基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_009706
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 131783483-131785662
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA958 bp · LXL04_009706|LXL04_009706|OH1004|cDNA
ATGAAGCTACACGTTGAGTATGGTGGAATAAAAAGCGTTCCAAATCAGCCTAACAAAAGTTCCTCACAAAATAAAGCTGCACCTTCAAGCTCAAATGCTCTTGTGCTATCAGGAACCGAGACTTCCAAAAAGGGTGATTTAACAACTACCGCTTCTGCTCAACCAAAGAACCTGAATCTTTCAACTGCAGCCCTTATGGAAAGAATCCCCAGCAGGTGGCCACGTCCTGCATGGCATGCTCCATGGAAGAACTATAGAGT...
CDS
下载 CDS FASTA714 bp · LXL04_009706|LXL04_009706|OH1004|CDS
ATGAAGCTACACGTTGAGTATGGTGGAATAAAAAGCGTTCCAAATCAGCCTAACAAAAGTTCCTCACAAAATAAAGCTGCACCTTCAAGCTCAAATGCTCTTGTGCTATCAGGAACCGAGACTTCCAAAAAGGGTGATTTAACAACTACCGCTTCTGCTCAACCAAAGAACCTGAATCTTTCAACTGCAGCCCTTATGGAAAGAATCCCCAGCAGGTGGCCACGTCCTGCATGGCATGCTCCATGGAAGAACTATAGAGT...
237 aa · LXL04_009706|LXL04_009706|OH1004|PROTEIN
MKLHVEYGGIKSVPNQPNKSSSQNKAAPSSSNALVLSGTETSKKGDLTTTASAQPKNLNLSTAALMERIPSRWPRPAWHAPWKNYRVISGHLGWVRSIAFDPSNQWFCTGLAVSTRHTYMFSAGDDKLVKCWDLEKNKVIRLYHRHLSGVYCLALHPTINVLLTGGRDSVCGGLEAVLDKDENMSIGQRDALLLFRTLCKIMMKLLQRLVFFLSNFYKDFWRVLVTHSPTTSISLTL
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_009706 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_009706 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:131783483-131785662 (+) |
| 描述 | Similar to PRL1: Protein pleiotropic regulatory locus 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程 GO:0006396 RNA processing 生物过程 GO:0009749 response to glucose 生物过程 GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010154 fruit development 生物过程 GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010215 cellulose microfibril organization 生物过程 GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0045292 mRNA cis splicing, via spliceosome 生物过程 GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G16650 ath:AT4G15900 cnb:CNBG1700 cne:CNG03060 spo:3361260 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.639
细胞质0.284
线粒体0.055
细胞膜0.054
内质网0.047
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00400.39WD4083-133 aaPF24814.2WD40_Prp1988-171 aaPF23381.2Beta-prop_IFT122_1st89-166 aaPF25173.2Beta-prop_WDR3_1st109-169 aaPF24807.2WD40_CDC20-Fz109-166 aaPF23414.2Beta-prop_EML_2110-168 aaPF25175.2Beta-prop_WDR5111-169 aaPF25172.2Beta-prop_WDR3_2nd113-170 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_009706 | PF00400.39 | WD40 | 83 | 133 | 2.2e-13 | 50.8 |
| LXL04_009706 | PF24814.2 | WD40_Prp19 | 88 | 171 | 2.5e-08 | 34.0 |
| LXL04_009706 | PF23381.2 | Beta-prop_IFT122_1st | 89 | 166 | 2.4e-07 | 31.1 |
| LXL04_009706 | PF25173.2 | Beta-prop_WDR3_1st | 109 | 169 | 4.3e-09 | 37.0 |
| LXL04_009706 | PF24807.2 | WD40_CDC20-Fz | 109 | 166 | 4.5e-06 | 26.9 |
| LXL04_009706 | PF23414.2 | Beta-prop_EML_2 | 110 | 168 | 1.1e-06 | 29.0 |
| LXL04_009706 | PF25175.2 | Beta-prop_WDR5 | 111 | 169 | 3.9e-10 | 40.2 |
| LXL04_009706 | PF25172.2 | Beta-prop_WDR3_2nd | 113 | 170 | 1.5e-06 | 28.4 |
| LXL04_009706 | PF25174.2 | Beta-prop_THOC3 | 117 | 170 | 2.1e-08 | 34.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。