RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G099090
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 25073553-25078812 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4551 bp · TkA01G099090|TK1151|cDNA

CGAGAGAGGTTCAATATGGTTCTAGTTATAATTACGGACTTTAGAGACCACGAAATCTCTTATCATATTCCACATGCCTATGATCTTATGCCATTCCCAACCAATTTGTTTCTTGACATGGATATCCTAAAAAGTTACGAAAGATGAACCTATAGGAATACATATCCATTTGACTGAAAGGGAGTCTTCGTCGGTGAGGATTCTACATACATGGGTTACCATTAAGAATCCAGAAGGAAGTGATTATGATGCCGAGTCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2334 bp · TkA01G099090|TK1151|CDS

ATGGCTAGAACTTCTTATTATTGGCAACCAGCAGTTGTACTCCTTGCTCTGTTTCTTGTACCAATTCGAAGCTCTCATCACCATAACATCTCTCAAGAACAAACCCTTTTGAAAATCCAACACCTTCTGTATTATCCTGTCGTTCTTAGTAGCTGGAACAACGCCACTGATTTTTGTAACACTGTTCAAAGTTCATCAGTAACAGTGATTTGCTATGAAGGCGTAATAACACAGCTTCACATAATCAATGGCGATAAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

777 aa · TkA01G099090|TK1151|PROTEIN

MARTSYYWQPAVVLLALFLVPIRSSHHHNISQEQTLLKIQHLLYYPVVLSSWNNATDFCNTVQSSSVTVICYEGVITQLHIINGDKTPPLPKDFSIDTFVTTLINLRSLKVLKLVSLGLWGQVPAKISHLSSLEILNVTSNHFSGEIPPEITYLTDLQSLVLDDNNFTGWIPTRIGFLSRLSVLSMKNNSLNGLLPDSLGNLVDLRVLALSHNNFSGESPDLRDLKNLQVLELGGNSLGLEFPRVPSRIISIVLRENKFT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G099090
TK1151 IDTkA01G099090
OH-1004 IDLXL04_011496
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)41.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.654 / OH-1004 98.042
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G099090
位置Chr01:25073553-25078812 (+)
描述Similar to At1g14390: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g14390
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g03770 可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At3g03770。 暂无已核实直接文献
At1g14390 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g14390。 暂无已核实直接文献
At2g02780 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g02780。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献
At4g39110 可能的受体样蛋白激酶 At4g39110。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005496 steroid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14390
ath:AT2G02780
ath:AT3G03770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.824
排名 1 · TkA01G099090 · TK1151
内质网0.077
排名 2 · TkA01G099090 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA01G099090 · TK1151
细胞核0.057
排名 4 · TkA01G099090 · TK1151
溶酶体／液泡0.040
排名 5 · TkA01G099090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_231-60 aa
PF23598LRR_14101-311 aa
PF12799LRR_4103-114 aa
PF13855LRR_8104-143 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL21105-139 aa
PF00560LRR_1108-130 aa
PF24758LRR_At5g56370111-164 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL21128-188 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G099090PF08263LRRNT_231600.0714.1
TkA01G099090PF23598LRR_141013111.3e-1557.7
TkA01G099090PF12799LRR_41031142.5e-0834.6
TkA01G099090PF13855LRR_81041431e-1351.5
TkA01G099090PF25019LRR_R13L1-DRL211051390.01615.9
TkA01G099090PF00560LRR_11081304.7e-1759.1
TkA01G099090PF24758LRR_At5g563701111640.1212.8
TkA01G099090PF25019LRR_R13L1-DRL211281880.01615.9
TkA01G099090PF13516LRR_61291460.000321.3
TkA01G099090PF00560LRR_11321544.7e-1759.1
TkA01G099090PF12799LRR_41321662.5e-0834.6
TkA01G099090PF13516LRR_61551680.000321.3
TkA01G099090PF00560LRR_11571774.7e-1759.1
TkA01G099090PF13855LRR_81572151e-1351.5
TkA01G099090PF12799LRR_41571932.5e-0834.6
TkA01G099090PF12799LRR_41802212.5e-0834.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LFN2拟南芥sp|Q8LFN2|Y3037_ARATH Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g0377059.000%Swiss-Prot高置信
Q9M9S4拟南芥sp|Q9M9S4|Y1143_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1439040.100%Swiss-Prot中等置信
C0LGJ9拟南芥sp|C0LGJ9|Y2278_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g0278036.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SJT0拟南芥sp|Q9SJT0|Y2214_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2148034.700%Swiss-Prot低置信
Q9T020拟南芥sp|Q9T020|Y4391_ARATH Probable receptor-like protein kinase At4g3911033.200%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看