LXL04_030173 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030173

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 110103961-110106712 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1059 bp · LXL04_030173|LXL04_030173|OH1004|cDNA

ATGGAATTTTCTGCCTTACACTTGCACACTTCCTTTTTTCGCATGGGGTTTGAAGAAGAAGCCATCGCAGAAGGAAGGAAGGAGGTTCGATCGCGATTGCTGAATGTGAAGAGAGAGAGGCTGAATGTGTTGTTACCGGTTCGATCGCGATCGCAGAAGGAAGGAAGGAAGGAGCTTCGATCGCTGAAGGAGGTTCGATTGCTGAATGTGTTGTTACCGGTTCCTTTGTCAAATAACAAGTTTCTTCCATCTCCTCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1059 bp · LXL04_030173|LXL04_030173|OH1004|CDS

ATGGAATTTTCTGCCTTACACTTGCACACTTCCTTTTTTCGCATGGGGTTTGAAGAAGAAGCCATCGCAGAAGGAAGGAAGGAGGTTCGATCGCGATTGCTGAATGTGAAGAGAGAGAGGCTGAATGTGTTGTTACCGGTTCGATCGCGATCGCAGAAGGAAGGAAGGAAGGAGCTTCGATCGCTGAAGGAGGTTCGATTGCTGAATGTGTTGTTACCGGTTCCTTTGTCAAATAACAAGTTTCTTCCATCTCCTCTTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

352 aa · LXL04_030173|LXL04_030173|OH1004|PROTEIN

MEFSALHLHTSFFRMGFEEEAIAEGRKEVRSRLLNVKRERLNVLLPVRSRSQKEGRKELRSLKEVRLLNVLLPVPLSNNKFLPSPLFKICSSTKIPPSMAAIPTLPENLTREQYVYMAKLAEQAERYEEMVKFMEKLVVGLTPASELTVEERNLLSVAYKNVIGSLRAAWRIVSSIEQKEESRKNDDHVVLVKDYRSKVENELKDLCAGILKLLESNLVPSASSGESKVFYLKMKGDYHRYLAEFEVGDERKEAAEDAMN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030173`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030173

位置 Chr06:110103961-110106712 (-)

描述 Similar to TFT10: 14-3-3 protein 10

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g10450`	与一种结合到G盒的DNA结合复合物相关，G盒是一种在植物基因中发现的、特征明确的顺式作用DNA调控元件（通过相似性）。	暂无已核实直接文献
`At5g65430`	与一个结合到 G 盒的 DNA 结合复合物相关，G 盒是植物基因中一个研究良好的顺式作用 DNA 调控元件。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030173 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0019222 regulation of metabolic process 生物过程

GO:0045732 positive regulation of protein catabolic process 生物过程

GO:0050826 response to freezing 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G10450

ath:AT5G65430

sly:544116

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.595

排名 1 · LXL04_030173 · OH-1004

细胞核0.339

排名 2 · LXL04_030173 · OH-1004

细胞膜0.099

排名 3 · LXL04_030173 · OH-1004

内质网0.083

排名 4 · LXL04_030173 · OH-1004

高尔基体0.065

排名 5 · LXL04_030173 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00244.2714-3-3117-342 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030173	`PF00244.27`	14-3-3	117	342	2.2e-101	338.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P48349`	拟南芥	14-3-3-like protein G-BOX factor 14 lambda	85.081%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`P48348`	拟南芥	14-3-3-like protein G-BOX factor 14 kappa	83.468%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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