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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G100480
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 25407905-25413969 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1356 bp · TkA01G100480|TK1151|cDNA

TGGACTTCCACGTTATCCTTCCATCATCTTCTTGATAGCTCATATTGAATCTTCCAAATTTCGGGTCAGTTACTCAAATTATATGGATAGTGACATCCGAAACTGGATATAGTACCCATACAACAACACTAATAGCAAAAGCTCGCCTTCACGATTCTCGCTCTGGTTGTTTCAACTTTCACCCCCTTACAACACTCTCTCTCATCATTGATTTGGTATCTCAATGCTCAAATGCATGTTTGTCTCTTCTATTCTTTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

912 bp · TkA01G100480|TK1151|CDS

ATGAACGACCTCTTATCCAAAGCAAACAGTCCCCAAAGATGCAGTTATGGCGGTGGAGATATTGAAACGGGAAGGCAATCTGGAGAATTAGACTTGGATGAACATTTCAGGAAGGTTCAAGCCATAGAGAAAGAATTTGAGAAGCTTAATAAACTTCTAAGGAAACTACAGGACGCTCATGAAGAATCAAAATCTGTAACCAAGGCTGCTGCAATGAAAGCAATCAAGAAACGAATGGAGAATGATGTTGAAGAAGTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

303 aa · TkA01G100480|TK1151|PROTEIN

MNDLLSKANSPQRCSYGGGDIETGRQSGELDLDEHFRKVQAIEKEFEKLNKLLRKLQDAHEESKSVTKAAAMKAIKKRMENDVEEVGSVARFIKAKIQELDRENLANRQKPGCGQGTGVERSRTATTLALKKKFKSKVTGFQALRENIHQEYREVVERRVFTVTGTRADEETIDQLIETGNSEQIYQKAIQQQGRGQVIDTLAEIQERHDAVIEVERKLLELHQIFSDLSILVDAQGEILDNIETQVSSAVEHVQSGNRT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G100480
TK1151 IDTkA01G100480
OH-1004 IDLXL04_004876
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G100480
位置Chr01:25407905-25413969 (+)
描述Similar to SYP131: Putative syntaxin-131
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g08080 囊泡运输蛋白，在分泌途径中发挥作用（可能）。
Syntaxin of plant proteins SYP123 and SYP132 mediate root hair tip growth in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1093/pcp/pcu048
Concerted Action of Evolutionarily Ancient and Novel SNARE Complexes in Flowering-Plant Cytokinesis.2018 · DOI: 10.1016/j.devcel.2017.12.027
Unusual Roles of Secretory SNARE SYP132 in Plasma Membrane H+-ATPase Traffic and Vegetative Plant Growth.2019 · DOI: 10.1104/pp.19.00266
At3g03800 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g11250 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g11820 参与分泌途径的小泡转运蛋白（根据相似性推测）。
Arabidopsis SNAREs SYP61 and SYP121 coordinate the trafficking of plasma membrane aquaporin PIP2;7 to modulate the cell membrane water permeability.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127159

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0164300 参与分泌途径的小泡转运蛋白（根据相似性推测）。
The Rice Qa-SNAREs in SYP13 Subfamily Are Involved in Regulating Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis and Seed Fertility.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.898286
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004876 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0048278 vesicle docking 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0061025 membrane fusion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009504 cell plate 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11250
ath:AT1G61290
ath:AT5G08080
dosa:Os07g0164300
osa:4342474
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.663
排名 1 · TkA01G100480 · TK1151
细胞质0.273
排名 2 · TkA01G100480 · TK1151
溶酶体／液泡0.083
排名 3 · TkA01G100480 · TK1151
高尔基体0.081
排名 4 · TkA01G100480 · TK1151
内质网0.079
排名 5 · TkA01G100480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26551DUF818030-56 aa
PF00804Syntaxin31-190 aa
PF05531NPV_P1031-62 aa
PF05192MutS_III33-149 aa
PF05739SNARE34-57 aa
PF05073Baculo_p2434-85 aa
PF07303Occludin_ELL37-84 aa
PF08393DHC_N240-181 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G100480PF26551DUF818030560.08414.1
TkA01G100480PF00804Syntaxin311907e-48163.1
TkA01G100480PF05531NPV_P1031621.89.8
TkA01G100480PF05192MutS_III331490.9810.4
TkA01G100480PF05739SNARE34571.1e-2590.0
TkA01G100480PF05073Baculo_p2434851.89.2
TkA01G100480PF07303Occludin_ELL37843.39.2
TkA01G100480PF08393DHC_N2401810.0115.5
TkA01G100480PF18501REC1421550.8410.2
TkA01G100480PF14023Bestrophin-like43710.05813.7
TkA01G100480PF21109Stonustoxin_helical43660.3711.7
TkA01G100480PF20394DUF668844660.899.8
TkA01G100480PF09537DUF2383461030.4911.3
TkA01G100480PF09716ETRAMP47720.05714.1
TkA01G100480PF27707UCP01294347932.78.5
TkA01G100480PF20225DUF658451850.2711.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZU2拟南芥sp|Q8VZU2|SY132_ARATH Syntaxin-13269.400%Swiss-Prot高置信
Q9SRV7拟南芥sp|Q9SRV7|SY131_ARATH Putative syntaxin-13167.600%Swiss-Prot高置信
Q9SXB0拟南芥sp|Q9SXB0|SY125_ARATH Syntaxin-12543.500%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSD4拟南芥sp|Q9ZSD4|SY121_ARATH Syntaxin-12144.500%Swiss-Prot中等置信
Q7XIE2水稻sp|Q7XIE2|SY132_ORYSJ Syntaxin-13261.700%Swiss-Prot高置信

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