 links H3K9me2 to DNA methylation in heterochromatin.2018 · DOI: 10.1038/s41467-018-06965-w
Plant HP1 protein ADCP1 links multivalent H3K9 methylation readout to heterochromatin formation.2019 · DOI: 10.1038/s41422-018-0104-9

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015364 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0000792 heterochromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0042393 histone binding 分子功能
GO:0140566 histone reader activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09320
ath:AT2G47230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.855
排名 1 · TkA02G342630 · TK1151
细胞质0.205
排名 2 · TkA02G342630 · TK1151
细胞膜0.040
排名 3 · TkA02G342630 · TK1151
内质网0.031
排名 4 · TkA02G342630 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA02G342630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07238PilZ1-56 aa
PF15057DUF453711-54 aa
PF23327Chromo_MORC2_6th16-73 aa
PF05641Agenet17-62 aa
PF23327Chromo_MORC2_6th97-120 aa
PF05641Agenet98-141 aa
PF22987Tudor_KDM3B101-122 aa
PF00567TUDOR105-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G342630PF07238PilZ1560.02515.6
TkA02G342630PF15057DUF453711540.05214.3
TkA02G342630PF23327Chromo_MORC2_6th16730.009716.3
TkA02G342630PF05641Agenet17622.3e-43147.2
TkA02G342630PF23327Chromo_MORC2_6th971200.009716.3
TkA02G342630PF05641Agenet981412.3e-43147.2
TkA02G342630PF22987Tudor_KDM3B1011220.4611.0
TkA02G342630PF00567TUDOR1051270.1612.7
TkA02G342630PF10808DUF25421081240.07514.2
TkA02G342630PF15057DUF45371111380.05214.3
TkA02G342630PF10808DUF25421231430.07514.2
TkA02G342630PF22987Tudor_KDM3B1381430.4611.0
TkA02G342630PF07238PilZ1802290.02515.6
TkA02G342630PF05641Agenet1882482.3e-43147.2
TkA02G342630PF23327Chromo_MORC2_6th1882140.009716.3
TkA02G342630PF15057DUF45371902280.05214.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q500V5拟南芥sp|Q500V5|AGDP1_ARATH Protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P130.100%Swiss-Prot中等置信

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