同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00051

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00051

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00051 Chr01 116394856-117420268 Chr05 74130693-75481983 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00051`	Chr01:116394856-117420268	Chr05:74130693-75481983	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G464520 → LXL04_023915

98.9%

TkA01G465170 → LXL04_023918

85.2%

TkA01G465340 → LXL04_023917

78.9%

TkA01G465840 → LXL04_023918

98.5%

TkA01G465910 → LXL04_023919

98.9%

TkA01G466200 → LXL04_023920

100.0%

TkA01G466210 → LXL04_023921

98.9%

TkA01G466350 → LXL04_023922

80.4%

TkA01G466760 → LXL04_023928

99.1%

TkA01G466880 → LXL04_023931

96.2%

TkA01G467150 → LXL04_023932

97.8%

TkA01G467340 → LXL04_023946

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G464520`	`LXL04_023915`	`JCVI_TKOH_00051`	98.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G465170`	`LXL04_023918`	`JCVI_TKOH_00051`	85.2	99.387 / 45.128	Complex
`TkA01G465340`	`LXL04_023917`	`JCVI_TKOH_00051`	78.9	79.012 / 23.923	Complex
`TkA01G465840`	`LXL04_023918`	`JCVI_TKOH_00051`	98.5	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G465910`	`LXL04_023919`	`JCVI_TKOH_00051`	98.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G466200`	`LXL04_023920`	`JCVI_TKOH_00051`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G466210`	`LXL04_023921`	`JCVI_TKOH_00051`	98.9	100.0 / 95.96	Probable
`TkA01G466350`	`LXL04_023922`	`JCVI_TKOH_00051`	80.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G466760`	`LXL04_023928`	`JCVI_TKOH_00051`	99.1	98.326 / 92.683	Probable
`TkA01G466880`	`LXL04_023931`	`JCVI_TKOH_00051`	96.2	88.889 / 100.0	Complex
`TkA01G467150`	`LXL04_023932`	`JCVI_TKOH_00051`	97.8	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G467340`	`LXL04_023946`	`JCVI_TKOH_00051`	100.0	58.915 / 8.207	待复核
`TkA01G467350`	`LXL04_023946`	`JCVI_TKOH_00051`	67.0	68.033 / 9.071	Complex
`TkA01G467540`	`LXL04_023948`	`JCVI_TKOH_00051`	58.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G468680`	`LXL04_023952`	`JCVI_TKOH_00051`	98.2	100.0 / 100.0	Probable
`TkA01G468960`	`LXL04_023953`	`JCVI_TKOH_00051`	99.5	100.0 / 100.0	Probable