TkA02G127200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G127200

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 33018177-33019488 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

390 bp · TkA02G127200|TK1151|cDNA

ATGGCCTTCTTTCAGGTTCGAATTCCGGAACAGTTGATGGCGGCTTTCCCGATTCGGTTTAAAGAGGATTCAGATCTGGTTATCGCGAACGCCTTCTTTCGGGAGCTCGTGGACATCGAAAGTTCATTGAAGTGTGCTAGAGCACCGGCGTGCTACTGGTCACCGATTCCACCGGCAGAGTTGAGAGGAGAATCTACTCGTCTCATTTGCTTTAATCAGTTAGATCTTCCTGAATACTCAACAAAGGAACAACTTCAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

390 bp · TkA02G127200|TK1151|CDS

ATGGCCTTCTTTCAGGTTCGAATTCCGGAACAGTTGATGGCGGCTTTCCCGATTCGGTTTAAAGAGGATTCAGATCTGGTTATCGCGAACGCCTTCTTTCGGGAGCTCGTGGACATCGAAAGTTCATTGAAGTGTGCTAGAGCACCGGCGTGCTACTGGTCACCGATTCCACCGGCAGAGTTGAGAGGAGAATCTACTCGTCTCATTTGCTTTAATCAGTTAGATCTTCCTGAATACTCAACAAAGGAACAACTTCAAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

129 aa · TkA02G127200|TK1151|PROTEIN

MAFFQVRIPEQLMAAFPIRFKEDSDLVIANAFFRELVDIESSLKCARAPACYWSPIPPAELRGESTRLICFNQLDLPEYSTKEQLQELIACNFFKPLISYVDVTAATNRADIFDPALMRRKIEFPHQQI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G127200`
TK1151 ID	TkA02G127200
OH-1004 ID	LXL04_016533
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G127200

位置 Chr02:33018177-33019488 (-)

描述 Similar to ARPC2B: Actin-related protein 2/3 complex subunit 2B

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g30825`	作为 Arp2/3 复合物的肌动蛋白结合组分，该复合物参与肌动蛋白聚合的调节，并与激活的成核促进因子（NPF）一起介导分支肌动蛋白网络的形成。	DISTORTED2 encodes an ARPC2 subunit of the putative Arabidopsis ARP2/3 complex.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02065.x Actin control over microtubules suggested by DISTORTED2 encoding the Arabidopsis ARPC2 subunit homolog.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch103

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016533 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007015 actin filament organization 生物过程

GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程

GO:0030041 actin filament polymerization 生物过程

GO:0034314 Arp2/3 complex-mediated actin nucleation 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005885 Arp2/3 protein complex 细胞组分

GO:0042995 cell projection 细胞组分

GO:0005200 structural constituent of cytoskeleton 分子功能

GO:0051015 actin filament binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G30825

ath:AT2G33385

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.353

排名 1 · TkA02G127200 · TK1151

细胞质0.317

排名 2 · TkA02G127200 · TK1151

线粒体0.165

排名 3 · TkA02G127200 · TK1151

质体0.097

排名 4 · TkA02G127200 · TK1151

细胞外0.067

排名 5 · TkA02G127200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04045P34-Arc12-64 aa

PF00632HECT70-88 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G127200	`PF04045`	P34-Arc	12	64	0.00025	21.6
TkA02G127200	`PF00632`	HECT	70	88	0.0024	18.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8LGI3`	拟南芥	sp\|Q8LGI3\|ARC2A_ARATH Actin-related protein 2/3 complex subunit 2A	35.700%	Swiss-Prot	中等置信

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