同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00261
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 8
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00261

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00261 Chr06 3094611-3305634 Chr05 126034620-126141898 mixed Medium 8 anchors
Chr06 3094611-3305634 Chr05 126034620-126141898 JCVI_TKOH_00261 · 8 gene pairs TkA06G012150 | LXL04_026417 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012400 | LXL04_026420 | 87.6% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA06G012420 | LXL04_026421 | 99.7% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012430 | LXL04_026422 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012450 | LXL04_026423 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012510 | LXL04_026424 | 99.4% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012670 | LXL04_026426 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_synteny | Strict TkA06G012730 | LXL04_026428 | 94.4% | non_reciprocal_best_hit | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00261 Chr06:3094611-3305634 Chr05:126034620-126141898 mixed 8 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 8 · 当前范围 1–8 · 页码 1/1

TkA06G012150 → LXL04_026417
100.0%
TkA06G012400 → LXL04_026420
87.6%
TkA06G012420 → LXL04_026421
99.7%
TkA06G012430 → LXL04_026422
100.0%
TkA06G012450 → LXL04_026423
100.0%
TkA06G012510 → LXL04_026424
99.4%
TkA06G012670 → LXL04_026426
100.0%
TkA06G012730 → LXL04_026428
94.4%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA06G012150LXL04_026417JCVI_TKOH_00261100.087.908 / 87.908Strict
TkA06G012400LXL04_026420JCVI_TKOH_0026187.6100.0 / 100.0待复核
TkA06G012420LXL04_026421JCVI_TKOH_0026199.7100.0 / 100.0Strict
TkA06G012430LXL04_026422JCVI_TKOH_00261100.099.61 / 99.351Strict
TkA06G012450LXL04_026423JCVI_TKOH_00261100.0100.0 / 100.0Strict
TkA06G012510LXL04_026424JCVI_TKOH_0026199.4100.0 / 100.0Strict
TkA06G012670LXL04_026426JCVI_TKOH_00261100.0100.0 / 100.0Strict
TkA06G012730LXL04_026428JCVI_TKOH_0026194.496.774 / 56.367Complex