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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G419090
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 104641638-104644914 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3185 bp · TkA01G419090|TK1151|cDNA

ATAAGAAAACATCCAACATGAGTAAAAATGATTTCTACCACCACACACATCAAAACACACTCGAAACGCACACAGTATTGCATCATTGAATACTAAGCTTTTTCTGAAAATTTCACCAACCCTTGGCACATTTATTAACTCCATCCACTCTCCACAATTTCTCCACTCACTCTTTTCACTAAAAACTGCCGAATGCTCCATTCCCAACATCTCACACCTCCTTTTTCTGGTTTATCAGCTAAAGTGTGAAGCCTTTTCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2448 bp · TkA01G419090|TK1151|CDS

ATGGGTATACATTCTTCATCTTCACAAGTTTACAATCTATCGTCGTCTGTTTGTTCATGGAAGTTTGTGTCCTGTGATGCTAAACAACAAAATGTAATTGGTCTTGTTGCTCCTAATTTGGGCCTCACTGGTCCCATTCCCGATAACACCATTGGCAAACTCAAAAAGCTTCAAATTCTTGATTTAAACAGTAACCATATCACTGATTTCTCATCTGATTTTTGGAGTTTAAGTTCGCTCACAATGCTTAATCTTTCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

815 aa · TkA01G419090|TK1151|PROTEIN

MGIHSSSSQVYNLSSSVCSWKFVSCDAKQQNVIGLVAPNLGLTGPIPDNTIGKLKKLQILDLNSNHITDFSSDFWSLSSLTMLNLSNNKFSVNLPSNIDNFVSLEKLDLSSNNFSGRLPDSFDSLPSLQVLNLNRNQFDSIVPLGIISCHSLISVDFSMNSFHGSLPDGFDSAFPKLRSLNLAGNGIKGRGSDFSKMVSLTYLNISDNLFTGSVVEIFKGPLEVVDLSSNHFEGHISQVNFSSSFNWSRLVHLDLSDNEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G419090
TK1151 IDTkA01G419090
OH-1004 IDLXL04_002812
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.767
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G419090
位置Chr01:104641638-104644914 (-)
描述Similar to At2g24230: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24230
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24230 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24230。 暂无已核实直接文献
At5g58150 可能是非活性富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g58150。 暂无已核实直接文献
At5g45800 体外可磷酸化髓磷脂碱性蛋白。
A receptor-like kinase from Arabidopsis thaliana is a calmodulin-binding protein.2004 · DOI: 10.1042/bj20031045
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002812 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24230
ath:AT5G07280
ath:AT5G58150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.846
排名 1 · TkA01G419090 · TK1151
内质网0.088
排名 2 · TkA01G419090 · TK1151
细胞质0.076
排名 3 · TkA01G419090 · TK1151
细胞核0.068
排名 4 · TkA01G419090 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA01G419090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_846-90 aa
PF23211LRR_LRWD147-115 aa
PF23598LRR_1450-140 aa
PF12799LRR_451-71 aa
PF25013LRR_Zer-151-113 aa
PF14580LRR_951-136 aa
PF24048LRR_NXF1-551-90 aa
PF12799LRR_455-90 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G419090PF13855LRR_846903.7e-33113.8
TkA01G419090PF23211LRR_LRWD1471150.0008119.9
TkA01G419090PF23598LRR_14501406.4e-1658.8
TkA01G419090PF12799LRR_451715.7e-31106.5
TkA01G419090PF25013LRR_Zer-1511130.0002721.8
TkA01G419090PF14580LRR_9511360.003117.8
TkA01G419090PF24048LRR_NXF1-551900.004117.5
TkA01G419090PF12799LRR_455905.7e-31106.5
TkA01G419090PF13516LRR_655691.3e-1144.3
TkA01G419090PF00560LRR_156761.1e-2996.7
TkA01G419090PF24758LRR_At5g56370561361e-0526.1
TkA01G419090PF07723LRR_256695.88.5
TkA01G419090PF00069Pkinase65846.3e-29101.9
TkA01G419090PF29594LRR_SKP2711350.6110.0
TkA01G419090PF23952LRR_EndoS731120.2812.1
TkA01G419090PF13516LRR_678901.3e-1144.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGK9拟南芥sp|C0LGK9|Y2242_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2423066.800%Swiss-Prot高置信
Q9LVN2拟南芥sp|Q9LVN2|Y5815_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g5815052.300%Swiss-Prot高置信
Q9FK63拟南芥sp|Q9FK63|CARLK_ARATH Calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK43.900%Swiss-Prot低置信
O22476拟南芥sp|O22476|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 139.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LJF3拟南芥sp|Q9LJF3|BRL3_ARATH Receptor-like protein kinase BRI1-like 336.500%Swiss-Prot中等置信

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