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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G045020
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 11629202-11629996 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

687 bp · TkA01G045020|TK1151|cDNA

ATGTCAAGTACATCTTTACCTTTGGTTTTGAGTTGCAAAAACTGTCCACCATGTAGCCCACCAAAATCTTCAAAGCCACACCCTCACCCATACCCTCCCTCCACCAAGCCACCGCATCATGGCGGAGGACCGAAGGTGTCACCGCCTAAAACTAAGCCACCGAAGACCCACCCACCAAAGGTTCGACCACCTATAGTCTGTCCACCACCCATTACTAGACCACCTATTGTACGGCCTCCACCGGTTACTAGACCACCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

687 bp · TkA01G045020|TK1151|CDS

ATGTCAAGTACATCTTTACCTTTGGTTTTGAGTTGCAAAAACTGTCCACCATGTAGCCCACCAAAATCTTCAAAGCCACACCCTCACCCATACCCTCCCTCCACCAAGCCACCGCATCATGGCGGAGGACCGAAGGTGTCACCGCCTAAAACTAAGCCACCGAAGACCCACCCACCAAAGGTTCGACCACCTATAGTCTGTCCACCACCCATTACTAGACCACCTATTGTACGGCCTCCACCGGTTACTAGACCACCACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

228 aa · TkA01G045020|TK1151|PROTEIN

MSSTSLPLVLSCKNCPPCSPPKSSKPHPHPYPPSTKPPHHGGGPKVSPPKTKPPKTHPPKVRPPIVCPPPITRPPIVRPPPVTRPPPIVLPPIVMPPPVIVVPPPVLPPPVVNPPVISPPVITPPVILPPPSPSYPPYTPPACPINALKLGACVDALGGLVHIGLGNPVENVCCPVLKGLLELEAAVCLCTTIRLKLLNLNIFIPLALQVLVTCGMTPPPGFVCPPLL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G045020
TK1151 IDTkA01G045020
OH-1004 IDLXL04_018218
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 34.649 / OH-1004 25.987
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G045020
位置Chr01:11629202-11629996 (-)
描述Similar to PRP2: Repetitive proline-rich cell wall protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12490 可能的脂质转运蛋白（LTP）。
Influence of EARLI1-like genes on flowering time and lignin synthesis of Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2010.00428.x
At4g12500 可能的脂质转运蛋白（LTP）。 暂无已核实直接文献
At4g12470 可能的脂质转运蛋白（LTP）。
Priming in systemic plant immunity.2009 · DOI: 10.1126/science.1170025
Cold-inducible expression of AZI1 and its function in improvement of freezing tolerance of Arabidopsis thaliana and Saccharomyces cerevisiae.2011 · DOI: 10.1016/j.jplph.2011.01.023
Influence of EARLI1-like genes on flowering time and lignin synthesis of Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2010.00428.x
Metabolomic analysis reveals the relationship between AZI1 and sugar signaling in systemic acquired resistance of Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2016.06.016
At4g12480 可能的脂质转运蛋白（LTP）。
Cold responsive EARLI1 type HyPRPs improve freezing survival of yeast cells and form higher order complexes in plants.2007 · DOI: 10.1007/s00425-007-0611-2
The HyPRP gene EARLI1 has an auxiliary role for germinability and early seedling development under low temperature and salt stress conditions in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1425-9
Influence of EARLI1-like genes on flowering time and lignin synthesis of Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2010.00428.x
Expression of recombinant EARLI1, a hybrid proline-rich protein of Arabidopsis, in Escherichia coli and its inhibition effect to the growth of fungal pathogens and Saccharomyces cerevisiae.2012 · DOI: 10.1016/j.gene.2012.06.070

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018218 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005199 structural constituent of cell wall 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.607
排名 1 · TkA01G045020 · TK1151
内质网0.169
排名 2 · TkA01G045020 · TK1151
细胞膜0.108
排名 3 · TkA01G045020 · TK1151
细胞质0.102
排名 4 · TkA01G045020 · TK1151
质体0.043
排名 5 · TkA01G045020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14547Hydrophob_seed143-225 aa
PF00234Tryp_alpha_amyl143-224 aa
PF14368LTP_2143-224 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G045020PF14547Hydrophob_seed1432251.3e-2487.0
TkA01G045020PF00234Tryp_alpha_amyl1432249.6e-1245.7
TkA01G045020PF14368LTP_21432241.3e-0526.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SU34拟南芥sp|Q9SU34|ERLL2_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 243.900%Swiss-Prot低置信
Q9SU33拟南芥sp|Q9SU33|ERLL3_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 342.900%Swiss-Prot低置信
Q9SU35拟南芥sp|Q9SU35|ERLL1_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 143.600%Swiss-Prot低置信
Q39176拟南芥sp|Q39176|ERLI1_ARATH Lipid transfer protein EARLI 144.600%Swiss-Prot低置信

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