LXL04_036672 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_036672

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 46469455-46471108 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

933 bp · LXL04_036672|LXL04_036672|OH1004|cDNA

ATGTGGAGGTCATCGTTTTCGGTACTGAAGCAGGGGGTGACATCGGCGGTTGCTAGATCAAACCCGGTGTCGATTGGATGGAGGAAAACGAGTCTCATTGAATCTAACACCAGGCTATGTGCTTGTTTGTTCTCGACTTCCGTCGGCGGCGGCGGTGGAGGGGTAGGGTTAGGGCAAGGGCAAGGGGAAAAGGGAAATGACGGTAATGATAGTATTACGTTTTCGGAGGCGAAGAAGCTGATGAGATTGGTGAATGTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

933 bp · LXL04_036672|LXL04_036672|OH1004|CDS

ATGTGGAGGTCATCGTTTTCGGTACTGAAGCAGGGGGTGACATCGGCGGTTGCTAGATCAAACCCGGTGTCGATTGGATGGAGGAAAACGAGTCTCATTGAATCTAACACCAGGCTATGTGCTTGTTTGTTCTCGACTTCCGTCGGCGGCGGCGGTGGAGGGGTAGGGTTAGGGCAAGGGCAAGGGGAAAAGGGAAATGACGGTAATGATAGTATTACGTTTTCGGAGGCGAAGAAGCTGATGAGATTGGTGAATGTTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

310 aa · LXL04_036672|LXL04_036672|OH1004|PROTEIN

MWRSSFSVLKQGVTSAVARSNPVSIGWRKTSLIESNTRLCACLFSTSVGGGGGGVGLGQGQGEKGNDGNDSITFSEAKKLMRLVNVESLKMKLTTEGKETICYSELLEACESMGVTKSNEEAKAFVNVLDEAGVVLIFRDKVYLHPDKVVDLVRRAVPLALTPEDDPRREELKTLQAKQDEIDILAHKQVRRILWMGLGLSLAQISLFFRLTFWDLSWDVMEPIAFFTTASGLIIGYAYFLFTSRDPTYQDLLKRLFLSR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_036672`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_036672

位置 Chr08:46469455-46471108 (-)

描述 Similar to At1g09575: Calcium uniporter protein 6, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g09575`	线粒体内膜钙转运蛋白，介导线粒体钙的摄取。	Physiological Characterization of a Plant Mitochondrial Calcium Uniporter in Vitro and in Vivo.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01359
`At1g57610`	线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献
`At2g23790`	线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献
`At4g36820`	线粒体内膜钙单向转运蛋白，介导钙进入线粒体（基于相似性推测）。	暂无已核实直接文献
`At5g66650`	介导钙进入叶绿体基质的叶绿体膜钙通道蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036672 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0036444 calcium import into the mitochondrion 生物过程

GO:0051560 mitochondrial calcium ion homeostasis 生物过程

GO:0070509 calcium ion import 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分

GO:1990246 uniplex complex 细胞组分

GO:0005262 calcium channel activity 分子功能

GO:0015292 uniporter activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G09575

ath:AT1G57610

ath:AT2G23790

ath:AT4G36820

ath:AT5G66650

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.917

排名 1 · LXL04_036672 · OH-1004

细胞核0.056

排名 2 · LXL04_036672 · OH-1004

细胞质0.050

排名 3 · LXL04_036672 · OH-1004

质体0.028

排名 4 · LXL04_036672 · OH-1004

细胞膜0.022

排名 5 · LXL04_036672 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04678.19MCU120-278 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_036672	`PF04678.19`	MCU	120	278	3.3e-50	171.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4I111`	拟南芥	Calcium uniporter protein 1, mitochondrial	60.669%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q8VYR0`	拟南芥	Calcium uniporter protein 2, mitochondrial	57.708%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O64823`	拟南芥	Calcium uniporter protein 3, mitochondrial	38.636%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q1PE15`	拟南芥	Calcium uniporter protein 4, mitochondrial	40.000%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LVR5`	拟南芥	Chloroplastic calcium uniporter protein	39.048%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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