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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G019160
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 4892608-4898191 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1555 bp · TkA01G019160|TK1151|cDNA

GTTTCCTTCTCTCCAATTTTCATTTTCCCCCCTCATTAGTCAATTTCAACATAATTCAACAAGTTTCCACACAACTCCATGCCTCTTAACTTTCTATTTGACTTCCATTGTTTTCTTCCCCAAATTACGATTAGAAACCGCCTAAATTAATCCTTTTTCATTCTTCCGATCTGTCCTACTCTTTCAACTGTTATAAATTCAGACACTATATATCCACCCACTAAATCATCTCTCTCTCTGCTCCATAGATTCCGGCGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1044 bp · TkA01G019160|TK1151|CDS

ATGGCGCCGCCTTTGTGTATATTGGTGACTGGTGGTGCCGGATATATAGGGAGTCACACGGTGTTGCAGCTGTTGTTTGACGGGTATAAGGCGGTGGTGGTTGATAATCTTGATAATTCATCTGAAGTCGCTATTAGTCGAGTTCAAGAACTCGCCGGTGATCGTGCCCATAATTTATCTTTTCACAAGATGGACATCCGGGATAAGCCTGCATTAGAGCAGCTATTTGCTTCAACAAAGTTTGATGTTGTTATACATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

347 aa · TkA01G019160|TK1151|PROTEIN

MAPPLCILVTGGAGYIGSHTVLQLLFDGYKAVVVDNLDNSSEVAISRVQELAGDRAHNLSFHKMDIRDKPALEQLFASTKFDVVIHLAGLKAVGESVKKPLMYYNNNIIGTITLLEVMASYGCKKLVFSSSATVYGVPKEVPCTEEFPLSAVNPYGRTKLMIEEICRDIYTSDPEWKIILLRYFNPIGAHSSGKMGEDPHGTPNNLMPFVQQVAVGRRPKLQVFGTDYSTKDGTGVRDYIHVVDLADGHVAALRKLSDTN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G019160
TK1151 IDTkA01G019160
OH-1004 IDLXL04_005751
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)89.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G019160
位置Chr01:4892608-4898191 (+)
描述Similar to UDP-glucose 4-epimerase GEPI48
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10960 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025
At4g23920 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
UDP-glucose 4-epimerase isoforms UGE2 and UGE4 cooperate in providing UDP-galactose for cell wall biosynthesis and growth of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.049619
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025
At1g64440 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Galactose biosynthesis in Arabidopsis: genetic evidence for substrate channeling from UDP-D-galactose into cell wall polymers.2002 · DOI: 10.1016/s0960-9822(02)01260-5
Growth regulators and the control of nucleotide sugar flux.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019661
The reb1-1 mutation of Arabidopsis. Effect on the structure and localization of galactose-containing cell wall polysaccharides.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.074997
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
UDP-glucose 4-epimerase isoforms UGE2 and UGE4 cooperate in providing UDP-galactose for cell wall biosynthesis and growth of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.049619
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0595100 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005751 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005996 monosaccharide metabolic process 生物过程
GO:0006012 galactose metabolic process 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009969 xyloglucan biosynthetic process 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0042546 cell wall biogenesis 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005795 Golgi stack 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003978 UDP-glucose 4-epimerase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64440
ath:AT4G10960
ath:AT4G23920
dosa:Os05g0595100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.684
排名 1 · TkA01G019160 · TK1151
细胞核0.246
排名 2 · TkA01G019160 · TK1151
过氧化物酶体0.110
排名 3 · TkA01G019160 · TK1151
线粒体0.105
排名 4 · TkA01G019160 · TK1151
细胞膜0.055
排名 5 · TkA01G019160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00106adh_short6-94 aa
PF01370Epimerase7-269 aa
PF02719Polysacc_synt_27-189 aa
PF04321RmlD_sub_bind7-168 aa
PF08659KR7-92 aa
PF05368NmrA7-131 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd8-331 aa
PF010733Beta_HSD8-165 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G019160PF00106adh_short6941.2e-0628.8
TkA01G019160PF01370Epimerase72692.5e-58198.1
TkA01G019160PF02719Polysacc_synt_271893.1e-1763.4
TkA01G019160PF04321RmlD_sub_bind71683.5e-1246.7
TkA01G019160PF08659KR7925.4e-0627.2
TkA01G019160PF05368NmrA71310.01915.3
TkA01G019160PF16363GDP_Man_Dehyd83313.6e-70237.8
TkA01G019160PF010733Beta_HSD81658.3e-1761.8
TkA01G019160PF07993NAD_binding_491686.9e-0626.1
TkA01G019160PF13460NAD_binding_10111794.7e-0524.1
TkA01G019160PF13649Methyltransf_2540930.0315.7
TkA01G019160PF13847Methyltransf_3141950.00916.5
TkA01G019160PF13649Methyltransf_252182300.0315.7
TkA01G019160PF010733Beta_HSD2282608.3e-1761.8
TkA01G019160PF13649Methyltransf_252392560.0315.7
TkA01G019160PF04321RmlD_sub_bind2422873.5e-1246.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SN58拟南芥sp|Q9SN58|UGE5_ARATH UDP-glucose 4-epimerase 578.200%Swiss-Prot高置信
Q9T0A7拟南芥sp|Q9T0A7|UGE2_ARATH UDP-glucose 4-epimerase 278.200%Swiss-Prot高置信
Q9C7W7拟南芥sp|Q9C7W7|UGE4_ARATH UDP-glucose 4-epimerase 477.400%Swiss-Prot高置信
Q8LNZ3水稻sp|Q8LNZ3|UGE1_ORYSJ UDP-glucose 4-epimerase 178.500%Swiss-Prot高置信

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