同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00134

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00134

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00134 Chr03 53362537-59232586 Chr02 63284060-70002717 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00134`	Chr03:53362537-59232586	Chr02:63284060-70002717	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G212820 → LXL04_007818

100.0%

TkA03G213240 → LXL04_007821

90.5%

TkA03G216680 → LXL04_007823

100.0%

TkA03G216710 → LXL04_007827

100.0%

TkA03G218280 → LXL04_007831

100.0%

TkA03G219420 → LXL04_007833

98.7%

TkA03G219530 → LXL04_007833

100.0%

TkA03G219980 → LXL04_007836

99.8%

TkA03G220080 → LXL04_007822

82.4%

TkA03G223080 → LXL04_007844

81.4%

TkA03G227230 → LXL04_007851

99.9%

TkA03G227250 → LXL04_007852

99.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G212820`	`LXL04_007818`	`JCVI_TKOH_00134`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G213240`	`LXL04_007821`	`JCVI_TKOH_00134`	90.5	100.0 / 88.732	Probable
`TkA03G216680`	`LXL04_007823`	`JCVI_TKOH_00134`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G216710`	`LXL04_007827`	`JCVI_TKOH_00134`	100.0	100.0 / 56.701	待复核
`TkA03G218280`	`LXL04_007831`	`JCVI_TKOH_00134`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G219420`	`LXL04_007833`	`JCVI_TKOH_00134`	98.7	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G219530`	`LXL04_007833`	`JCVI_TKOH_00134`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G219980`	`LXL04_007836`	`JCVI_TKOH_00134`	99.8	98.78 / 96.429	Strict
`TkA03G220080`	`LXL04_007822`	`JCVI_TKOH_00134`	82.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G223080`	`LXL04_007844`	`JCVI_TKOH_00134`	81.4	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G227230`	`LXL04_007851`	`JCVI_TKOH_00134`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G227250`	`LXL04_007852`	`JCVI_TKOH_00134`	99.0	100.0 / 87.479	Strict
`TkA03G227350`	`LXL04_007856`	`JCVI_TKOH_00134`	99.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G234990`	`LXL04_007872`	`JCVI_TKOH_00134`	93.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA03G235910`	`LXL04_007874`	`JCVI_TKOH_00134`	93.1	99.574 / 64.249	待复核