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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G585150
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 150992523-150996546 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3943 bp · TkA02G585150|TK1151|cDNA

CTTCAACTTACGTCTATATTACAACTCAATCCCCTTACCTTTGCTCAGCTTTTACGTATGACCCCATGGCCACCAACTGTTAATGCCTACGTGTAAAACAGCTCACTATTACCCACTGATGTATGGACGCGTGTCCACCCCTAAATATACGGGCCCCACGTCCCTCCCCCTTCTTCAATCTCTTTGCCTAAATAAAGTTATGTATTTTTCCTGTCTGAGAGAATATCAGTGTTTGAGTGAGAAAGAGAAAAACCTAGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2922 bp · TkA02G585150|TK1151|CDS

ATGAGAAAGTTGCTTGGTATCTGTCTGTTTTTGCTAGCGGCTCATGTTATTATTGTGAAATCTTTGAATCCAACTCTAGACGATGATGTGCTGGGCTTGATTGTATTTAAGGCAGACCTGCAAGATCCAGATGGTAAATTGGTTTCCTGGAATGAAGATGATGATAGTCCTTGTAAGTGGAAAGGTGTTAAGTGTAACCCTAGATCTAACAGGGTATCTGACCTTGTTCTCGACGGGTTTGGGCTCTCGGGAAAGATGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

973 aa · TkA02G585150|TK1151|PROTEIN

MRKLLGICLFLLAAHVIIVKSLNPTLDDDVLGLIVFKADLQDPDGKLVSWNEDDDSPCKWKGVKCNPRSNRVSDLVLDGFGLSGKMGRGLMQLTFLTKLSLAKNNLTGSIGVNLAQLVNLRVINLSGNGFSGPVPSNFFEQCGSLRSISLANNKFSGKIPDSLVSCSSLGVLNFSSNQFSGVLPSGIWSLNGLRSLDLSDNILEGEIPKEVEGLYNLREINLSKNQFTGQVPDEIGACALLRSVDLSENSLSGVLPSTLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G585150
TK1151 IDTkA02G585150
OH-1004 IDLXL04_012152
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 67.616
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G585150
位置Chr02:150992523-150996546 (-)
描述Similar to IRK: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56370 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 暂无已核实直接文献
At5g01890 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献
At1g12460 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 暂无已核实直接文献
At1g01540 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012152 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12460
ath:AT3G28040
ath:AT3G56370
ath:AT4G28650
ath:AT5G01890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.866
排名 1 · TkA02G585150 · TK1151
内质网0.089
排名 2 · TkA02G585150 · TK1151
细胞质0.061
排名 3 · TkA02G585150 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA02G585150 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA02G585150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_226-66 aa
PF24758LRR_At5g5637087-154 aa
PF23211LRR_LRWD192-155 aa
PF13855LRR_893-129 aa
PF13516LRR_693-115 aa
PF29594LRR_SKP294-224 aa
PF00560LRR_196-116 aa
PF12799LRR_496-128 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G585150PF08263LRRNT_226662.9e-1247.4
TkA02G585150PF24758LRR_At5g56370871543.1e-0627.7
TkA02G585150PF23211LRR_LRWD1921550.0001822.0
TkA02G585150PF13855LRR_8931291.2e-43147.4
TkA02G585150PF13516LRR_6931157.6e-1554.4
TkA02G585150PF29594LRR_SKP2942241.6e-0525.0
TkA02G585150PF00560LRR_1961162.2e-56176.3
TkA02G585150PF12799LRR_4961282.9e-32110.6
TkA02G585150PF24141LRR_ComC1051848.2e-1142.8
TkA02G585150PF29252LRR_NLRC41091286.76.5
TkA02G585150PF23598LRR_141121973.4e-29102.4
TkA02G585150PF00560LRR_11191382.2e-56176.3
TkA02G585150PF13516LRR_61191317.6e-1554.4
TkA02G585150PF13306LRR_51341771.49.5
TkA02G585150PF00560LRR_11441652.2e-56176.3
TkA02G585150PF13855LRR_81442011.2e-43147.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LY03拟南芥sp|Q9LY03|IRK_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK78.700%Swiss-Prot高置信
Q9LZV7拟南芥sp|Q9LZV7|PXC2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC270.800%Swiss-Prot高置信
Q9LRT1拟南芥sp|Q9LRT1|Y3804_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804044.400%Swiss-Prot低置信
C0LGE4拟南芥sp|C0LGE4|Y1124_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1246043.900%Swiss-Prot低置信
Q3EDL4拟南芥sp|Q3EDL4|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0154038.700%Swiss-Prot低置信

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