基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G102480
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 26798516-26802757
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1644 bp · TkA02G102480|TK1151|cDNA
CTGACAATTAATTAATAATCGATGGGGGTTGAGAGTAAATGAGGGAAAGGAAGAAGAAGCAACACAAAGGGGAAAATGGGGTTCGATTTCTTCAGCAATTCATGACTATTCACTCCTCTCGATCTCCAGATTTATTCAATGATCACTCAACTATCGATAATTGCTTCGATTGAATCACTCCACAGAAGCAATTGAAAATAGATTAGCGAGATCATCACAACTGTTCATCCCTCGTAGATCTCCGATTAGATAATTCATTC...
CDS
下载 CDS FASTA669 bp · TkA02G102480|TK1151|CDS
ATGGCGACGAGGAACAGAACGTTTCTGTTTAAGAAGTATAGAGATGCATTGAAGACCGTTAGGGCTCCGTCGTCGTTAGCTTCTTCTAGCTCCCGTAGTGGTGCTGTTATCGAGATGGCCAACGCCGGTCTGCTTAAGCAAAATAGTTCTTATGCTCCTCTTAGCACCGAGGATCCCGGGACTTCCTCAACAGGTGCATTAACAGTGGGACTGCCTCCAGCATGGGTTGATGTATCTGATGAAATAGCAGCAAATGTGCA...
222 aa · TkA02G102480|TK1151|PROTEIN
MATRNRTFLFKKYRDALKTVRAPSSLASSSSRSGAVIEMANAGLLKQNSSYAPLSTEDPGTSSTGALTVGLPPAWVDVSDEIAANVQRARSKMGELAKAHAKALMPSFGDGKEDQHKIEALTHEITDLLKKSERRLKRLSAGGTSEDSNIRKNVQRSIATDLQSLSMELRKKQSTYLKRLQLQKEGPDGVDLEMNLNGKQSKRDDDDDEFDDMGFNEHQLAN
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G102480 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G102480 |
| OH-1004 ID | LXL04_016791 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 99.550 / OH-1004 68.421覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G102480 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:26798516-26802757 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to SYP43: Syntaxin-43 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程 GO:0006896 Golgi to vacuole transport 生物过程 GO:0006906 vesicle fusion 生物过程 GO:0007030 Golgi organization 生物过程 GO:0007034 vacuolar transport 生物过程 GO:0009306 protein secretion 生物过程 GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0032456 endocytic recycling 生物过程 GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程 GO:0043001 Golgi to plasma membrane protein transport 生物过程 GO:0048278 vesicle docking 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G05710 ath:AT4G02195 ath:AT5G26980 hsa:8675 mmu:228960 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.380
高尔基体0.317
内质网0.228
细胞膜0.198
细胞核0.157
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14523Syntaxin_279-179 aaPF00745GlutR_dimer82-143 aaPF14282FlxA111-175 aaPF30303TRAPPC10-Trs130_NTS112-181 aaPF19286ZSWIM1-3_C114-134 aaPF25118EFL1120-171 aaPF07299EF-G-binding_N121-121 aaPF00745GlutR_dimer133-172 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G102480 | PF14523 | Syntaxin_2 | 79 | 179 | 1.3e-05 | 26.0 |
| TkA02G102480 | PF00745 | GlutR_dimer | 82 | 143 | 0.21 | 12.6 |
| TkA02G102480 | PF14282 | FlxA | 111 | 175 | 0.0036 | 18.2 |
| TkA02G102480 | PF30303 | TRAPPC10-Trs130_NTS | 112 | 181 | 0.15 | 11.9 |
| TkA02G102480 | PF19286 | ZSWIM1-3_C | 114 | 134 | 0.11 | 12.9 |
| TkA02G102480 | PF25118 | EFL1 | 120 | 171 | 0.025 | 16.0 |
| TkA02G102480 | PF07299 | EF-G-binding_N | 121 | 121 | 0.087 | 14.0 |
| TkA02G102480 | PF00745 | GlutR_dimer | 133 | 172 | 0.21 | 12.6 |
| TkA02G102480 | PF07299 | EF-G-binding_N | 140 | 184 | 0.087 | 14.0 |
| TkA02G102480 | PF19286 | ZSWIM1-3_C | 163 | 171 | 0.11 | 12.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。