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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G558070
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 140356296-140370562 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4906 bp · TkA01G558070|TK1151|cDNA

TTTTCATCATATGATATGCAACATGATTTCAATAATATTTCCGTGTAGTGGGTATTAATTTATCTGACTTTTTGAATTTCAACGAAGAACACATACATCGAATTCGTAAACTGTTGCTCAGATGTCAACGATGCAGATATAGAAATCGTGAGTTGACACTGAATCTTTGGTGGTTTTAATGGCTTCTTCATCATGGATGACCTCACTTTCCTGTTCTTCAAGCTCTGTTGTGGCGGAGGACGCCTCAAGCGTACTCCAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

4527 bp · TkA01G558070|TK1151|CDS

ATGGCTTCTTCATCATGGATGACCTCACTTTCCTGTTCTTCAAGCTCTGTTGTGGCGGAGGACGCCTCAAGCGTACTCCAGTGGCCGAGGTTCATCTTCCTCTCTCCCTGCGGTCAAAGGGCACTTTTATCCTCCATTGATGTCCTCTTCCTGCTCATCCTCCTCTTTTTTGCTATTCAAAAGCTCTTTTCAAGATTCACCTCCAACACCTCCGTCAACGAAGAACCTCTTCTTCCCAAAAGTAGAGCAGTTGTCAAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1508 aa · TkA01G558070|TK1151|PROTEIN

MASSSWMTSLSCSSSSVVAEDASSVLQWPRFIFLSPCGQRALLSSIDVLFLLILLFFAIQKLFSRFTSNTSVNEEPLLPKSRAVVKPNVWFKISLLVTSILVVLSIVSSILAFTRNTQMPWKLIDGICWVIQALTFLVITVLIIHEKRFQALTHPLSLRVFWLINFIVIALMASSSTIRLVSDTRNTTQLKSEDIVSLISLPFSVFLLILSINGSTGIIVKTESEAVNGNGHINGKVSEGDDLSKSIKVSGWASASILSK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G558070
TK1151 IDTkA01G558070
OH-1004 IDLXL04_001142
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.934 / OH-1004 96.541
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G558070
位置Chr01:140356296-140370562 (-)
描述Similar to ABCC4: ABC transporter C family member 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g47800 参与调节气孔孔径。 暂无已核实直接文献
At3g62700 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At1g04120 谷胱甘肽 S-结合物泵。
The Arabidopsis thaliana ABC transporter AtMRP5 controls root development and stomata movement.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.8.1875
The plant multidrug resistance ABC transporter AtMRP5 is involved in guard cell hormonal signalling and water use.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016012.x
Binding of sulfonylurea by AtMRP5, an Arabidopsis multidrug resistance-related protein that functions in salt tolerance.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.027045
The Arabidopsis ATP-binding cassette protein AtMRP5/AtABCC5 is a high affinity inositol hexakisphosphate transporter involved in guard cell signaling and phytate storage.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m109.030247

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XCD4 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。 暂无已核实直接文献
Os03g0142800 ABC 转运蛋白，可能影响植酸转运和区室化。
Mutations of the multi-drug resistance-associated protein ABC transporter gene 5 result in reduction of phytic acid in rice seeds.2009 · DOI: 10.1007/s00122-009-1018-1
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001142 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04120
ath:AT2G47800
ath:AT3G62700
dosa:Os03g0142800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.368
排名 1 · TkA01G558070 · TK1151
溶酶体／液泡0.340
排名 2 · TkA01G558070 · TK1151
内质网0.150
排名 3 · TkA01G558070 · TK1151
细胞质0.132
排名 4 · TkA01G558070 · TK1151
高尔基体0.101
排名 5 · TkA01G558070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24358ABCC10_N9-215 aa
PF00664ABC_membrane42-71 aa
PF05767Pox_A1495-147 aa
PF00664ABC_membrane328-593 aa
PF03193RsgA_GTPase657-701 aa
PF00005ABC_tran660-793 aa
PF20703nSTAND1661-689 aa
PF13476AAA_23662-688 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G558070PF24358ABCC10_N92150.3511.0
TkA01G558070PF00664ABC_membrane42711.4e-60206.0
TkA01G558070PF05767Pox_A14951470.2512.2
TkA01G558070PF00664ABC_membrane3285931.4e-60206.0
TkA01G558070PF03193RsgA_GTPase6577010.004517.6
TkA01G558070PF00005ABC_tran6607939.9e-49166.2
TkA01G558070PF20703nSTAND16616890.1912.0
TkA01G558070PF13476AAA_236626882.79.3
TkA01G558070PF01580FtsK_SpoIIIE6646910.08113.1
TkA01G558070PF13555AAA_296656870.001918.7
TkA01G558070PF00006ATP-synt_ab6656962.88.2
TkA01G558070PF25199nSTAND_NTPase56687000.04714.2
TkA01G558070PF02463SMC_N6718362.5e-0834.4
TkA01G558070PF13604AAA_306717130.007616.7
TkA01G558070PF13191AAA_166717070.01316.7
TkA01G558070PF00931NB-ARC6717380.02315.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7DM58拟南芥sp|Q7DM58|AB4C_ARATH ABC transporter C family member 468.700%Swiss-Prot高置信
Q9LZJ5拟南芥sp|Q9LZJ5|AB14C_ARATH ABC transporter C family member 1467.700%Swiss-Prot高置信
Q7GB25拟南芥sp|Q7GB25|AB5C_ARATH ABC transporter C family member 542.700%Swiss-Prot中等置信
A2XCD4水稻sp|A2XCD4|AB13C_ORYSI ABC transporter C family member 1342.100%Swiss-Prot中等置信
Q10RX7水稻sp|Q10RX7|AB13C_ORYSJ ABC transporter C family member 1342.100%Swiss-Prot中等置信

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