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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012152
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 7388840-7406388 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4320 bp · LXL04_012152|LXL04_012152|OH1004|cDNA

ATGGCGACTGAGAAGGAAAGAAGTGAATTTGATACAGGAGGGGCAGACCTCGGTAGTCCAATCGAGTCCAGAAGGATGGCAGAGATGGATGAATTCGATTTCATGGGTAGATGGAGTAATGATGTTAATGGCGTCGATGTGAGAGCAGCGATTGATGGAGTTATGGCGTGCAGCTGGTTTATGCTTATAAGAACCATGAACATGACAAGTGGCATTTTGGATTGTGAGTGTGCCACATATGTGGAAACAGGATTAAAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

4320 bp · LXL04_012152|LXL04_012152|OH1004|CDS

ATGGCGACTGAGAAGGAAAGAAGTGAATTTGATACAGGAGGGGCAGACCTCGGTAGTCCAATCGAGTCCAGAAGGATGGCAGAGATGGATGAATTCGATTTCATGGGTAGATGGAGTAATGATGTTAATGGCGTCGATGTGAGAGCAGCGATTGATGGAGTTATGGCGTGCAGCTGGTTTATGCTTATAAGAACCATGAACATGACAAGTGGCATTTTGGATTGTGAGTGTGCCACATATGTGGAAACAGGATTAAAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1439 aa · LXL04_012152|LXL04_012152|OH1004|PROTEIN

MATEKERSEFDTGGADLGSPIESRRMAEMDEFDFMGRWSNDVNGVDVRAAIDGVMACSWFMLIRTMNMTSGILDCECATYVETGLKKRYKTVGPVTANIQEKKGSKGKKTKVSAYCLSEKEKNLERKESAAHGGRNPQSRLYRLLSGNEKHLKFTSDIFVVNFSVCFEARAFEMRKLLGICLFLLAAHVIIVKSLNPTLDDDVLGLIVFKADLQDPDGKLVSWNEDDDSPCKWKGVKCNPRSNRVSDLVLDGFGLSGKMG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012152
TK1151 IDTkA02G585150
OH-1004 IDLXL04_012152
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 67.616
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012152
位置Chr03:7388840-7406388 (+)
描述Similar to IRK: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56370 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 暂无已核实直接文献
At5g01890 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献
At1g12460 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 暂无已核实直接文献
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012152 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12460
ath:AT3G28040
ath:AT3G56370
ath:AT4G28650
ath:AT5G01890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.825
排名 1 · LXL04_012152 · OH-1004
内质网0.088
排名 2 · LXL04_012152 · OH-1004
细胞质0.083
排名 3 · LXL04_012152 · OH-1004
细胞核0.077
排名 4 · LXL04_012152 · OH-1004
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · LXL04_012152 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_2199-239 aa
PF12799.14LRR_4269-301 aa
PF13855.13LRR_8317-374 aa
PF23598.2LRR_14360-571 aa
PF13855.13LRR_8440-495 aa
PF24141.2LRR_ComC547-668 aa
PF13855.13LRR_8558-596 aa
PF23598.2LRR_14558-715 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012152PF08263.18LRRNT_21992394e-1246.9
LXL04_012152PF12799.14LRR_42693011.3e-30105.5
LXL04_012152PF13855.13LRR_83173743.8e-42142.6
LXL04_012152PF23598.2LRR_143605713.4e-2899.1
LXL04_012152PF13855.13LRR_84404953.8e-42142.6
LXL04_012152PF24141.2LRR_ComC5476686e-1040.0
LXL04_012152PF13855.13LRR_85585963.8e-42142.6
LXL04_012152PF23598.2LRR_145587153.4e-2899.1
LXL04_012152PF12799.14LRR_45605941.3e-30105.5
LXL04_012152PF12799.14LRR_45846211.3e-30105.5
LXL04_012152PF13855.13LRR_86026443.8e-42142.6
LXL04_012152PF13855.13LRR_86577163.8e-42142.6
LXL04_012152PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr86011301.9e-42146.1
LXL04_012152PF00069.32Pkinase86110691.6e-38133.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LY03拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK67.629%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LZV7拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC257.585%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LRT1拟南芥Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804043.251%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGE4拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1246034.318%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M0G7拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 132.258%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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