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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G383590
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 95728923-95730967 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1050 bp · TkA01G383590|TK1151|cDNA

ATGAACAAATCCGGCCGGCCAAAGCCATCAGAACATGAAGATGGGGTTGATTTTATCAGCAACTTGCCAGATCCTATTCTTCATTTGATTCTCTCGCGTGTTCCATCTTCTGAAGAAATAACCCGAACGAGCATTTTGTCCAGACGATGGAGTATGTCGATAGTAGAGAGGTGGATTCACGCAGCTGTTATGAGAAACGTCAAAAAACTTGACTTGAGTTTTTCCCCCAAGGAGGAGTCTGAGAACTTGGTGATACCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1050 bp · TkA01G383590|TK1151|CDS

ATGAACAAATCCGGCCGGCCAAAGCCATCAGAACATGAAGATGGGGTTGATTTTATCAGCAACTTGCCAGATCCTATTCTTCATTTGATTCTCTCGCGTGTTCCATCTTCTGAAGAAATAACCCGAACGAGCATTTTGTCCAGACGATGGAGTATGTCGATAGTAGAGAGGTGGATTCACGCAGCTGTTATGAGAAACGTCAAAAAACTTGACTTGAGTTTTTCCCCCAAGGAGGAGTCTGAGAACTTGGTGATACCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

349 aa · TkA01G383590|TK1151|PROTEIN

MNKSGRPKPSEHEDGVDFISNLPDPILHLILSRVPSSEEITRTSILSRRWSMSIVERWIHAAVMRNVKKLDLSFSPKEESENLVIPDCLVTCASLEVMGFPALRVLYLGYIELFDSDSVEDFLESCPLLEDLTLDEVILDDKIEYLCISCPKLKKLIFSSYSAGCLFISSPELMCMTVIGCVDIICEDLSSLKEAIIGLEPAQTCELFPGISDLESLEIELYFLYEALEGARVPALPNLKMLVLNATEVDFSVKYLKKII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G383590
TK1151 IDTkA01G383590
OH-1004 IDLXL04_003234
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.427 / OH-1004 91.410
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G383590
位置Chr01:95728923-95730967 (-)
描述Similar to At4g10400: FBD-associated F-box protein At4g10400
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003234 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G66310
ath:AT4G10400
ath:AT4G14103
ath:AT5G02700
ath:AT5G56370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.832
排名 1 · TkA01G383590 · TK1151
细胞质0.198
排名 2 · TkA01G383590 · TK1151
细胞膜0.059
排名 3 · TkA01G383590 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA01G383590 · TK1151
质体0.019
排名 5 · TkA01G383590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00646F-box19-52 aa
PF12937F-box-like19-54 aa
PF23622LRR_At1g61320_AtMIF151-279 aa
PF29594LRR_SKP252-97 aa
PF24758LRR_At5g5637055-197 aa
PF12799LRR_466-73 aa
PF12799LRR_486-110 aa
PF12799LRR_4102-134 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G383590PF00646F-box19520.0001422.3
TkA01G383590PF12937F-box-like19540.001119.4
TkA01G383590PF23622LRR_At1g61320_AtMIF1512790.0005620.1
TkA01G383590PF29594LRR_SKP252970.007816.2
TkA01G383590PF24758LRR_At5g56370551973.3e-1866.9
TkA01G383590PF12799LRR_466730.00318.5
TkA01G383590PF12799LRR_4861100.00318.5
TkA01G383590PF12799LRR_41021340.00318.5
TkA01G383590PF07723LRR_21031270.001719.6
TkA01G383590PF29594LRR_SKP21141760.007816.2
TkA01G383590PF07723LRR_21291420.001719.6
TkA01G383590PF00646F-box1481590.0001422.3
TkA01G383590PF12799LRR_41491570.00318.5
TkA01G383590PF24758LRR_At5g563702112753.3e-1866.9
TkA01G383590PF12799LRR_42132170.00318.5
TkA01G383590PF12799LRR_42352470.00318.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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