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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_021389
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 128650517-128653346 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

729 bp · LXL04_021389|LXL04_021389|OH1004|cDNA

ATGAGTCTATCAGTTGTTCAAGGGTTTAGCAAGTCTCTTGCGATGACTGTGCTCTCTGAAATTGGCGACAAGACATTTTTCGCAGCTGCGATTTTGGCGATGCGTCATCCCAGGAGATATGTTCTGGCAGGCTGCCTTTCAGCTTTGATTGTCATGACTATTCTCTCTGCTGCTGTTGGCTGGGCTGCTCCTAACCTGATCTCGCGAACATTGACCAAGCATATCGCGACTATTTTGTTTTTAGGGTTTGGAGTTTGGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

729 bp · LXL04_021389|LXL04_021389|OH1004|CDS

ATGAGTCTATCAGTTGTTCAAGGGTTTAGCAAGTCTCTTGCGATGACTGTGCTCTCTGAAATTGGCGACAAGACATTTTTCGCAGCTGCGATTTTGGCGATGCGTCATCCCAGGAGATATGTTCTGGCAGGCTGCCTTTCAGCTTTGATTGTCATGACTATTCTCTCTGCTGCTGTTGGCTGGGCTGCTCCTAACCTGATCTCGCGAACATTGACCAAGCATATCGCGACTATTTTGTTTTTAGGGTTTGGAGTTTGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

242 aa · LXL04_021389|LXL04_021389|OH1004|PROTEIN

MSLSVVQGFSKSLAMTVLSEIGDKTFFAAAILAMRHPRRYVLAGCLSALIVMTILSAAVGWAAPNLISRTLTKHIATILFLGFGVWSLWDAFHEGESEELAEVEAELDADLQANGKTKSNGKADDDDKKKKRPLFSQFFSPIFLKAFSITFFGEWGDKSQIATIGLAAAENPLGVVLGGILGQALCQTAAVFGGKSLAKQISEKFIALSGGVLFIVFGIQSYFSTMDNPKNELESTQSELMN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_021389
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_021389
位置Chr04:128650517-128653346 (+)
描述Similar to At1g25520: GDT1-like protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g25520 GDT1样蛋白4。 暂无已核实直接文献
At1g68650 GDT1样蛋白 5。 暂无已核实直接文献
At5g36290 GDT1样蛋白 3。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0433100 GDT1样蛋白 5。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YXC7 GDT1样蛋白4。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021389 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006828 manganese ion transport 生物过程
GO:0032468 Golgi calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0032472 Golgi calcium ion transport 生物过程
GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0071421 manganese ion transmembrane transport 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0035618 root hair 细胞组分
GO:1990676 Golgi trans cisterna membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G25520
ath:AT1G68650
ath:AT5G36290
dosa:Os08g0433100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.326
排名 1 · LXL04_021389 · OH-1004
溶酶体／液泡0.253
排名 2 · LXL04_021389 · OH-1004
内质网0.205
排名 3 · LXL04_021389 · OH-1004
细胞质0.156
排名 4 · LXL04_021389 · OH-1004
细胞膜0.118
排名 5 · LXL04_021389 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01169.26GDT19-93 aa
PF01169.26GDT1143-226 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_021389PF01169.26GDT19938.3e-50167.7
LXL04_021389PF01169.26GDT11432268.3e-50167.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C6M1拟南芥GDT1-like protein 474.890%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SX28拟南芥GDT1-like protein 574.667%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q93Y38拟南芥GDT1-like protein 344.091%Swiss-Prot中等数据库同源证据
B9G125水稻GDT1-like protein 569.787%Swiss-Prot强数据库同源证据
A2YXC7水稻GDT1-like protein 445.249%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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