同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00359
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 19
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00359当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00359 |
Chr08:98732794-101131702 | Chr07:99730115-102423712 | mixed | 19 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 19 · 当前范围 1–19 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA08G387220 | LXL04_034477 | JCVI_TKOH_00359 | 98.1 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA08G388570 | LXL04_034470 | JCVI_TKOH_00359 | 97.1 | 65.397 / 75.458 | 待复核 |
TkA08G388930 | LXL04_034467 | JCVI_TKOH_00359 | 86.8 | 46.667 / 12.391 | Complex |
TkA08G389960 | LXL04_034461 | JCVI_TKOH_00359 | 97.9 | 66.901 / 100.0 | 待复核 |
TkA08G390130 | LXL04_034460 | JCVI_TKOH_00359 | 93.3 | 100.0 / 94.471 | Complex |
TkA08G390140 | LXL04_034459 | JCVI_TKOH_00359 | 94.0 | 82.47 / 94.372 | Probable |
TkA08G390150 | LXL04_034458 | JCVI_TKOH_00359 | 98.3 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA08G390610 | LXL04_034457 | JCVI_TKOH_00359 | 97.1 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA08G390690 | LXL04_034456 | JCVI_TKOH_00359 | 97.5 | 99.571 / 90.44 | 待复核 |
TkA08G392370 | LXL04_034453 | JCVI_TKOH_00359 | 100.0 | 97.414 / 91.87 | Complex |
TkA08G392480 | LXL04_034450 | JCVI_TKOH_00359 | 98.3 | 87.358 / 27.245 | 待复核 |
TkA08G392490 | LXL04_034450 | JCVI_TKOH_00359 | 98.0 | 100.0 / 7.748 | 待复核 |
TkA08G393150 | LXL04_034447 | JCVI_TKOH_00359 | 82.1 | 100.0 / 90.604 | 待复核 |
TkA08G393400 | LXL04_034446 | JCVI_TKOH_00359 | 97.4 | 100.0 / 85.789 | Strict |
TkA08G394030 | LXL04_034443 | JCVI_TKOH_00359 | 94.4 | 95.062 / 88.846 | Probable |
TkA08G394830 | LXL04_034429 | JCVI_TKOH_00359 | 95.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA08G394860 | LXL04_034428 | JCVI_TKOH_00359 | 97.6 | 91.367 / 64.467 | Complex |
TkA08G394890 | LXL04_034427 | JCVI_TKOH_00359 | 99.5 | 100.0 / 98.933 | Complex |
TkA08G394930 | LXL04_034425 | JCVI_TKOH_00359 | 94.7 | 100.0 / 100.0 | Probable |