TkA02G305740 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G305740

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 77835926-77838459 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

348 bp · TkA02G305740|TK1151|cDNA

ATGATCCTTAGGTTTAACCCCGTTAAGCAAATGTCGTTACTGCTATCACCTGCCCTTCAAGTCAAGTTAGGGTTTATACGTTCTGTATTGGATGAACACTCTCACTGTTTAAGATGGCATGCAGTGGGGTCATGGACATGGGATGCTCATGATGAGACATGTGGGATATGTCGGATGGCGTTTGATGGTTGTTGTCCTGATTGTAAACTACCTGGTGATGATTGCCCACTAATTTGGGGTGCTTGCAATCATGCTTTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

348 bp · TkA02G305740|TK1151|CDS

ATGATCCTTAGGTTTAACCCCGTTAAGCAAATGTCGTTACTGCTATCACCTGCCCTTCAAGTCAAGTTAGGGTTTATACGTTCTGTATTGGATGAACACTCTCACTGTTTAAGATGGCATGCAGTGGGGTCATGGACATGGGATGCTCATGATGAGACATGTGGGATATGTCGGATGGCGTTTGATGGTTGTTGTCCTGATTGTAAACTACCTGGTGATGATTGCCCACTAATTTGGGGTGCTTGCAATCATGCTTTCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

115 aa · TkA02G305740|TK1151|PROTEIN

MILRFNPVKQMSLLLSPALQVKLGFIRSVLDEHSHCLRWHAVGSWTWDAHDETCGICRMAFDGCCPDCKLPGDDCPLIWGACNHAFHLHCILKWVNSQTPQAHCPMCRREWQFKE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G305740`
TK1151 ID	TkA02G305740
OH-1004 ID	LXL04_015659
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 67.826 / OH-1004 72.897 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G305740

位置 Chr02:77835926-77838459 (-)

描述 Similar to APC11: Anaphase-promoting complex subunit 11

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g05870`	后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015659 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0007346 regulation of mitotic cell cycle 生物过程

GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程

GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程

GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0045842 positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0051445 regulation of meiotic cell cycle 生物过程

GO:0070936 protein K48-linked ubiquitination 生物过程

GO:0070979 protein K11-linked ubiquitination 生物过程

GO:0141198 protein branched polyubiquitination 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G05870

bta:616275

hsa:51529

mmu:66156

pon:100173127

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.451

排名 1 · TkA02G305740 · TK1151

细胞核0.404

排名 2 · TkA02G305740 · TK1151

内质网0.099

排名 3 · TkA02G305740 · TK1151

高尔基体0.095

排名 4 · TkA02G305740 · TK1151

线粒体0.095

排名 5 · TkA02G305740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13923zf-C3HC4_229-36 aa

PF12861zf-ANAPC1132-45 aa

PF15227zf-C3HC4_432-57 aa

PF12678zf-rbx133-38 aa

PF23413zf_RING_Vps8_fungal33-38 aa

PF13639zf-RING_234-58 aa

PF13445zf-RING_UBOX34-40 aa

PF14634zf-RING_550-58 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G305740	`PF13923`	zf-C3HC4_2	29	36	0.035	14.6
TkA02G305740	`PF12861`	zf-ANAPC11	32	45	2.3e-34	117.9
TkA02G305740	`PF15227`	zf-C3HC4_4	32	57	0.089	13.6
TkA02G305740	`PF12678`	zf-rbx1	33	38	1.4e-21	77.2
TkA02G305740	`PF23413`	zf_RING_Vps8_fungal	33	38	0.034	14.1
TkA02G305740	`PF13639`	zf-RING_2	34	58	0.0039	18.1
TkA02G305740	`PF13445`	zf-RING_UBOX	34	40	0.72	10.6
TkA02G305740	`PF14634`	zf-RING_5	50	58	4.6	8.0
TkA02G305740	`PF12861`	zf-ANAPC11	51	115	2.3e-34	117.9
TkA02G305740	`PF12678`	zf-rbx1	52	108	1.4e-21	77.2
TkA02G305740	`PF13639`	zf-RING_2	53	108	0.0039	18.1
TkA02G305740	`PF23413`	zf_RING_Vps8_fungal	53	58	0.034	14.1
TkA02G305740	`PF13923`	zf-C3HC4_2	53	68	0.035	14.6
TkA02G305740	`PF25491`	CCHC_BCL-11A	53	61	0.11	13.3
TkA02G305740	`PF29452`	FAR1_N	53	58	3.2	8.6
TkA02G305740	`PF13445`	zf-RING_UBOX	54	105	0.72	10.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M9L0`	拟南芥	sp\|Q9M9L0\|APC11_ARATH Anaphase-promoting complex subunit 11	94.900%	Swiss-Prot	中等置信

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