TkA01G367360 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G367360

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 91550872-91554870 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2491 bp · TkA01G367360|TK1151|cDNA

CTCGCACACCCCACAACAACAAGGCGTGCAATCACATCTTACAGAATAATTCACAGGCTTCTTTGTCAAAGTTGTGGGGTTCCAAGCAAACTACTACCCACACATACACACCTGTTCTAGACTAACCTCACCCTTCTTTTTTTAGATCAGCTTTTTTCATGTGACTCTGCTGTTATTCGATGCATTTACATATTGGTATGAGAAATTTTGGTTTTGGATGATTAAAATTGGTGAAATTGTTGATGAAGTGTGATTGTGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1887 bp · TkA01G367360|TK1151|CDS

ATGGATCGCCGGAGCTGGCTATGGCGGAGGAGGTCGTCGGAAAAAAGCCCCGGTGAAACAGAAAGCTCTGGAGGATCAGTTTCTTCTCACTCTGAGCGATTTTCTGACGATCAGATATATTCAAATCAAAGTTCTATGTCACCTGATGTCACATCAAAGTCTGAACCACCAGTGGAAGAAATCGAGGGTGGTGTCAAGACTTTATCTGAGAAACTATCAGCAGCTCTTGTGAATATCAGTATGAAGGAGGACTTGGTAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

628 aa · TkA01G367360|TK1151|PROTEIN

MDRRSWLWRRRSSEKSPGETESSGGSVSSHSERFSDDQIYSNQSSMSPDVTSKSEPPVEEIEGGVKTLSEKLSAALVNISMKEDLVKQHSKVAEEAVEGWEKAENEVLGLRQQIEVLTLRNSTLEDRVCQLDGALKECLRQLRQTREEKDQKINEIIEKKTSEWQATKSQLENQLTELRSAKKTDPFSTQKLEKENSALKLELASMAEELEIRLIERELSNQAAESASKLHLESVKKTAKLESECRKLNAALRKALIVND...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G367360`
TK1151 ID	TkA01G367360
OH-1004 ID	LXL04_030378
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	31.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.930 / OH-1004 85.880 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G367360

位置 Chr01:91550872-91554870 (-)

描述 Similar to FPP: Filament-like plant protein (Fragment)

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g05270`	与COG2和FPP2/VETH2形成复合物，在木质部细胞次生细胞壁沉积过程中，通过招募EXO70A1，将胞吐复合体（exocyst）组分招募至皮层微管，确保正确的次生细胞壁（SCW）沉积模式。	暂无已核实直接文献
`At1g77580`	似丝状植物蛋白1。	暂无已核实直接文献
`At1g21810`	与FPP3/VETH1和COG2形成复合物，在木质部细胞次生细胞壁沉积过程中，通过招募EXO70A1，将胞吐复合体（exocyst）组分招募至皮层微管，确保正确的次生细胞壁（SCW）沉积模式。	暂无已核实直接文献
`At1g19835`	类丝状植物蛋白 4。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030378 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0060178 regulation of exocyst localization 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0031410 cytoplasmic vesicle 细胞组分

GO:0030674 protein-macromolecule adaptor activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G21810

ath:AT1G77580

ath:AT3G05270

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.573

排名 1 · TkA01G367360 · TK1151

细胞膜0.254

排名 2 · TkA01G367360 · TK1151

细胞核0.247

排名 3 · TkA01G367360 · TK1151

高尔基体0.058

排名 4 · TkA01G367360 · TK1151

质体0.052

排名 5 · TkA01G367360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05911FPP22-46 aa

PF23649FKBP1553-210 aa

PF30679CCDC18_2nd53-243 aa

PF30828CEP83_CC_1st53-181 aa

PF25764KIF21A_4th54-206 aa

PF24161CCDC3958-250 aa

PF06818Fez158-122 aa

PF27605ODF2_C62-146 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G367360	`PF05911`	FPP	22	46	2.2e-74	251.9
TkA01G367360	`PF23649`	FKBP15	53	210	0.00035	21.0
TkA01G367360	`PF30679`	CCDC18_2nd	53	243	0.91	8.3
TkA01G367360	`PF30828`	CEP83_CC_1st	53	181	1.5	8.6
TkA01G367360	`PF25764`	KIF21A_4th	54	206	0.11	12.9
TkA01G367360	`PF24161`	CCDC39	58	250	0.0024	16.5
TkA01G367360	`PF06818`	Fez1	58	122	0.004	18.4
TkA01G367360	`PF27605`	ODF2_C	62	146	0.0049	16.8
TkA01G367360	`PF10534`	CRIC_ras_sig	66	108	6.6	7.7
TkA01G367360	`PF05911`	FPP	82	179	2.2e-74	251.9
TkA01G367360	`PF00261`	Tropomyosin	91	255	0.00034	20.8
TkA01G367360	`PF05266`	DUF724	99	168	4.3	7.9
TkA01G367360	`PF06818`	Fez1	134	271	0.004	18.4
TkA01G367360	`PF27605`	ODF2_C	140	253	0.0049	16.8
TkA01G367360	`PF13801`	Metal_resist	147	199	1.3	9.9
TkA01G367360	`PF22937`	PDXDC1-like_cen2	158	211	0.14	13.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9MA92`	拟南芥	sp\|Q9MA92\|FPP3_ARATH Filament-like plant protein 3	34.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9CAP9`	拟南芥	sp\|Q9CAP9\|FPP1_ARATH Filament-like plant protein 1	42.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SFF4`	拟南芥	sp\|Q9SFF4\|FPP2_ARATH Filament-like plant protein 2	36.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q0WSY2`	拟南芥	sp\|Q0WSY2\|FPP4_ARATH Filament-like plant protein 4	36.100%	Swiss-Prot	低置信

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