基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_009592
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 129356032-129357204
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1173 bp · LXL04_009592|LXL04_009592|OH1004|cDNA
ATGTCATATCTTCAAGCTTCTAACTCACAAGATGAATCAATGTTTCAATATCCTTACTATCTTCACCAAGACTCAAACTTCAACCTTCCATCAATTCCAATCATCACATCACAACCCCATCTCCCATATTACCACTGCATCGCCACCATCAAATGCAACAACTCCTATATCTCCTCACTTGCCATTTATGGAAACTCACTATATACCGGATCTTCCAACAAAGAAATCCGTATATGGAAACTAGACACCATAAAATCACA...
CDS
下载 CDS FASTA1173 bp · LXL04_009592|LXL04_009592|OH1004|CDS
ATGTCATATCTTCAAGCTTCTAACTCACAAGATGAATCAATGTTTCAATATCCTTACTATCTTCACCAAGACTCAAACTTCAACCTTCCATCAATTCCAATCATCACATCACAACCCCATCTCCCATATTACCACTGCATCGCCACCATCAAATGCAACAACTCCTATATCTCCTCACTTGCCATTTATGGAAACTCACTATATACCGGATCTTCCAACAAAGAAATCCGTATATGGAAACTAGACACCATAAAATCACA...
390 aa · LXL04_009592|LXL04_009592|OH1004|PROTEIN
MSYLQASNSQDESMFQYPYYLHQDSNFNLPSIPIITSQPHLPYYHCIATIKCNNSYISSLAIYGNSLYTGSSNKEIRIWKLDTIKSQFNQEHQSESIVVVTGEGAIKSLVISSDKIFSAHQDHKIRVWKLEGQDRKFTHVATLPTFGDRALKILTPRNHVQVRRNKTSTWVHHVDTVSGLALSRDGLVIYSVSWDRTLKIWRTSDFKCVESVANAHDDAINTVVVSSNGDVYTGSSDKKIKIWRKSEEKHNHILIATLKK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_009592 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_009592 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:129356032-129357204 (-) |
| 描述 | Similar to JGB: Protein JINGUBANG |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0009846 pollen germination 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0035097 histone methyltransferase complex 细胞组分 GO:0004197 cysteine-type endopeptidase activity 分子功能 GO:0005525 GTP binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ana:all2124 ath:AT2G26490 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.558
细胞质0.362
细胞膜0.086
溶酶体／液泡0.057
内质网0.036
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25171.2Beta-prop_WDR36-Utp21_1st49-289 aaPF25175.2Beta-prop_WDR563-230 aaPF25174.2Beta-prop_THOC363-133 aaPF24817.2WD40_WDHD1_1st64-212 aaPF24807.2WD40_CDC20-Fz93-332 aaPF24782.3WD40_MABP1-WDR62_2nd110-291 aaPF23409.2Beta-prop_EML143-276 aaPF24796.2WDR55164-290 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_009592 | PF25171.2 | Beta-prop_WDR36-Utp21_1st | 49 | 289 | 1.1e-08 | 35.5 |
| LXL04_009592 | PF25175.2 | Beta-prop_WDR5 | 63 | 230 | 2.3e-32 | 113.1 |
| LXL04_009592 | PF25174.2 | Beta-prop_THOC3 | 63 | 133 | 1.5e-25 | 90.5 |
| LXL04_009592 | PF24817.2 | WD40_WDHD1_1st | 64 | 212 | 2.4e-20 | 73.7 |
| LXL04_009592 | PF24807.2 | WD40_CDC20-Fz | 93 | 332 | 5.3e-23 | 82.5 |
| LXL04_009592 | PF24782.3 | WD40_MABP1-WDR62_2nd | 110 | 291 | 1.4e-07 | 31.5 |
| LXL04_009592 | PF23409.2 | Beta-prop_EML | 143 | 276 | 1.5e-16 | 61.4 |
| LXL04_009592 | PF24796.2 | WDR55 | 164 | 290 | 5.3e-17 | 62.5 |
| LXL04_009592 | PF25391.2 | WD40_Gbeta | 166 | 332 | 6.4e-13 | 49.1 |
| LXL04_009592 | PF00400.39 | WD40 | 167 | 201 | 4e-37 | 125.8 |
| LXL04_009592 | PF25173.2 | Beta-prop_WDR3_1st | 172 | 244 | 1.4e-28 | 100.5 |
| LXL04_009592 | PF24817.2 | WD40_WDHD1_1st | 173 | 333 | 2.4e-20 | 73.7 |
| LXL04_009592 | PF23381.2 | Beta-prop_IFT122_1st | 177 | 246 | 8.9e-24 | 85.0 |
| LXL04_009592 | PF25172.2 | Beta-prop_WDR3_2nd | 177 | 293 | 3.3e-23 | 83.1 |
| LXL04_009592 | PF23414.2 | Beta-prop_EML_2 | 178 | 332 | 1.4e-12 | 48.3 |
| LXL04_009592 | PF25171.2 | Beta-prop_WDR36-Utp21_1st | 192 | 332 | 1.1e-08 | 35.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。