TkA01G578190 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G578190

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 145379338-145381868 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1494 bp · TkA01G578190|TK1151|cDNA

AAAAAAACAAACAAAATCTTAAACTAATTTTTCAAGGATTTGCCGTGCAAGGACTCGTCGACCTAAATCAAAAATGTCGACTGCAACATCACTCCTTAGCTCTTCACCCATCATCTTCCGGACCACCACCACCACCGCCACCACCAGCATCACCACCGTCCCACCACTGAAATTCAGACCCAAAAAACTCCGTCAATCTGCACCCAGAATGTCCATCAACAACTCTCCTCCAACCCCCACTCAACTCATCACCTCCATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA01G578190|TK1151|CDS

ATGTCGACTGCAACATCACTCCTTAGCTCTTCACCCATCATCTTCCGGACCACCACCACCACCGCCACCACCAGCATCACCACCGTCCCACCACTGAAATTCAGACCCAAAAAACTCCGTCAATCTGCACCCAGAATGTCCATCAACAACTCTCCTCCAACCCCCACTCAACTCATCACCTCCATCACCAAACTCCTCTGGGGCAAATCCCTCCCACCACAACTCCTCATCTCCACCGTACGCTCCGCGTGGTCCACCGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

445 aa · TkA01G578190|TK1151|PROTEIN

MSTATSLLSSSPIIFRTTTTTATTSITTVPPLKFRPKKLRQSAPRMSINNSPPTPTQLITSITKLLWGKSLPPQLLISTVRSAWSTAWHLMMSQLAPSDPSGSYTRPVSQFRNPNYQQLQPNSLHLYAALPCPWAHRTLIVRALKGLQDAIPVSIASPGLDGSWVFIDSPIPNGDTLILIPTRDKVNGAKTVREVYKSRRGGYDGRCTVPMLWDVEKKEVVCNESYDIIELLNSGLNSVARNPDLDLSPPELKKQIDEWN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G578190`
TK1151 ID	TkA01G578190
OH-1004 ID	LXL04_000897
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 83.371 / OH-1004 99.464 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA01G578190`
位置	Chr01:145379338-145381868 (+)
描述	暂无功能描述
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_000897` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0098869 cellular oxidant detoxification 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0004364 glutathione transferase activity 分子功能 GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能 GO:0016672 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, quinone or similar compound as acceptor 分子功能 GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能 GO:0045174 glutathione dehydrogenase (ascorbate) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ecj:JW3073 eco:b3102 ecoc:C3026_16935 sce:YKR076W sce:YMR251W spo:2539028 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.946

排名 1 · TkA01G578190 · TK1151

线粒体0.085

排名 2 · TkA01G578190 · TK1151

细胞质0.036

排名 3 · TkA01G578190 · TK1151

细胞核0.022

排名 4 · TkA01G578190 · TK1151

过氧化物酶体0.021

排名 5 · TkA01G578190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13813MBOAT_276-96 aa

PF13417GST_N_3126-150 aa

PF13409GST_N_2132-233 aa

PF13417GST_N_3205-233 aa

PF00043GST_C276-358 aa

PF13410GST_C_2280-352 aa

PF14497GST_C_3288-362 aa

PF21972Arc1p_N_like291-324 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G578190	`PF13813`	MBOAT_2	76	96	0.06	14.3
TkA01G578190	`PF13417`	GST_N_3	126	150	0.13	13.3
TkA01G578190	`PF13409`	GST_N_2	132	233	2.1e-10	41.7
TkA01G578190	`PF13417`	GST_N_3	205	233	0.13	13.3
TkA01G578190	`PF00043`	GST_C	276	358	4.4e-10	40.4
TkA01G578190	`PF13410`	GST_C_2	280	352	1.9e-14	54.2
TkA01G578190	`PF14497`	GST_C_3	288	362	1.5e-06	29.0
TkA01G578190	`PF21972`	Arc1p_N_like	291	324	0.3	12.1
TkA01G578190	`PF17171`	GST_C_6	293	352	0.014	15.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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