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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G319450
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 79289912-79290669 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

651 bp · TkA01G319450|TK1151|cDNA

ATGGCCGCCACCTTACCGACGAAGGAGTATCGGGTTTTGGGTCGGAGCTTTAGCTTGAACCCAGGTCCGTTTAACATGAGCTTTGGAGCGTTACACGAGAAGGAGACGAAAGCAGAAGGAATGACTCGAATGAGATTCTTCATGATCTTCTTAATCGCAAGCTTCGTATATTACGTATTTCCCGGTTACCTTTTCCCAATTTTGACTTTCTTCTCGTGGGTATGTTGGACATTTATGCACAGTATCACCGCCCAGCAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

651 bp · TkA01G319450|TK1151|CDS

ATGGCCGCCACCTTACCGACGAAGGAGTATCGGGTTTTGGGTCGGAGCTTTAGCTTGAACCCAGGTCCGTTTAACATGAGCTTTGGAGCGTTACACGAGAAGGAGACGAAAGCAGAAGGAATGACTCGAATGAGATTCTTCATGATCTTCTTAATCGCAAGCTTCGTATATTACGTATTTCCCGGTTACCTTTTCCCAATTTTGACTTTCTTCTCGTGGGTATGTTGGACATTTATGCACAGTATCACCGCCCAGCAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

216 aa · TkA01G319450|TK1151|PROTEIN

MAATLPTKEYRVLGRSFSLNPGPFNMSFGALHEKETKAEGMTRMRFFMIFLIASFVYYVFPGYLFPILTFFSWVCWTFMHSITAQQIGFARFTATLTHVALFHGGDVWKQSRFAAHNVKLDIHAKLMKTYKQVPQWWYLVLLLGSIALSLVMCFVWKEDVQLPWWGFLFAFFLAWIVTLPIGVIQATTNQQPGYDIIAQFIIGYQSLKNSNWIMLP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G319450
TK1151 IDTkA01G319450
OH-1004 IDLXL04_034732
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)43.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.444 / OH-1004 53.992
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G319450
位置Chr01:79289912-79290669 (-)
描述Similar to OPT3: Oligopeptide transporter 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16370 可能以能量依赖性方式参与四肽和五肽跨细胞膜的易位。
AtOPT3, a member of the oligopeptide transporter family, is essential for embryo development in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.005629
Expression profiles of Arabidopsis thaliana in mineral deficiencies reveal novel transporters involved in metal homeostasis.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m309338200
At4g10770 以能量依赖性方式参与四肽和五肽穿过细胞膜的易位。
AtOPT6 transports glutathione derivatives and is induced by primisulfuron.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.039859
At4g27730 以能量依赖性方式参与四肽和五肽穿过细胞膜的易位。
AtOPT6 transports glutathione derivatives and is induced by primisulfuron.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.039859
At5g53510 可能以能量依赖性方式参与四肽和五肽跨细胞膜的易位。 暂无已核实直接文献
At5g64410 以能量依赖性方式参与四肽和五肽穿过细胞膜的易位。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034732 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0030003 intracellular monoatomic cation homeostasis 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:1990388 xylem-to-phloem iron transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0035673 oligopeptide transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0046915 transition metal ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09930
ath:AT4G10770
ath:AT4G16370
ath:AT4G26590
ath:AT5G64410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.483
排名 1 · TkA01G319450 · TK1151
细胞膜0.197
排名 2 · TkA01G319450 · TK1151
溶酶体／液泡0.168
排名 3 · TkA01G319450 · TK1151
高尔基体0.069
排名 4 · TkA01G319450 · TK1151
细胞质0.066
排名 5 · TkA01G319450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03169OPT5-26 aa
PF11785Aft1_OSA15-36 aa
PF03169OPT30-87 aa
PF09685MamF_MmsF38-85 aa
PF13567DUF413149-81 aa
PF03169OPT88-204 aa
PF13567DUF4131135-177 aa
PF09685MamF_MmsF141-200 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G319450PF03169OPT5265e-40138.5
TkA01G319450PF11785Aft1_OSA15360.2712.4
TkA01G319450PF03169OPT30875e-40138.5
TkA01G319450PF09685MamF_MmsF38850.005517.8
TkA01G319450PF13567DUF413149810.4910.8
TkA01G319450PF03169OPT882045e-40138.5
TkA01G319450PF13567DUF41311351770.4910.8
TkA01G319450PF09685MamF_MmsF1412000.005517.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O23482拟南芥sp|O23482|OPT3_ARATH Oligopeptide transporter 337.300%Swiss-Prot中等置信
O82485拟南芥sp|O82485|OPT7_ARATH Oligopeptide transporter 733.000%Swiss-Prot中等置信
Q9T095拟南芥sp|Q9T095|OPT6_ARATH Oligopeptide transporter 633.400%Swiss-Prot中等置信
Q9FJD2拟南芥sp|Q9FJD2|OPT9_ARATH Oligopeptide transporter 949.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FME8拟南芥sp|Q9FME8|OPT4_ARATH Oligopeptide transporter 445.300%Swiss-Prot中等置信

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