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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G037070
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 9287361-9293720 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2856 bp · TkA02G037070|TK1151|cDNA

TATCAATCTGAAGAACGTGGCTACTGTGAAAACATAGAGGCGGTATTACAGAGACTCTGGGTTCTTCTTGTTTCTCTGCTGACGAGATACTGATCGATCTCGACGCAATCGAAAGTTGAGAGATGGCGGAGCACGGTGGCGGAGGCGGATGTTGCCCGCCGATGGATCTGTTCCGTTCAGAACCGATGCATCTAATACAAGTCATTATCCCAATCGAGTCCGCTCGCTTGACCGTCTCGTACCTTGGAGATATCGGCCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2325 bp · TkA02G037070|TK1151|CDS

ATGGCGGAGCACGGTGGCGGAGGCGGATGTTGCCCGCCGATGGATCTGTTCCGTTCAGAACCGATGCATCTAATACAAGTCATTATCCCAATCGAGTCCGCTCGCTTGACCGTCTCGTACCTTGGAGATATCGGCCTCATTCAATTCAAAGATCTGAACGTAGAAAAAAGCCCTTTTCAGAGAACATATGCAGGCCAGATTAAAAGATGCGCTGAGCTGGCACGAAAGTTGCGTTTCTTCAAAGATCAAATGTCAAAGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

774 aa · TkA02G037070|TK1151|PROTEIN

MAEHGGGGGCCPPMDLFRSEPMHLIQVIIPIESARLTVSYLGDIGLIQFKDLNVEKSPFQRTYAGQIKRCAELARKLRFFKDQMSKADIIPSGKPNTKAVLNLDDIEVNLGDLEAELTEMNANSEKLQRGYNELVEYKLVLQKAGEIFNVAQSSATAQHGESSSHHGEESLESPLLKDQVDQGKQVKLGFLTGLVPKEKAMAFERILFRATRGNVFLRQASVEEAVTDPNSGQKVQKSVFVVFFSGERAKNKILKICEAF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G037070
TK1151 IDTkA02G037070
OH-1004 IDLXL04_017523
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.612 / OH-1004 94.254
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G037070
位置Chr02:9287361-9293720 (+)
描述Similar to VHA-a3: V-type proton ATPase subunit a3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g21410 液泡质子泵 的重要组成部分，V-ATPase 是一种催化质子跨膜易位的多聚酶。
Arabidopsis V-ATPase activity at the tonoplast is required for efficient nutrient storage but not for sodium accumulation.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0913035107
At4g39080 液泡质子泵 的重要组成部分，V-ATPase 是一种催化质子跨膜易位的多聚酶。
Arabidopsis V-ATPase activity at the tonoplast is required for efficient nutrient storage but not for sodium accumulation.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0913035107
At2g28520 液泡质子泵 的重要组成部分，V-ATPase 是一种催化质子跨膜易位的多聚酶。
Reduced V-ATPase activity in the trans-Golgi network causes oxylipin-dependent hypocotyl growth Inhibition in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.058362

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017523 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006911 phagocytosis, engulfment 生物过程
GO:0007035 vacuolar acidification 生物过程
GO:0015986 proton motive force-driven ATP synthesis 生物过程
GO:0016241 regulation of macroautophagy 生物过程
GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程
GO:0070070 proton-transporting V-type ATPase complex assembly 生物过程
GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程
GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程
GO:0000220 vacuolar proton-transporting V-type ATPase, V0 domain 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21410
ath:AT2G28520
ath:AT4G39080
ddi:DDB_G0291858
mmu:11975
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.378
排名 1 · TkA02G037070 · TK1151
高尔基体0.292
排名 2 · TkA02G037070 · TK1151
细胞质0.219
排名 3 · TkA02G037070 · TK1151
细胞膜0.173
排名 4 · TkA02G037070 · TK1151
溶酶体／液泡0.164
排名 5 · TkA02G037070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01496V_ATPase_I40-771 aa
PF25443ANG-149-80 aa
PF24079UBR499-166 aa
PF14932HAUS-augmin3100-172 aa
PF25443ANG-1110-137 aa
PF23246CC_CDK5RAP2135-182 aa
PF027395_3_exonuc_N237-282 aa
PF25443ANG-1270-328 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G037070PF01496V_ATPase_I407719e-277921.0
TkA02G037070PF25443ANG-149800.9410.4
TkA02G037070PF24079UBR4991660.8110.8
TkA02G037070PF14932HAUS-augmin31001720.6710.1
TkA02G037070PF25443ANG-11101370.9410.4
TkA02G037070PF23246CC_CDK5RAP21351820.3211.9
TkA02G037070PF027395_3_exonuc_N2372820.2112.0
TkA02G037070PF25443ANG-12703280.9410.4
TkA02G037070PF14932HAUS-augmin32893310.6710.1
TkA02G037070PF23246CC_CDK5RAP22973280.3211.9
TkA02G037070PF24079UBR43033120.8110.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJT7拟南芥sp|Q9SJT7|VHAA2_ARATH V-type proton ATPase subunit a274.100%Swiss-Prot高置信
Q8W4S4拟南芥sp|Q8W4S4|VHAA3_ARATH V-type proton ATPase subunit a373.900%Swiss-Prot高置信
Q8RWZ7拟南芥sp|Q8RWZ7|VHAA1_ARATH V-type proton ATPase subunit a161.000%Swiss-Prot高置信

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