同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00418
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 19
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00418当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00418 |
ChrUn:16470376-17433580 | Chr08:30423612-31349625 | + | 19 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 19 · 当前范围 1–19 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkAUNG057610 | LXL04_035839 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkAUNG057900 | LXL04_035845 | JCVI_TKOH_00418 | 98.7 | 83.15 / 100.0 | Complex |
TkAUNG057930 | LXL04_035847 | JCVI_TKOH_00418 | 99.7 | 100.0 / 66.466 | Complex |
TkAUNG057970 | LXL04_035848 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG057980 | LXL04_035850 | JCVI_TKOH_00418 | 99.8 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkAUNG058050 | LXL04_035866 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 90.083 / 32.831 | 待复核 |
TkAUNG058460 | LXL04_035870 | JCVI_TKOH_00418 | 98.8 | 100.0 / 62.403 | Complex |
TkAUNG058560 | LXL04_035870 | JCVI_TKOH_00418 | 97.5 | 100.0 / 62.403 | Complex |
TkAUNG058690 | LXL04_035870 | JCVI_TKOH_00418 | 97.3 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkAUNG058700 | LXL04_035871 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG058780 | LXL04_035876 | JCVI_TKOH_00418 | 87.0 | 85.106 / 82.051 | Complex |
TkAUNG058790 | LXL04_035877 | JCVI_TKOH_00418 | 91.1 | 94.651 / 91.247 | Complex |
TkAUNG058810 | LXL04_035878 | JCVI_TKOH_00418 | 88.9 | 98.71 / 30.237 | Complex |
TkAUNG059330 | LXL04_035880 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 99.381 / 92.775 | Complex |
TkAUNG059710 | LXL04_035882 | JCVI_TKOH_00418 | 85.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkAUNG059720 | LXL04_035883 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkAUNG059730 | LXL04_035884 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 96.947 / 76.97 | Complex |
TkAUNG059740 | LXL04_035885 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 91.667 / 100.0 | Complex |
TkAUNG059790 | LXL04_035886 | JCVI_TKOH_00418 | 100.0 | 100.0 / 89.706 | Complex |