LXL04_027959 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_027959

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 27743659-27748817 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1752 bp · LXL04_027959|LXL04_027959|OH1004|cDNA

ATGCTAGTTCCACCGGAAACGGAACCGCAGCCGCTGGTTTTCCTCTCTCCGGCAGTTGGTTCGCCATCAGCCTCTCCTCTGCTCGTGTCCTTCTCCTTCCAGTCGCCATCATCTCCACCGGGTATAGCCGCCTTTTACAAACAACTCATCCGCGCAGTCTCGCAATTACCGAACACGCTCGACACATCTGCGATTCATCTCCGTCTGCTCGACATCTGCGACTCATCAGACATCTGCCCTCTCCGACGGTCTGAAGAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1752 bp · LXL04_027959|LXL04_027959|OH1004|CDS

ATGCTAGTTCCACCGGAAACGGAACCGCAGCCGCTGGTTTTCCTCTCTCCGGCAGTTGGTTCGCCATCAGCCTCTCCTCTGCTCGTGTCCTTCTCCTTCCAGTCGCCATCATCTCCACCGGGTATAGCCGCCTTTTACAAACAACTCATCCGCGCAGTCTCGCAATTACCGAACACGCTCGACACATCTGCGATTCATCTCCGTCTGCTCGACATCTGCGACTCATCAGACATCTGCCCTCTCCGACGGTCTGAAGAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

583 aa · LXL04_027959|LXL04_027959|OH1004|PROTEIN

MLVPPETEPQPLVFLSPAVGSPSASPLLVSFSFQSPSSPPGIAAFYKQLIRAVSQLPNTLDTSAIHLRLLDICDSSDICPLRRSEEKEPIFPGRILSGRHSSTSHAMLAFGSMIGRKFSSATSHPLRVCVVGSGPAGFYTAEKMLKAHEGAEVDIIDRLPTPFGLVRSGVAPDHPETKIVINQFSRVAHNQRCSFFGNVSLGSSVSLSDLRQFYHVVVLAYGAESDRALGIPGEELKGIHSAREFVWWYNGHPDLSNMTL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_027959`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_027959

位置 Chr06:27743659-27748817 (-)

描述 Similar to MFDR: NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g32360`	在体外与肾上腺素还蛋白样蛋白 MFDX1 结合，形成有效的低电位电子传递链，能够还原细胞色素 C。	Identification and molecular characterization of mitochondrial ferredoxins and ferredoxin reductase from Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1023/a:1025015811141

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027959 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006091 generation of precursor metabolites and energy 生物过程

GO:0006124 ferredoxin metabolic process 生物过程

GO:0006694 steroid biosynthetic process 生物过程

GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程

GO:0008203 cholesterol metabolic process 生物过程

GO:0009102 biotin biosynthetic process 生物过程

GO:0022900 electron transport chain 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004324 ferredoxin-NADP+ reductase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G32360

bta:282604

hsa:2232

rno:79122

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.475

排名 1 · LXL04_027959 · OH-1004

细胞质0.296

排名 2 · LXL04_027959 · OH-1004

质体0.162

排名 3 · LXL04_027959 · OH-1004

细胞核0.160

排名 4 · LXL04_027959 · OH-1004

过氧化物酶体0.085

排名 5 · LXL04_027959 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992.21Pyr_redox_2127-312 aa

PF13450.13NAD_binding_8130-174 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_027959	`PF07992.21`	Pyr_redox_2	127	312	1.1e-09	38.8
LXL04_027959	`PF13450.13`	NAD_binding_8	130	174	7.2e-06	26.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W3L1`	拟南芥	NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial	69.639%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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