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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G241940
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 62161510-62164434 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1969 bp · TkA02G241940|TK1151|cDNA

GGACCATTGTAGTTAGATTTAATTAGCAACAGATATAATAGTGACTCCACTCTTTGAATTATATTTAGTATCCACTGGTTTCAAGATGCGCTTATGCAGAACAGCTTGAGCTACAACCTTCAATCTCAAACCAAGGTTACGAGTTGAAGTTACAGAACTTTCCAGGTGGAGCGGAAACGTTTGAAATGGTCCTGAAATTTTGTTACGGTTTTCTGGTATCTTTAAATCCAAGAAACGCAGCCCCAATAAGGTGTGCGGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1569 bp · TkA02G241940|TK1151|CDS

ATGGTCCTGAAATTTTGTTACGGTTTTCTGGTATCTTTAAATCCAAGAAACGCAGCCCCAATAAGGTGTGCGGCGGAGTTCCTGGACATGACGGAGGAATTAGAAGAAGGAAACCTTATATCTAAATCCGAATCATTTCTCACGTTGGTAGTCTTTTCTTCATGGAAGGACTCGATTACTGTCCTAAAATCATGCGAAACTTTGTCTCCATGGGCTGAAAATCTCCAGATTGTACGAAGATGTTGTGATTCAATCGCTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

522 aa · TkA02G241940|TK1151|PROTEIN

MVLKFCYGFLVSLNPRNAAPIRCAAEFLDMTEELEEGNLISKSESFLTLVVFSSWKDSITVLKSCETLSPWAENLQIVRRCCDSIARAAEGYFTSTEAVNEQCRCLINDLATLQIDHFMRIMTSMTLKGLRPEFLGKCIVIYAEKWLSDTDVHIEGSKRATTGKNEIQWSIQPGLRSTGTELGEYQEQRRIIECLVSILPHQKDAISCKFLLWMLKMAILYSVSPAFISELEKRAGMVMENATVYDLLIPVYRIREQGNQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G241940
TK1151 IDTkA02G241940
OH-1004 IDLXL04_015905
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.885
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G241940
位置Chr02:62161510-62164434 (+)
描述Similar to DOT3: BTB/POZ domain-containing protein DOT3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10250 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。 暂无已核实直接文献
At5g64330 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
Arabidopsis NPH3: A NPH1 photoreceptor-interacting protein essential for phototropism.1999 · DOI: 10.1126/science.286.5441.961
RPT2. A signal transducer of the phototropic response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.2.225
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1 is a phototropin 1 binding protein required for phototropism.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603799103
The Arabidopsis PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE2 protein is a phototropin signaling element that regulates leaf flattening and leaf positioning.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.150441
At1g30440 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g67385 可能作为E3泛素蛋白连接酶复合体（CUL3-RBX1-BTB）的底物特异性衔接蛋白，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g13600 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0568200 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
The Rice COLEOPTILE PHOTOTROPISM1 gene encoding an ortholog of Arabidopsis NPH3 is required for phototropism of coleoptiles and lateral translocation of auxin.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.028357
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30440
ath:AT5G10250
ath:AT5G13600
ath:AT5G66560
ath:AT5G67385
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.551
排名 1 · TkA02G241940 · TK1151
细胞质0.342
排名 2 · TkA02G241940 · TK1151
细胞膜0.155
排名 3 · TkA02G241940 · TK1151
内质网0.046
排名 4 · TkA02G241940 · TK1151
溶酶体／液泡0.034
排名 5 · TkA02G241940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03000NPH3106-375 aa
PF30756LUZP2207-297 aa
PF16523betaPIX_CC231-257 aa
PF28878C3H64_C246-310 aa
PF09635MetRS-N265-325 aa
PF30756LUZP2381-455 aa
PF16523betaPIX_CC392-465 aa
PF11932DUF3450407-467 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G241940PF03000NPH31063753.2e-86289.9
TkA02G241940PF30756LUZP22072970.01615.3
TkA02G241940PF16523betaPIX_CC2312570.3111.7
TkA02G241940PF28878C3H64_C2463100.02315.5
TkA02G241940PF09635MetRS-N2653250.07914.2
TkA02G241940PF30756LUZP23814550.01615.3
TkA02G241940PF16523betaPIX_CC3924650.3111.7
TkA02G241940PF11932DUF34504074670.01615.2
TkA02G241940PF28878C3H64_C4464590.02315.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFU0拟南芥sp|Q9LFU0|DOT3_ARATH BTB/POZ domain-containing protein DOT347.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FMF5拟南芥sp|Q9FMF5|RPT3_ARATH Root phototropism protein 336.700%Swiss-Prot中等置信
Q9S9Q9拟南芥sp|Q9S9Q9|Y1044_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At1g3044037.700%Swiss-Prot中等置信
Q66GP0拟南芥sp|Q66GP0|SR1P1_ARATH BTB/POZ domain-containing protein SR1IP137.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FNB3拟南芥sp|Q9FNB3|Y5360_ARATH Putative BTB/POZ domain-containing protein At5g1360050.700%Swiss-Prot中等置信
Q5KS50水稻sp|Q5KS50|NPH3_ORYSJ Coleoptile phototropism protein 133.300%Swiss-Prot中等置信

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