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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G544880
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 136710390-136712851 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2083 bp · TkA01G544880|TK1151|cDNA

CAAAAACAAGAAAACGACAAAAGAAAAAGAAATTTGGTTTCATTTGGCTGTCAAAAGCAACCCTTATTCATCGACCAGCTGCAATCCAATCCACATTAATCCAACAATTTGAGAGAGAGTAGGGGAGTAGAGCAAAGCACAGCAGCTCCATCGAGAGCTAGTAGATAGATAGATAGATCGTACACAGTGATAGCTGTTCCAAGAGGAAGAAAACCCTAATGATCTAAACTAGCTAGAACAACATCAACAAGTTGAGCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1017 bp · TkA01G544880|TK1151|CDS

ATGGCTATGGAGAATTCCAAGACAATAAGAAACATATACAGTGGAAAACACTATTCCCTTCCTCCTAAAAGCCCATTCCCAAGCATTACTCCGTTTTACCCTGATTACACTCCAACCACTGCCAAAGGGATACCAAAGTACAGGGACGGAAAGGTAAATTCACACCATCAACGCACATCTTCAGAAAGCCTTGCAATAGAGGAACAACCTTATTGGCTGGATGAACTTCTTGATGAACCAGAGACACCTGTCAGAAGAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

338 aa · TkA01G544880|TK1151|PROTEIN

MAMENSKTIRNIYSGKHYSLPPKSPFPSITPFYPDYTPTTAKGIPKYRDGKVNSHHQRTSSESLAIEEQPYWLDELLDEPETPVRRGHRRSSSDSFTYIEAANANIQHAAQIEYRLRNLNSQSHSPPSWGSQDFDLYKEARNASFYVEHNPIIKNKIRGWDSANSSQEVNKIVSPTSEKKDTTESCIDAHSDSSNTKGSISETDTKRAKQQFAQRSRVRKLQYIAELERNVQALQAEGSEVSAELKFLNQRSLILNMENK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G544880
TK1151 IDTkA01G544880
OH-1004 IDLXL04_001346
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G544880
位置Chr01:136710390-136712851 (+)
描述Similar to At4g06598: Uncharacterized protein At4g06598
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g06598 未表征蛋白 At4g06598。 暂无已核实直接文献
At2g42380 转录激活剂，参与细胞壁图案的孢子体控制和花粉发育的配子体控制。
A conserved proline residue in the leucine zipper region of AtbZIP34 and AtbZIP61 in Arabidopsis thaliana interferes with the formation of homodimer.2007 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2007.08.026
AtbZIP34 is required for Arabidopsis pollen wall patterning and the control of several metabolic pathways in developing pollen.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9493-y

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0247100 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0756200 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0211800 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001346 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42380
ath:AT3G58120
ath:AT4G06598
dosa:Os01g0756200
dosa:Os02g0247100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.958
排名 1 · TkA01G544880 · TK1151
细胞质0.125
排名 2 · TkA01G544880 · TK1151
细胞膜0.029
排名 3 · TkA01G544880 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA01G544880 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA01G544880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27248MJ1674_2nd104-122 aa
PF19579FtsL_2166-194 aa
PF27248MJ1674_2nd200-242 aa
PF04632FUSC209-300 aa
PF00170bZIP_1213-249 aa
PF07716bZIP_2213-240 aa
PF19579FtsL_2219-265 aa
PF06156YabA223-295 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G544880PF27248MJ1674_2nd1041220.7511.1
TkA01G544880PF19579FtsL_21661940.9310.2
TkA01G544880PF27248MJ1674_2nd2002420.7511.1
TkA01G544880PF04632FUSC2093000.3310.2
TkA01G544880PF00170bZIP_12132490.0002621.8
TkA01G544880PF07716bZIP_22132408.77.2
TkA01G544880PF19579FtsL_22192650.9310.2
TkA01G544880PF06156YabA2232950.2812.5
TkA01G544880PF06698DUF11922242371.79.6
TkA01G544880PF00170bZIP_12432720.0002621.8
TkA01G544880PF26962DUF83022492880.03514.9
TkA01G544880PF27248MJ1674_2nd2533010.7511.1
TkA01G544880PF07716bZIP_22552728.77.2
TkA01G544880PF06698DUF11922612981.79.6
TkA01G544880PF06156YabA2783160.2812.5
TkA01G544880PF07716bZIP_22783008.77.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W3M7拟南芥sp|Q8W3M7|Y4598_ARATH Uncharacterized protein At4g0659840.900%Swiss-Prot中等置信
F4IN23拟南芥sp|F4IN23|BZP34_ARATH Basic leucine zipper 3428.600%Swiss-Prot低置信
Q6K3R9水稻sp|Q6K3R9|BZP19_ORYSJ Basic leucine zipper 1950.500%Swiss-Prot低置信
Q5JMK6水稻sp|Q5JMK6|BZP06_ORYSJ Basic leucine zipper 653.300%Swiss-Prot低置信
Q5QNI5水稻sp|Q5QNI5|BZP02_ORYSJ Basic leucine zipper 231.100%Swiss-Prot中等置信

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