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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G164070
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 41874152-41875429 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1158 bp · TkA01G164070|TK1151|cDNA

TTTGTTGTCTACATCATATATTATAATATTTATTTGCAGAGGATGAGGATGGAGATGGAGATGGAAACCACCACCACCACCGCCGCATCCACAGAGGCTGCGGCAAAGAAGACACTTTTACTCTTGAATACTATCTTGCTATCCATCGGAGTCTGCGGTGGTCCATTGATCATGCGGCTCTACTTCATCCACGGTGGCAACCGCATCTGGCTGTCATCTTTCCGGCCTCCAAGCTTGCGGATGGCCGGTCATCGTTCTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

663 bp · TkA01G164070|TK1151|CDS

ATGCGTCCAAGATTGCTCTTCTCGGTGGCGTTTATTGGTGTCCTCAATGGCGTAGACAACTACCTCTACGCACACGGCGTCAGCCGCCTCCCGGTTTCTACCTCCGCCCTCATCATAGCTTCCCAACTCGCTTTCACAGCCTTCTTCGCTTTCCTTCTCGTGAAACAGAAATTCACAGCCTATTCAATCAACGCGGTTGTACTTTTGACTGCTGGGTCGGCGGTCCTAGCATTGCATACAGACAGTGACCGGCCGGAGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

220 aa · TkA01G164070|TK1151|PROTEIN

MRPRLLFSVAFIGVLNGVDNYLYAHGVSRLPVSTSALIIASQLAFTAFFAFLLVKQKFTAYSINAVVLLTAGSAVLALHTDSDRPEGETKKQYLIGFLMTVAASLLYGFLLPLTELTYNKAKQEITYTLVLEFQTVMCLFAAMFSTVGMVINNDFKVIPREATEFELGKTEYYVILCLSAIFWQCFFLGVIGVIFCASSLLSGIIISVFLPVTEVREVSS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G164070
TK1151 IDTkA01G164070
OH-1004 IDLXL04_031136
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.091 / OH-1004 58.289
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G164070
位置Chr01:41874152-41875429 (-)
描述Similar to PUP3: Purine permease 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28220 可能参与花粉萌发和花管伸长过程中嘌呤衍生物的运输。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At1g28230 质子偶联嘌呤转运蛋白介导腺嘌呤和反式玉米素摄取。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
Recycling of pyridoxine (vitamin B6) by PUP1 in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12195
At2g33750 介导腺嘌呤转运。
Transport of cytokinins mediated by purine transporters of the PUP family expressed in phloem, hydathodes, and pollen of Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01700.x
At2g24220 可能的嘌呤通道蛋白 5。 暂无已核实直接文献
At4g18205 可能的嘌呤通透蛋白22。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031136 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006863 purine nucleobase transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005345 purine nucleobase transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015211 purine nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28220
ath:AT1G28230
ath:AT2G33750
ath:AT4G18210
ath:AT4G18220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.382
排名 1 · TkA01G164070 · TK1151
溶酶体／液泡0.285
排名 2 · TkA01G164070 · TK1151
内质网0.173
排名 3 · TkA01G164070 · TK1151
高尔基体0.117
排名 4 · TkA01G164070 · TK1151
细胞质0.098
排名 5 · TkA01G164070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16913PUNUT3-216 aa
PF25259DUF78605-16 aa
PF00892EamA6-76 aa
PF10639TMEM23414-75 aa
PF04142Nuc_sug_transp16-109 aa
PF08449UAA31-173 aa
PF04087DUF38935-78 aa
PF10639TMEM23490-118 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G164070PF16913PUNUT32162.2e-77261.2
TkA01G164070PF25259DUF78605161.39.9
TkA01G164070PF00892EamA6761.1e-0732.9
TkA01G164070PF10639TMEM23414750.03814.8
TkA01G164070PF04142Nuc_sug_transp161097.8e-0522.7
TkA01G164070PF08449UAA311733.6e-0523.8
TkA01G164070PF04087DUF38935787.67.3
TkA01G164070PF10639TMEM234901180.03814.8
TkA01G164070PF04087DUF389901497.67.3
TkA01G164070PF25259DUF7860941151.39.9
TkA01G164070PF00892EamA951941.1e-0732.9
TkA01G164070PF04142Nuc_sug_transp1711957.8e-0522.7
TkA01G164070PF04087DUF3891942087.67.3
TkA01G164070PF25259DUF78601962141.39.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FZ95拟南芥sp|Q9FZ95|PUP3_ARATH Purine permease 360.600%Swiss-Prot高置信
Q9FZ96拟南芥sp|Q9FZ96|PUP1_ARATH Purine permease 162.500%Swiss-Prot高置信
Q94GB1拟南芥sp|Q94GB1|PUP2_ARATH Purine permease 253.700%Swiss-Prot高置信
Q9ZUH3拟南芥sp|Q9ZUH3|PUP5_ARATH Probable purine permease 536.200%Swiss-Prot中等置信
Q8RY74拟南芥sp|Q8RY74|PUP22_ARATH Probable purine permease 2239.900%Swiss-Prot中等置信

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