基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_023837
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 70406521-70407870
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1350 bp · LXL04_023837|LXL04_023837|OH1004|cDNA
ATGAAGTCATCGGAGTTAAAAATGAGGGAAGTTCGTGTTTACATTGCTGTCAGTGTGGTTGCTTTCGGTATATGCTTTGCAGTTGCAATATCCGCATTTTACCTGATCGTTTGCagaagggagaagaagaagaagacgaagaaaACGATGACAACCCAGAATCGTTCATCCTTCAAAAAAAGTGTAGATTTGGAGCTCCAACAGTTAAGTTTAAGCGTAAGAACTGCAAGTGAAAAGAAAGTTTCGTTCGAATCCTCCTC...
CDS
下载 CDS FASTA1350 bp · LXL04_023837|LXL04_023837|OH1004|CDS
ATGAAGTCATCGGAGTTAAAAATGAGGGAAGTTCGTGTTTACATTGCTGTCAGTGTGGTTGCTTTCGGTATATGCTTTGCAGTTGCAATATCCGCATTTTACCTGATCGTTTGCAGAAGGGAGAAGAAGAAGAAGACGAAGAAAACGATGACAACCCAGAATCGTTCATCCTTCAAAAAAAGTGTAGATTTGGAGCTCCAACAGTTAAGTTTAAGCGTAAGAACTGCAAGTGAAAAGAAAGTTTCGTTCGAATCCTCCTC...
449 aa · LXL04_023837|LXL04_023837|OH1004|PROTEIN
MKSSELKMREVRVYIAVSVVAFGICFAVAISAFYLIVCRREKKKKTKKTMTTQNRSSFKKSVDLELQQLSLSVRTASEKKVSFESSSQIESLDDHLLPTTPGKLAAVVVQSYTVEELSSATADFSSANLIEGSVYQGRLKGKSVAIKCTNPDTISKIKFDLFHTAARFHPNIMKLLGVCSGVDSFDTGEFLVFEYAKNGSLKDWIHGGLAIKSHFIASCSCLLTWNQRLKICLNIATALQFMHQIINPSYVHRNIKSRNI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_023837 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_023837 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:70406521-70407870 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to LYK2: Protein LYK2 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010089 xylem development 生物过程 GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0071323 cellular response to chitin 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G51940 ath:AT2G28250 ath:AT2G33580 ath:AT3G01840 dosa:Os08g0538300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.697
细胞核0.202
细胞质0.192
内质网0.054
高尔基体0.029
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr132-415 aaPF00069.32Pkinase132-412 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_023837 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 132 | 415 | 1.5e-28 | 100.5 |
| LXL04_023837 | PF00069.32 | Pkinase | 132 | 412 | 8.9e-27 | 94.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SGI7 | 拟南芥 | Protein LYK2 | 38.816% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O22808 | 拟南芥 | Protein LYK5 | 33.250% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4IB81 | 拟南芥 | LysM domain receptor-like kinase 3 | 32.326% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8VYY5 | 拟南芥 | Receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK | 29.977% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A0A0P0XII1 | 水稻 | Chitin elicitor receptor kinase 1 | 32.194% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |