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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031159
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 1413644-1415918 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2082 bp · LXL04_031159|LXL04_031159|OH1004|cDNA

ATGCTTCAGATTTTGATAATTGGGTTCGTGACTGGTACCCAACGTAACCGCATATGTTCCAACAAATGTGGAAATGTTCCCATACCTTACCCTTTCGGAATTGAAGAAGGCTGCTACCTAGACGAGTCTTACTACATAGAATGCAACCCCACTACACAAATTCCACACTTGAACGTTTCTCGCATCTTTCCGCAACCTTTTGAATTCCTCTCTCATCCTCTAGAAGTTCTTGAGATAGATATAAACGGCAACCTTAGAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2082 bp · LXL04_031159|LXL04_031159|OH1004|CDS

ATGCTTCAGATTTTGATAATTGGGTTCGTGACTGGTACCCAACGTAACCGCATATGTTCCAACAAATGTGGAAATGTTCCCATACCTTACCCTTTCGGAATTGAAGAAGGCTGCTACCTAGACGAGTCTTACTACATAGAATGCAACCCCACTACACAAATTCCACACTTGAACGTTTCTCGCATCTTTCCGCAACCTTTTGAATTCCTCTCTCATCCTCTAGAAGTTCTTGAGATAGATATAAACGGCAACCTTAGAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

693 aa · LXL04_031159|LXL04_031159|OH1004|PROTEIN

MLQILIIGFVTGTQRNRICSNKCGNVPIPYPFGIEEGCYLDESYYIECNPTTQIPHLNVSRIFPQPFEFLSHPLEVLEIDINGNLRVNLPIVYRCYSKSGETISGPTTEISTSRFPISSTENRFMGVGCDVEANIGVHNPTMVTKCLLDCNYFHGAIKNGSCMGRGCCQASIPPGTTYAGIYISLPENKTTVWNETRCGYAFIVEKDEYKFDNSELRTMPNNVSFPVSLDWSVGSTRCEVAQMDKVNYMCHENSVCYHGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031159
TK1151 IDTkA08G090230
OH-1004 IDLXL04_031159
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031159
位置Chr07:1413644-1415918 (-)
描述Similar to WAK3: Wall-associated receptor kinase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g21240 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21270 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21230 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。 暂无已核实直接文献
At1g21210 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。
Antisense expression of a cell wall-associated protein kinase, WAK4, inhibits cell elongation and alters morphology.2001 · DOI: 10.1105/tpc.13.6.1317
At1g21250 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可能充当细胞外基质成分的信号传导受体。
Oxygen-evolving enhancer protein 2 is phosphorylated by glycine-rich protein 3/wall-associated kinase 1 in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1016/s0006-291x(03)00851-9
Aluminum-induced gene expression and protein localization of a cell wall-associated receptor kinase in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.022129

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031159 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009311 oligosaccharide metabolic process 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009992 intracellular water homeostasis 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21210
ath:AT1G21230
ath:AT1G21240
ath:AT1G21250
ath:AT1G21270
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.880
排名 1 · LXL04_031159 · OH-1004
细胞质0.082
排名 2 · LXL04_031159 · OH-1004
内质网0.068
排名 3 · LXL04_031159 · OH-1004
细胞核0.042
排名 4 · LXL04_031159 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · LXL04_031159 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947.12GUB_WAK_bind19-58 aa
PF07645.22EGF_CA286-328 aa
PF00069.32Pkinase414-676 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr416-678 aa
PF03109.23ABC1481-557 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031159PF13947.12GUB_WAK_bind19581.3e-0732.6
LXL04_031159PF07645.22EGF_CA2863281.4e-0629.2
LXL04_031159PF00069.32Pkinase4146761.3e-52179.5
LXL04_031159PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4166785e-49167.6
LXL04_031159PF03109.23ABC14815578.2e-0625.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMN8拟南芥Wall-associated receptor kinase 339.447%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LMP1拟南芥Wall-associated receptor kinase 238.743%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LMN7拟南芥Wall-associated receptor kinase 539.359%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LMN6拟南芥Wall-associated receptor kinase 437.573%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q39191拟南芥Wall-associated receptor kinase 137.865%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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