TkA01G041160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G041160

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 10590721-10593533 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1538 bp · TkA01G041160|TK1151|cDNA

ACAAAAACCGCCCCCAAAACTCTACACAAATTGTAAAAGCTTAAACCCTTGGATTCCATTTTCCGGCAAATCTACAACGGCCATGGACGCCGCTAAGCTAGAGCAACTAAAGGTATTTATCAGCCGGTGCAAGTCCGATCCCTCCATTCTTAGCGATCCTTCACTCTCCTTCTTCCGCGACTATCTTGAAAGCCTCGGAGCTAAACTTCCGTCATCTGCTTACAAGAGTGAATCGCAATCGAAGCCTTACGTGGTGGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1230 bp · TkA01G041160|TK1151|CDS

ATGGACGCCGCTAAGCTAGAGCAACTAAAGGTATTTATCAGCCGGTGCAAGTCCGATCCCTCCATTCTTAGCGATCCTTCACTCTCCTTCTTCCGCGACTATCTTGAAAGCCTCGGAGCTAAACTTCCGTCATCTGCTTACAAGAGTGAATCGCAATCGAAGCCTTACGTGGTGGAAGAGGACGAGGAAGTTGTTGAAGAACCTGAAGTAGAAGAGGATGAGATAATAGAATCCGACATTGAATTTGAAGGTGAAACTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

409 aa · TkA01G041160|TK1151|PROTEIN

MDAAKLEQLKVFISRCKSDPSILSDPSLSFFRDYLESLGAKLPSSAYKSESQSKPYVVEEDEEVVEEPEVEEDEIIESDIEFEGETVEPDNDPPQKMGDSSVEVSEENRDSSQEAKSKGMEAISDGKLEEAIEHLTEAILLNPTSAIMYATRASVYIKMKKPNAAIRDADAALQINPDSAKGYKSRGIALAMLGQWEKAAKDLHVASNIDFDEEISTILKKVEPNAHKIVEHRRKYDKLRKEKEERKTERERQRRRAEAK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G041160`
TK1151 ID	TkA01G041160
OH-1004 ID	LXL04_005504
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	95.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G041160

位置 Chr01:10590721-10593533 (-)

描述 Similar to At4g22670: FAM10 family protein At4g22670

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g22670`	FAM10 家族蛋白 At4g22670。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q8VWG7`	硫醇-二硫键氧化还原酶，具有还原胰岛素二硫键的活性、二硫还原酶活性、折叠酶伴侣活性和保持伴侣活性。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005504 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0051259 protein complex oligomerization 生物过程

GO:0000118 histone deacetylase complex 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分

GO:0016667 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors 分子功能

GO:0016671 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor 分子功能

GO:0030544 Hsp70 protein binding 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G17880

ath:AT4G22670

dosa:Os09g0401200

gga:418003

osa:4346999

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.725

排名 1 · TkA01G041160 · TK1151

细胞核0.453

排名 2 · TkA01G041160 · TK1151

线粒体0.058

排名 3 · TkA01G041160 · TK1151

内质网0.042

排名 4 · TkA01G041160 · TK1151

细胞膜0.037

排名 5 · TkA01G041160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18253HipN2-43 aa

PF17830STI1-HOP_DP14-24 aa

PF15442DUF462996-127 aa

PF25575TPR_BSK1_C100-178 aa

PF25524RSLD_CPSF6104-158 aa

PF07219HemY_N105-153 aa

PF29407CFAP70_TPR_C117-210 aa

PF00515TPR_1118-144 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G041160	`PF18253`	HipN	2	43	1.9e-17	63.4
TkA01G041160	`PF17830`	STI1-HOP_DP	14	24	3.4e-13	50.0
TkA01G041160	`PF15442`	DUF4629	96	127	8.6	7.3
TkA01G041160	`PF25575`	TPR_BSK1_C	100	178	1.8e-05	25.3
TkA01G041160	`PF25524`	RSLD_CPSF6	104	158	0.034	15.1
TkA01G041160	`PF07219`	HemY_N	105	153	1.9	9.3
TkA01G041160	`PF29407`	CFAP70_TPR_C	117	210	0.0014	18.9
TkA01G041160	`PF00515`	TPR_1	118	144	1.4e-13	50.7
TkA01G041160	`PF13181`	TPR_8	118	144	2e-07	31.3
TkA01G041160	`PF07719`	TPR_2	119	144	1.3e-13	50.6
TkA01G041160	`PF13432`	TPR_16	119	149	2.4e-05	25.4
TkA01G041160	`PF14559`	TPR_19	122	178	1.8e-06	28.9
TkA01G041160	`PF17874`	TPR_MalT	123	143	0.012	15.6
TkA01G041160	`PF13371`	TPR_9	125	178	3.7e-10	40.4
TkA01G041160	`PF13414`	TPR_11	125	159	5.1e-09	36.4
TkA01G041160	`PF13428`	TPR_14	125	149	0.00019	22.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93YR3`	拟南芥	sp\|Q93YR3\|F10AL_ARATH FAM10 family protein At4g22670	54.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8VWG7`	拟南芥	sp\|Q8VWG7\|TDX_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TDX	56.300%	Swiss-Prot	中等置信

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