同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00082
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 18
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00082当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00082 |
Chr02:43322023-44366149 | Chr03:116264397-117565909 | mixed | 18 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA02G169570 | LXL04_016277 | JCVI_TKOH_00082 | 44.3 | 97.418 / 70.266 | Complex |
TkA02G169730 | LXL04_016276 | JCVI_TKOH_00082 | 74.7 | 98.655 / 76.371 | Complex |
TkA02G169750 | LXL04_016274 | JCVI_TKOH_00082 | 97.7 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA02G169870 | LXL04_016277 | JCVI_TKOH_00082 | 80.3 | 99.206 / 60.24 | Complex |
TkA02G169960 | LXL04_016274 | JCVI_TKOH_00082 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA02G170650 | LXL04_016264 | JCVI_TKOH_00082 | 97.7 | 88.776 / 71.02 | Complex |
TkA02G170660 | LXL04_016263 | JCVI_TKOH_00082 | 100.0 | 100.0 / 94.301 | 待复核 |
TkA02G170840 | LXL04_016255 | JCVI_TKOH_00082 | 83.6 | 93.28 / 79.577 | Complex |
TkA02G170850 | LXL04_016261 | JCVI_TKOH_00082 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA02G170880 | LXL04_016260 | JCVI_TKOH_00082 | 89.0 | 96.277 / 54.593 | Complex |
TkA02G170980 | LXL04_016260 | JCVI_TKOH_00082 | 84.6 | 100.0 / 12.651 | Complex |
TkA02G171130 | LXL04_016255 | JCVI_TKOH_00082 | 100.0 | 95.531 / 80.282 | Complex |
TkA02G171170 | LXL04_016255 | JCVI_TKOH_00082 | 77.2 | 96.325 / 79.343 | Complex |
TkA02G171400 | LXL04_016254 | JCVI_TKOH_00082 | 78.6 | 71.852 / 43.46 | 待复核 |
TkA02G171450 | LXL04_016253 | JCVI_TKOH_00082 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G171490 | LXL04_016249 | JCVI_TKOH_00082 | 94.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA02G171510 | LXL04_016246 | JCVI_TKOH_00082 | 81.1 | 100.0 / 76.891 | Complex |
TkA02G171580 | LXL04_016245 | JCVI_TKOH_00082 | 84.0 | 95.238 / 79.681 | Complex |