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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G590380
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 148561766-148563498 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1629 bp · TkA01G590380|TK1151|cDNA

GCGGCACACATTTTCCATACGCCCTATCCCCAAATGCCACACGAGTCAAAATCGGAACGATTAAAAAGTTTCTTACATTTAAGGGTCAAATCCGCCGGCCACCCTTCCCTTTACTCCTCCATAACTCTCCCTCTCTTAAACTCGCGCTTTCTCTCTCTAGAAACCACCACCTTTCTCTCTCTCTATATAGCCGGCTTACAGGCGATATTCATTCTTCAGTTACTAACACAGCCCTTATTAAGCATCTATTAAAGCGTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

921 bp · TkA01G590380|TK1151|CDS

ATGTGGAGATCGTCGTTTCTGTTGTTGAAAGTGGGTTTCTCGTCGGGGATTGTTAGGTCTAGACCGGTTGCGTTTGGCCTGAGAAGAGTCGTTTCCGTTGAGTCTAGAATCAGATTCTGTGGTTGTTTGTTTTCGAGTTCGGTCGGTGGAGACGGTGGAGTAGGAGGAGGCGTACGGCGAGGGGTTGATGAAGGTGATAGTATATCGTTTGCGGAGGCGAAGAAACTAATGAGATTGGTGAATGTGGAGGCATTGAAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

306 aa · TkA01G590380|TK1151|PROTEIN

MWRSSFLLLKVGFSSGIVRSRPVAFGLRRVVSVESRIRFCGCLFSSSVGGDGGVGGGVRRGVDEGDSISFAEAKKLMRLVNVEALKMKFSAEGREMISYSELLQACENIGVAKSVDEAKAFAKVLDDAGVVLIFRDKVYLQPDKVVDLVRRAVPLALTADDDPRREELKQLQAKQEEIDRLAHRQVRRILWTGLGLALAQIGLFFRLTFWEFSWDVMEPIAFFGTTSGLIVGYAYFLITSRDPTYQDLMKRLFLSRRRKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G590380
TK1151 IDTkA01G590380
OH-1004 IDLXL04_036672
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)72.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.673 / OH-1004 99.677
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G590380
位置Chr01:148561766-148563498 (+)
描述Similar to At1g09575: Calcium uniporter protein 6, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g09575 线粒体内膜钙转运蛋白，介导线粒体钙的摄取。
Physiological Characterization of a Plant Mitochondrial Calcium Uniporter in Vitro and in Vivo.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01359
At1g57610 线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At2g23790 线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At4g36820 线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At5g66650 介导钙进入叶绿体基质的叶绿体膜钙通道蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036672 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0036444 calcium import into the mitochondrion 生物过程
GO:0051560 mitochondrial calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0070509 calcium ion import 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:1990246 uniplex complex 细胞组分
GO:0005262 calcium channel activity 分子功能
GO:0015292 uniporter activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09575
ath:AT1G57610
ath:AT2G23790
ath:AT4G36820
ath:AT5G66650
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.891
排名 1 · TkA01G590380 · TK1151
细胞核0.058
排名 2 · TkA01G590380 · TK1151
细胞质0.050
排名 3 · TkA01G590380 · TK1151
质体0.047
排名 4 · TkA01G590380 · TK1151
细胞膜0.020
排名 5 · TkA01G590380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25051WHD_MCM882-139 aa
PF16095COR-A90-139 aa
PF04678MCU116-274 aa
PF25051WHD_MCM8254-279 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G590380PF25051WHD_MCM8821390.04214.6
TkA01G590380PF16095COR-A901390.0009919.7
TkA01G590380PF04678MCU1162744.9e-52177.3
TkA01G590380PF25051WHD_MCM82542790.04214.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I111拟南芥sp|F4I111|MCU1_ARATH Calcium uniporter protein 1, mitochondrial61.000%Swiss-Prot高置信
Q8VYR0拟南芥sp|Q8VYR0|MCU2_ARATH Calcium uniporter protein 2, mitochondrial51.400%Swiss-Prot高置信
O64823拟南芥sp|O64823|MCU3_ARATH Calcium uniporter protein 3, mitochondrial41.400%Swiss-Prot中等置信
Q1PE15拟南芥sp|Q1PE15|MCU4_ARATH Calcium uniporter protein 4, mitochondrial37.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LVR5拟南芥sp|Q9LVR5|MCU6_ARATH Chloroplastic calcium uniporter protein36.600%Swiss-Prot中等置信

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