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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G365090
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 90977521-90988054 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2389 bp · TkA01G365090|TK1151|cDNA

AAAGCATCCATTTTTCTCACAAAAAGATTGCTTTTGTTTTCATGATGAGTGGATTCTCACTCTCACACACATTCTTCGACATTCAACTTGCCTCATCAAATCATATTTCAGAACGAATTAGAATTAGAATTGGAATTTCTTCCCTAATTTAAGTTCCTATTCCATTCCAATTCCAATTATATGCCCTAATGCTTTGTGGGTCCTCAACACTTACACAAACATCATCAATCACAAACATCAATAAACCTTCAAATCATGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1902 bp · TkA01G365090|TK1151|CDS

ATGTTTCTTGTTTCATCCTCTTCTCCACCATCCATGGCTACACCAGACTCATCCAGGAAATGCAAAGGCAGATCCGGAGACCATCAGTTGGACACTAAATTGACTCATTTATATGGACTCATTCACTATTCGCATCTCCATACGAAGTTATTGGTTCAATGCATCATCCTGCTTTTGCTTTTGAGTCATAGTTATTCAGACAATAAGCCTGACATCGAAGGAGAAGTTTTGATCGAGCTTCTAAAGGATCTAAATGACAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

633 aa · TkA01G365090|TK1151|PROTEIN

MFLVSSSSPPSMATPDSSRKCKGRSGDHQLDTKLTHLYGLIHYSHLHTKLLVQCIILLLLLSHSYSDNKPDIEGEVLIELLKDLNDTNGNIQDWNYFFVSPCYSWSHVICDHREGNVISLSLGSIGFSGTLSSSITKLKFLTKLDLHDNNLSGELPDLSSLVNLQILNLTQNKFSGSIPVSWGQLSNLKYLDLSSNNLSGKIPEKLFSTRVFNFTGTHLECGTSVPQPCISGSSVSGSTKNSKMKFVTFGVGCAALVLLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G365090
TK1151 IDTkA01G365090
OH-1004 IDLXL04_003390
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G365090
位置Chr01:90977521-90988054 (-)
描述Similar to At5g63710: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g63710
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g63710 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g63710。 暂无已核实直接文献
At5g65240 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g65240。 暂无已核实直接文献
At5g10290 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g10290。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0283800 可能通过油菜素甾醇（BR）信号通路参与调控植物生长。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003390 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G10290
ath:AT5G63710
ath:AT5G65240
dosa:Os02g0283800
osa:4329032
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.851
排名 1 · TkA01G365090 · TK1151
内质网0.093
排名 2 · TkA01G365090 · TK1151
细胞质0.078
排名 3 · TkA01G365090 · TK1151
细胞核0.055
排名 4 · TkA01G365090 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA01G365090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30276Arminin56-94 aa
PF08263LRRNT_273-111 aa
PF23211LRR_LRWD1115-196 aa
PF00560LRR_1117-138 aa
PF12799LRR_4117-159 aa
PF23598LRR_14130-196 aa
PF24141LRR_ComC135-183 aa
PF25013LRR_Zer-1136-199 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G365090PF30276Arminin56940.1313.0
TkA01G365090PF08263LRRNT_2731116.5e-0627.0
TkA01G365090PF23211LRR_LRWD11151960.05713.8
TkA01G365090PF00560LRR_11171383.5e-0935.7
TkA01G365090PF12799LRR_41171595e-0833.6
TkA01G365090PF23598LRR_141301960.0004719.7
TkA01G365090PF24141LRR_ComC1351830.05413.9
TkA01G365090PF25013LRR_Zer-11361990.3111.9
TkA01G365090PF13516LRR_61391540.0009719.7
TkA01G365090PF00560LRR_11411573.5e-0935.7
TkA01G365090PF12799LRR_41411755e-0833.6
TkA01G365090PF13855LRR_81411983.7e-0730.5
TkA01G365090PF00560LRR_11631853.5e-0935.7
TkA01G365090PF12799LRR_41632035e-0833.6
TkA01G365090PF13516LRR_61631760.0009719.7
TkA01G365090PF23211LRR_LRWD11822060.05713.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W4S5拟南芥sp|Q8W4S5|Y5371_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g6371061.800%Swiss-Prot高置信
C0LGX1拟南芥sp|C0LGX1|Y5524_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g6524055.500%Swiss-Prot高置信
C0LGT1拟南芥sp|C0LGT1|Y5129_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g1029055.600%Swiss-Prot高置信
Q6K4T4水稻sp|Q6K4T4|SERK4_ORYSJ LRR receptor kinase SERK257.700%Swiss-Prot高置信
B8BB68水稻sp|B8BB68|BAK1_ORYSI LRR receptor kinase BAK149.500%Swiss-Prot中等置信

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