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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_026865
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 4117167-4120818 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1836 bp · LXL04_026865|LXL04_026865|OH1004|cDNA

ATGACAACTTCCTTAAAGGTGGCCGTCATTGGCGCCGGTGTGGCGGGACTAACCGCCGCCCGTGAACTTCAACAGGAATCGCAAAATGTTGTGGTGTTTGAAAAGTCATACCGACTTGGTGGAACATGGGCCTATGATCCAAGAGTGGAGTCTGATCTACTAGGAGTCGACCCAAATAGAGATATTGTTCATGGATCGCTTTATAACTCTATGCGCACAAATCTTCCTCGTGAACTCATGAGCTTCACTGATTTCAAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1836 bp · LXL04_026865|LXL04_026865|OH1004|CDS

ATGACAACTTCCTTAAAGGTGGCCGTCATTGGCGCCGGTGTGGCGGGACTAACCGCCGCCCGTGAACTTCAACAGGAATCGCAAAATGTTGTGGTGTTTGAAAAGTCATACCGACTTGGTGGAACATGGGCCTATGATCCAAGAGTGGAGTCTGATCTACTAGGAGTCGACCCAAATAGAGATATTGTTCATGGATCGCTTTATAACTCTATGCGCACAAATCTTCCTCGTGAACTCATGAGCTTCACTGATTTCAAATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

611 aa · LXL04_026865|LXL04_026865|OH1004|PROTEIN

MTTSLKVAVIGAGVAGLTAARELQQESQNVVVFEKSYRLGGTWAYDPRVESDLLGVDPNRDIVHGSLYNSMRTNLPRELMSFTDFKFNEKAPRTKPEVLSEQVFGAREYRIGQIALLVTTMDDPESEASKIHSEYYEGETSEDIESEEESSEDEKAFVVDAELDDCDAEEGSSQQDFKKLFWAASMSTTESAFVGTMEELKDLNKAAYDHLMVRHPESWSRAFFPEGRACESVENGISESFNSVILEARTKPILTMLEEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_026865
TK1151 IDTkA06G194730
OH-1004 IDLXL04_026865
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.268 / OH-1004 60.720
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_026865
位置Chr06:4117167-4120818 (-)
描述Similar to At1g12160: Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12160 催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。 暂无已核实直接文献
At1g62620 催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。 暂无已核实直接文献
At1g65860 催化甲硫基烷基葡萄糖硫苷转化为甲磺酰烷基葡萄糖硫苷。 暂无已核实直接文献
At1g63370 催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。 暂无已核实直接文献
At1g63340 催化任意链长的甲硫基烷基硫代葡萄糖苷转化为甲亚磺酰基烷基硫代葡萄糖苷。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026865 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0033506 glucosinolate biosynthetic process from homomethionine 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0004499 N,N-dimethylaniline monooxygenase activity 分子功能
GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能
GO:0050661 NADP binding 分子功能
GO:0080102 3-methylthiopropyl glucosinolate S-oxygenase activity 分子功能
GO:0080103 4-methylthiopropyl glucosinolate S-oxygenase activity 分子功能
GO:0080104 5-methylthiopropyl glucosinolate S-oxygenase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12160
ath:AT1G62620
ath:AT1G63340
ath:AT1G63370
ath:AT1G65860
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.952
排名 1 · LXL04_026865 · OH-1004
细胞质0.120
排名 2 · LXL04_026865 · OH-1004
细胞膜0.021
排名 3 · LXL04_026865 · OH-1004
线粒体0.015
排名 4 · LXL04_026865 · OH-1004
内质网0.012
排名 5 · LXL04_026865 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00743.26FMO-like6-93 aa
PF01266.31DAO6-42 aa
PF07992.21Pyr_redox_26-64 aa
PF00890.31FAD_binding_27-44 aa
PF13450.13NAD_binding_89-44 aa
PF04434.23SWIM319-347 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_026865PF00743.26FMO-like6933e-0936.6
LXL04_026865PF01266.31DAO6421.8e-0731.7
LXL04_026865PF07992.21Pyr_redox_26643.1e-0627.6
LXL04_026865PF00890.31FAD_binding_27441.1e-0628.9
LXL04_026865PF13450.13NAD_binding_89443.3e-0834.4
LXL04_026865PF04434.23SWIM3193475.8e-0936.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FWW6拟南芥Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 149.107%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SXD5拟南芥Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 341.667%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SS04拟南芥Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX147.458%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C8U0拟南芥Flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 539.881%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C8T8拟南芥Putative flavin-containing monooxygenase FMO GS-OX-like 1044.516%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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