LXL04_027422 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_027422

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 15544474-15547311 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1161 bp · LXL04_027422|LXL04_027422|OH1004|cDNA

ATGCAAGTATATGATGAGACGAATACGATTATGTCAAAGCAACATTTTATTCCCCTCTTCTCCGTATCTCACCCCACTCCCAACAAACTTCCACTACCTCCATTCGCCGGCCGCCGGCGACTTCCCTTTTCCGGTCATCCTACTCTCCATACTAAATCTGCGATCTTCTGGTCCTCGGAGAAGGATTATTGTTTGTTATATAGATATATGACGTCGGGGACAAGGCTGCCGACTTGGAAGGAGAGGGAGAACAACAAGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1161 bp · LXL04_027422|LXL04_027422|OH1004|CDS

ATGCAAGTATATGATGAGACGAATACGATTATGTCAAAGCAACATTTTATTCCCCTCTTCTCCGTATCTCACCCCACTCCCAACAAACTTCCACTACCTCCATTCGCCGGCCGCCGGCGACTTCCCTTTTCCGGTCATCCTACTCTCCATACTAAATCTGCGATCTTCTGGTCCTCGGAGAAGGATTATTGTTTGTTATATAGATATATGACGTCGGGGACAAGGCTGCCGACTTGGAAGGAGAGGGAGAACAACAAGCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

386 aa · LXL04_027422|LXL04_027422|OH1004|PROTEIN

MQVYDETNTIMSKQHFIPLFSVSHPTPNKLPLPPFAGRRRLPFSGHPTLHTKSAIFWSSEKDYCLLYRYMTSGTRLPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIFAGLRVYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWIVEEDGTTYRKGCKPATRVDANGGSGSTSASPCSSSYQPSPNTSYNLNPNSSSYPSSISSLYTNGNPDPNALIPWLKNLSSNSSSPSSNFPHHLYFPGGSGSISAPVTPPINSPTCRTPRMTDITMPGNP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_027422`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_027422

位置 Chr06:15544474-15547311 (+)

描述 Similar to BEH4: BES1/BZR1 homolog protein 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g78700`	BES1/BZR1 同源蛋白 4。	暂无已核实直接文献
`At4g18890`	BES1/BZR1同源蛋白3。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0552300`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os01g0203000`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os02g0233200`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027422 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0003677 DNA binding 分子功能

GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G78700

ath:AT4G18890

dosa:Os01g0203000

dosa:Os02g0233200

dosa:Os06g0552300

osa:9267338

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.911

排名 1 · LXL04_027422 · OH-1004

细胞质0.230

排名 2 · LXL04_027422 · OH-1004

细胞膜0.023

排名 3 · LXL04_027422 · OH-1004

线粒体0.019

排名 4 · LXL04_027422 · OH-1004

内质网0.015

排名 5 · LXL04_027422 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05687.19BES1_N73-210 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_027422	`PF05687.19`	BES1_N	73	210	2.8e-57	194.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZV88`	拟南芥	BES1/BZR1 homolog protein 4	64.776%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O49404`	拟南芥	BES1/BZR1 homolog protein 3	62.500%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q5Z9E5`	水稻	Protein BZR1 homolog 3	60.234%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q0JPT4`	水稻	Protein BZR1 homolog 2	56.342%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q6EUF1`	水稻	Protein BZR1 homolog 4	50.279%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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