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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G533360
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 133865294-133869345 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2280 bp · TkA01G533360|TK1151|cDNA

TTCTTCTTCACCTTCGTATTTGCCTTTCATGAAGGTCAGACCGACGATGGTGAAAACTCGTCAGAAATTAGAGGTGAGCTGCCGGAAATCTCCTGATAAGATCTCCGGTGATGATTGGTTAAATGAGCTGCCGGAGACCAGTGCAAGCACCGACGTCATCATTGTTGGTGCCGGTGTATCTGGAGCTGCTCTCGCTTATGCTCTTGCTAAGGATGGACGTCGAGTGCATGTTATTGAGAAAAACTTGAAGGAGCCAAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

639 bp · TkA01G533360|TK1151|CDS

ATGAAGGTCAGACCGACGATGGTGAAAACTCGTCAGAAATTAGAGGTGAGCTGCCGGAAATCTCCTGATAAGATCTCCGGTGATGATTGGTTAAATGAGCTGCCGGAGACCAGTGCAAGCACCGACGTCATCATTGTTGGTGCCGGTGTATCTGGAGCTGCTCTCGCTTATGCTCTTGCTAAGGATGGACGTCGAGTGCATGTTATTGAGAAAAACTTGAAGGAGCCAAATCGGATTGTAGGTGAAGTTCTACATCCAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

212 aa · TkA01G533360|TK1151|PROTEIN

MKVRPTMVKTRQKLEVSCRKSPDKISGDDWLNELPETSASTDVIIVGAGVSGAALAYALAKDGRRVHVIEKNLKEPNRIVGEVLHPGGYLKLTELDLEDCVEGIEAQRVCGYVIHMKGKSIELDYPLQEFPANVSGKSFHNGRFIQRMRNKASSLPNVRLEQGTVTSLLKRQGTVHGVHYRTKDGQATTAYAPLTIVCDGCFFKSKTRSLQP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G533360
TK1151 IDTkA01G533360
OH-1004 IDLXL04_001469
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.981 / OH-1004 36.142
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G533360
位置Chr01:133865294-133869345 (+)
描述Similar to SQE1: Squalene monooxygenase SE1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37760 可能催化角鲨烯立体特异性氧化为 (S)-2,3-环氧角鲨烯，参与甾醇生物合成。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200
At1g58440 可能催化角鲨烯立体特异性氧化为 (S)-2,3-环氧角鲨烯，参与甾醇生物合成。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200
Identification of the Arabidopsis dry2/sqe1-5 mutant reveals a central role for sterols in drought tolerance and regulation of reactive oxygen species.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03849.x
Analysis of the arabidopsis dry2/sqe1-5 mutant suggests a role for sterols in signaling.2009 · DOI: 10.4161/psb.4.9.9425
At2g22830 催化角鲨烯立体专一性氧化生成（S）-2,3-环氧角鲨烯，被认为是类固醇生物合成中的限速酶。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001469 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0046246 terpene biosynthetic process 生物过程
GO:0071731 response to nitric oxide 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G58440
ath:AT2G22830
ath:AT4G37760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.499
排名 1 · TkA01G533360 · TK1151
细胞质0.236
排名 2 · TkA01G533360 · TK1151
细胞核0.113
排名 3 · TkA01G533360 · TK1151
过氧化物酶体0.107
排名 4 · TkA01G533360 · TK1151
质体0.069
排名 5 · TkA01G533360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13434Lys_Orn_oxgnase26-66 aa
PF06690HcgC30-72 aa
PF28759NDUFA331-65 aa
PF01946Thi438-73 aa
PF13738Pyr_redox_338-72 aa
PF01488Shikimate_DH38-95 aa
PF10727Rossmann-like40-69 aa
PF01494FAD_binding_341-208 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G533360PF13434Lys_Orn_oxgnase26660.2611.1
TkA01G533360PF06690HcgC30720.0913.0
TkA01G533360PF28759NDUFA331650.1212.8
TkA01G533360PF01946Thi438734.3e-0626.8
TkA01G533360PF13738Pyr_redox_338720.005916.6
TkA01G533360PF01488Shikimate_DH38950.09113.6
TkA01G533360PF10727Rossmann-like40690.1612.4
TkA01G533360PF01494FAD_binding_3412083.2e-1040.5
TkA01G533360PF01266DAO42721.4e-1145.3
TkA01G533360PF01134GIDA42745.8e-0832.9
TkA01G533360PF00890FAD_binding_242724.1e-0627.0
TkA01G533360PF12831FAD_oxidored421963.3e-0524.1
TkA01G533360PF07992Pyr_redox_242740.0004320.5
TkA01G533360PF03486HI0933_like42750.0007519.8
TkA01G533360PF05834Lycopene_cycl42800.008715.9
TkA01G533360PF04820Trp_halogenase42820.3210.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VYH2拟南芥sp|Q8VYH2|ERG16_ARATH Squalene epoxidase 362.100%Swiss-Prot高置信
Q9SM02拟南芥sp|Q9SM02|ERG14_ARATH Squalene epoxidase 163.200%Swiss-Prot高置信
O81000拟南芥sp|O81000|ERG15_ARATH Squalene epoxidase 2, mitochondrial60.000%Swiss-Prot高置信

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