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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_039198
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 62086972-62091435 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1935 bp · LXL04_039198|LXL04_039198|OH1004|cDNA

ATGCTGGTGTTACCTAATAAAATAATAGGACCATTTCAAAGCGACGTTCTCGGTAGTGAGAGAGAGGCCTGCGCCCGGGTGAGGGGGGGTGTTTGGCTCAGTTTTCTCTCTCTTCCTGACGCTCCCAGAGACGTATCAACCCAATCGATGGCGAAGCAGCCGATGGTAGCAGTAGTAGACGGCATTGTCACCGACAAGGGTGGTCTACTACCGTACCTCCTTCTCCTTATGCTCGTTTTGATCCTCATCATTATTCTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1935 bp · LXL04_039198|LXL04_039198|OH1004|CDS

ATGCTGGTGTTACCTAATAAAATAATAGGACCATTTCAAAGCGACGTTCTCGGTAGTGAGAGAGAGGCCTGCGCCCGGGTGAGGGGGGGTGTTTGGCTCAGTTTTCTCTCTCTTCCTGACGCTCCCAGAGACGTATCAACCCAATCGATGGCGAAGCAGCCGATGGTAGCAGTAGTAGACGGCATTGTCACCGACAAGGGTGGTCTACTACCGTACCTCCTTCTCCTTATGCTCGTTTTGATCCTCATCATTATTCTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

644 aa · LXL04_039198|LXL04_039198|OH1004|PROTEIN

MLVLPNKIIGPFQSDVLGSEREACARVRGGVWLSFLSLPDAPRDVSTQSMAKQPMVAVVDGIVTDKGGLLPYLLLLMLVLILIIILIACRPWRFFARSYRSRTIKTTTSSDVEDVERPLISQDSHAVESNINDQHRVSSSEHPCHQTHSSSQKHKHRLPPRPPQLSQGDSLILDISDPCEGVVVGQTLKRPVVINESAGTNHDLSNKSRIRSDNDTSKPTADQRSILTLEVISGPSSGTHYSIQSTNKAKLPLTLGRVSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_039198
TK1151 IDTkA04G514880
OH-1004 IDLXL04_039198
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 54.969
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_039198
位置Chr09:62086972-62091435 (+)
描述Similar to KAPP: Protein phosphatase 2C 70
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g19280 使 Ser/Thr 受体样激酶 RLK5 去磷酸化。
The Arabidopsis kinase-associated protein phosphatase controls internalization of the somatic embryogenesis receptor kinase 1.2002 · DOI: 10.1101/gad.220402
The Arabidopsis SERK1 protein interacts with the AAA-ATPase AtCDC48, the 14-3-3 protein GF14lambda and the PP2C phosphatase KAPP.2005 · DOI: 10.1007/s00425-004-1447-7
The Arabidopsis kinase-associated protein phosphatase regulates adaptation to Na+ stress.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.109009
A possible role for kinase-associated protein phosphatase in the Arabidopsis CLAVATA1 signaling pathway.1997 · DOI: 10.1073/pnas.94.19.10467
Control of meristem development by CLAVATA1 receptor kinase and kinase-associated protein phosphatase interactions 1998 · DOI: 10.1104/pp.117.4.1217

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0149800 可能的蛋白磷酸酶2C 10。 暂无已核实直接文献
Os04g0659500 可能为蛋白磷酸酶2C 45。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039198 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:1902531 regulation of intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004721 phosphoprotein phosphatase activity 分子功能
GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能
GO:0019901 protein kinase binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0050408 [pyruvate kinase]-phosphatase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G19280
ddi:DDB_G0279461
ddi:DDB_G0282105
dosa:Os02g0149800
dosa:Os04g0659500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.311
排名 1 · LXL04_039198 · OH-1004
细胞膜0.238
排名 2 · LXL04_039198 · OH-1004
细胞核0.232
排名 3 · LXL04_039198 · OH-1004
内质网0.208
排名 4 · LXL04_039198 · OH-1004
高尔基体0.169
排名 5 · LXL04_039198 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00498.32FHA254-329 aa
PF00481.27PP2C377-628 aa
PF13672.12PP2C_2405-523 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_039198PF00498.32FHA2543291.1e-1352.0
LXL04_039198PF00481.27PP2C3776285e-44151.6
LXL04_039198PF13672.12PP2C_24055232.2e-0628.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P46014拟南芥Protein phosphatase 2C 7051.832%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q67UX7水稻Probable protein phosphatase 2C 1031.698%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q7XR06水稻Probable protein phosphatase 2C 4531.273%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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