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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G642100
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 162476153-162479187 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2121 bp · TkA01G642100|TK1151|cDNA

AAAACATGAAGTTTTGGTAGAAATTTTGTTTACCGATGGCTGGCCCCATCCGTCTCCATATGCTCCGTCCGGTTCCGACCTTTCATTTGCAATTCTAGCCGACGGAGCACACCCTCTCCCTCTCTCTCTCCGGCAGAAGGTTACACACACTACACTCTGCTATTCGCCCACCTGCTTCACCTTTCTCTCTCTACCGAGCATTCTCTCTACAGGCTACACTTCCATTACTGTAGGAATATGGCTTTTTGATTTTGATTGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1605 bp · TkA01G642100|TK1151|CDS

ATGGGGAATTGTTGCAGATCTCCAGCGTCTGTAGCCAGGGAAGATGTGAAGTCTTCAAACTACCCTGGTCATGACCATCACAACAAGAAGGACAAGACTAACGCTGGGAACGCTAAGAAGGCGCCGATCGCTGTCCTCACTGATGTGTCGAAGGAAAATATCGAAGAGAAGTATATGTTAGATAGGGAACTTGGACGCGGAGAATTTGGAGTGACTTACCTGTGTATAGATCGAAGCTCGAGGGAATTGTTAGCCTGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

534 aa · TkA01G642100|TK1151|PROTEIN

MGNCCRSPASVAREDVKSSNYPGHDHHNKKDKTNAGNAKKAPIAVLTDVSKENIEEKYMLDRELGRGEFGVTYLCIDRSSRELLACKSISKRKLRTAVDVDDVRREVAIMKHLPENSSIVTLREACEDENAVHLVMELCEGGELFDRIVARGHYTERAAAAVTRTIVEVVQLCHKHGVIHRDLKPENFLFANKKENSPLKAIDFGLSIFFKPGERFSEIVGSPYYMAPEVLKRNYGPEIDIWSAGVILYILLCGVPPFWA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G642100
TK1151 IDTkA01G642100
OH-1004 IDLXL04_000009
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.064 / OH-1004 88.610
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G642100
位置Chr01:162476153-162479187 (+)
描述Similar to CPK13: Calcium-dependent protein kinase 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51850 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g12480 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19450 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0832300 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0467000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000009 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74740
ath:AT3G51850
ath:AT5G12480
dosa:Os01g0832300
dosa:Os05g0467000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.574
排名 1 · TkA01G642100 · TK1151
细胞质0.309
排名 2 · TkA01G642100 · TK1151
细胞核0.204
排名 3 · TkA01G642100 · TK1151
高尔基体0.063
排名 4 · TkA01G642100 · TK1151
内质网0.058
排名 5 · TkA01G642100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase59-316 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr60-312 aa
PF06293Kdo87-204 aa
PF26389MamY_C94-138 aa
PF01636APH98-160 aa
PF01163RIO1103-193 aa
PF03109ABC1134-215 aa
PF14531Kinase-like147-300 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G642100PF00069Pkinase593161.8e-75254.4
TkA01G642100PF07714PK_Tyr_Ser-Thr603123.7e-2486.2
TkA01G642100PF06293Kdo872040.0001621.9
TkA01G642100PF26389MamY_C941380.4511.0
TkA01G642100PF01636APH981600.03214.7
TkA01G642100PF01163RIO11031930.04614.1
TkA01G642100PF03109ABC11342150.0001821.5
TkA01G642100PF14531Kinase-like1473000.0004820.2
TkA01G642100PF20742DUF5580_M1681790.09213.5
TkA01G642100PF17667Pkinase_fungal1692350.01814.5
TkA01G642100PF01636APH1742050.03214.7
TkA01G642100PF29176Allatotropin-like_C2662770.002618.0
TkA01G642100PF26389MamY_C3303770.4511.0
TkA01G642100PF13833EF-hand_83533843.3e-1349.9
TkA01G642100PF12763EH3564333.2e-0627.7
TkA01G642100PF25825SAPC2_N3574236.9e-0626.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W4I7拟南芥sp|Q8W4I7|CDPKD_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1386.000%Swiss-Prot高置信
Q38873拟南芥sp|Q38873|CDPK7_ARATH Calcium-dependent protein kinase 766.200%Swiss-Prot高置信
Q42438拟南芥sp|Q42438|CDPK8_ARATH Calcium-dependent protein kinase 866.600%Swiss-Prot高置信
Q8LPZ7水稻sp|Q8LPZ7|CDPK3_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 377.700%Swiss-Prot高置信
Q6I5I8水稻sp|Q6I5I8|CDPKG_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1678.000%Swiss-Prot高置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2071.500%Swiss-Prot高置信

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