同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00162

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 14

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00162

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00162 Chr03 71070665-71281034 Chr06 2917764-3337974 mixed High 14 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00162`	Chr03:71070665-71281034	Chr06:2917764-3337974	mixed	14	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 14 · 当前范围 1–14 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G287930 → LXL04_026803

100.0%

TkA03G287940 → LXL04_026801

98.3%

TkA03G287950 → LXL04_026800

98.8%

TkA03G287960 → LXL04_026798

78.6%

TkA03G287970 → LXL04_026797

98.2%

TkA03G287980 → LXL04_026796

80.0%

TkA03G288090 → LXL04_026795

100.0%

TkA03G288150 → LXL04_026803

65.8%

TkA03G288330 → LXL04_026809

79.2%

TkA03G288570 → LXL04_026793

100.0%

TkA03G288590 → LXL04_026796

48.6%

TkA03G288600 → LXL04_026796

61.8%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G287930`	`LXL04_026803`	`JCVI_TKOH_00162`	100.0	100.0 / 72.477	Complex
`TkA03G287940`	`LXL04_026801`	`JCVI_TKOH_00162`	98.3	97.351 / 81.564	Complex
`TkA03G287950`	`LXL04_026800`	`JCVI_TKOH_00162`	98.8	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G287960`	`LXL04_026798`	`JCVI_TKOH_00162`	78.6	97.03 / 36.607	待复核
`TkA03G287970`	`LXL04_026797`	`JCVI_TKOH_00162`	98.2	100.0 / 94.783	Complex
`TkA03G287980`	`LXL04_026796`	`JCVI_TKOH_00162`	80.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G288090`	`LXL04_026795`	`JCVI_TKOH_00162`	100.0	100.0 / 93.913	Probable
`TkA03G288150`	`LXL04_026803`	`JCVI_TKOH_00162`	65.8	97.241 / 45.566	Complex
`TkA03G288330`	`LXL04_026809`	`JCVI_TKOH_00162`	79.2	96.296 / 35.451	Complex
`TkA03G288570`	`LXL04_026793`	`JCVI_TKOH_00162`	100.0	100.0 / 96.296	Complex
`TkA03G288590`	`LXL04_026796`	`JCVI_TKOH_00162`	48.6	77.419 / 43.636	Complex
`TkA03G288600`	`LXL04_026796`	`JCVI_TKOH_00162`	61.8	89.431 / 33.333	Complex
`TkA03G288960`	`LXL04_026791`	`JCVI_TKOH_00162`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G288970`	`LXL04_026790`	`JCVI_TKOH_00162`	100.0	86.982 / 67.431	Complex