TkA01G113100 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G113100

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 28715499-28723991 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

5505 bp · TkA01G113100|TK1151|cDNA

TATATATAGGGTTAGGTTACAATGAGAATCACAATTATTGTGTGGTGGTTGTCACATGGTGGTTTATTGGTGGCTCAAGGATGGTGAAAATTCCACATGCAAAGTATAATGTTATAAAGAATACTGATAAATGTTGGTGTTTTAAGGTTTTAGTTTTAGCTTCAGTATTCAGAATCAAACAAGAACTAGTGTTGGATTATAAGAAGCACCCCAACCACCAAGAGGTGACTTTATACCTTATTCAAAGTATATAGTCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2916 bp · TkA01G113100|TK1151|CDS

ATGGCTTCGAAACAAGGTGGCATAAAACCTAGGAAATCGACTTCGAAGTATGCGAATACGCCGTCTTCATCAACGACTTCCTCTTCGAAACAGTTTCATGAACCGTTAGCTGAAAATCTGAGTTCTCCAGCTTCAACAGCTAGAAGCAAGCCACAGTACTCTTACTCAGAGAGTTTGCCTGTGAGTTCAGAGAGATCGAAAGAGAATGTCACGGTGACTGTCCGGTTCCGGCCTCTCAGTCCGAGGGAAATACGGCAAGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

971 aa · TkA01G113100|TK1151|PROTEIN

MASKQGGIKPRKSTSKYANTPSSSTTSSSKQFHEPLAENLSSPASTARSKPQYSYSESLPVSSERSKENVTVTVRFRPLSPREIRQGEEIAWYADGETIVRNEHTPSIAYAYDRVFGPTTTTRHVYDIAAHHVVGGAMEGVNGTIFAYGVTSSGKTHTMHGNQRSPGIIPLAVKDAFSIIQETPSREFLLRVSYLEIYNEVVNDLLNPAGQNLRIREDNQGTFVEGIKEEVVLSPAHALSLIAAGEEHRHVGSTNFNLLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G113100`
TK1151 ID	TkA01G113100
OH-1004 ID	LXL04_004775
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.764 / OH-1004 98.599 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G113100

位置 Chr01:28715499-28723991 (-)

描述 Similar to KIN7K: Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g12020`	类驱动蛋白KIN-7K，叶绿体型。	暂无已核实直接文献
`At5g06670`	类动力蛋白KIN-7L，叶绿体型。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0775400`	可能的向负端驱动电机蛋白，具有微管增强的 ATP 酶活性。	暂无已核实直接文献
`Os04g0434600`	类驱动蛋白 KIN-7E，叶绿体定位。	暂无已核实直接文献
`Os06g0206700`	类驱动蛋白 KIN-7G。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004775 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005871 kinesin complex 细胞组分

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008017 microtubule binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能

GO:0043531 ADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G12020

ath:AT5G06670

osa:9271714

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.717

排名 1 · TkA01G113100 · TK1151

细胞核0.260

排名 2 · TkA01G113100 · TK1151

细胞膜0.083

排名 3 · TkA01G113100 · TK1151

高尔基体0.060

排名 4 · TkA01G113100 · TK1151

溶酶体／液泡0.058

排名 5 · TkA01G113100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd69-206 aa

PF00225Kinesin75-388 aa

PF19697Atg11_middle165-178 aa

PF30059DIA2_191-229 aa

PF16796Microtub_bd357-391 aa

PF30059DIA2_390-420 aa

PF23204KIF21A_2nd391-418 aa

PF19697Atg11_middle399-421 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G113100	`PF16796`	Microtub_bd	69	206	8.6e-19	68.7
TkA01G113100	`PF00225`	Kinesin	75	388	1.2e-105	353.9
TkA01G113100	`PF19697`	Atg11_middle	165	178	0.02	15.8
TkA01G113100	`PF30059`	DIA2_	191	229	0.02	15.4
TkA01G113100	`PF16796`	Microtub_bd	357	391	8.6e-19	68.7
TkA01G113100	`PF30059`	DIA2_	390	420	0.02	15.4
TkA01G113100	`PF23204`	KIF21A_2nd	391	418	2.4	9.1
TkA01G113100	`PF19697`	Atg11_middle	399	421	0.02	15.8
TkA01G113100	`PF23204`	KIF21A_2nd	750	815	2.4	9.1
TkA01G113100	`PF19697`	Atg11_middle	781	815	0.02	15.8
TkA01G113100	`PF23204`	KIF21A_2nd	796	863	2.4	9.1
TkA01G113100	`PF19697`	Atg11_middle	824	862	0.02	15.8
TkA01G113100	`PF23204`	KIF21A_2nd	838	867	2.4	9.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4J8L3`	拟南芥	sp\|F4J8L3\|KN7K_ARATH Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic	65.100%	Swiss-Prot	高置信
`F4K3X8`	拟南芥	sp\|F4K3X8\|KN7L_ARATH Kinesin-like protein KIN-7L, chloroplastic	63.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q6YZ52`	水稻	sp\|Q6YZ52\|KN7D_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7D, chloroplastic	63.500%	Swiss-Prot	高置信
`B9FFA3`	水稻	sp\|B9FFA3\|KN7E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7E, chloroplastic	53.300%	Swiss-Prot	高置信
`B9FS33`	水稻	sp\|B9FS33\|KN7G_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7G	55.500%	Swiss-Prot	高置信

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